國內外有沒有好的computational neuroscience方向的學校或課題組?

國內外有沒有好的computational neuroscience或類似方向的學校或課題組?求推薦。

本人985本,保送TOP2博,物理學背景,數學物理基礎不錯,有一定編程能力,多次獲得數學建模與數據分析比賽獎項。由於對目前專業(大實驗裝置相關)不感興趣,想退掉後出國去學生物與數學物理交叉學科方向。

感興趣的方向包括不限於計算神經科學,計算生物學,生物數學等,主要希望從事純理論研究,使用數學模型描述生命現象,比如蛋白質摺疊,調控網路,動物行為等。

求推薦國外相關課題組,國內不錯的組也可以。多謝!


謝邀。

大概說一下我對計算神經科學的組的分布了解的情況,希望能對你有所幫助。我關注的組主要都和我自己研究興趣比較接近,所以肯定不完全。

計算神經科學實際上是很寬泛的一個學科。和神經科學多個層次的特性一樣,通過理論/計算模型來研究神經系統也有明顯的在不同層次上的模型。單純的從行為角度出發的Normative Model,例如Reinforcement Learning, Bayesian Statistical Inference等,到試圖理解神經環路層面的Dynamical System Model,都可以是計算神經科學的範疇。通常的組會關注某個特定的方面,但也有在每個層次都有涉獵的組。(最理想的情況當然是能把Normative的模型提出的假設一直聯繫到神經環路/電生理記錄的層次。這樣的研究有一些非常好的例子,但通常都非常困難。)

按照你的背景,可能你會更感興趣神經環路層面上的模型一些,不過我試圖把不同方向的組都列舉出來。

兩個非常好的「完整」(在不同層面上都有工作)的組的例子是:

Cambridge的 Computational and Biological Learning Lab 和 UCL的Gatsby Unit: Gatsby Computational Neuroscience

歐陸的話EPFL 有非常好的 Dynamical System Model 的組:LCN | EPFL 以及 隔壁的ETH: INI Institute of Neuroinformatics,以及 Max Planck Institute for Biological Cybernetics : Homepage

國內可以先考慮吳思老師的組:北京師範大學-IDG/麥戈文腦科學研究院。吳思老師是物理背景,主要做 Dynamical System Model,組裡的氛圍也非常好。

NYU Shanghai 的 Neuroscience 繼承了NYU 的強項,有 Xiaojing Wang 坐鎮,新招的幾個Faculty也都有計算的背景。

美帝就太多啦,列一些想到的。

Stanford: Stanford Center for Mind, Brain and Computation 可以直接參考這個頁面。

UC Berkeley: 視覺有Bruno Olshausen 坐鎮。純計算認知的有Tom Griffiths,是MIT Josh Tenenbaum的學生。然後就是Jack Gallant,當然我個人總覺得他是做應用機器學習的。最近新來了一個AP是Anne Collins,主要做Executive Control和Reinforcement Learning。是Brown的Michael Frank(RL和Executive Control 模型的大牛)的博後。Brown還有Thomas Serre,主要做Computational Visual Neuroscience,是MIT Tomaso Poggio的學生。

UCLA: 有好幾個做環路層面模型的組,可能會比較適合你的興趣:Computational Neuroscience Affinity Group。 可以看一下Tad Blair, Dean Buonomano, 和Mayank Mehta。心理系這邊有Zili Liu, Hongjing Lu 以及 Ladan Shams,不過可能更適合Cognitive / Psych 背景的。

UCSD: 每個方向上都有很好的Faculty。Neuroscience有Terry Sejnowski坐鎮。Cognitive / CS那邊有 Angela Yu 和 Gary Cottrell。旁邊的Salk Institute 也有很好的 Faculty。

CalTech: 原先的CNS應該是最早的幾個計算神經科學的Program之一。但是Christof Koch去了Allen Institute,可以看看Michael Dickinson。Ralph Adolphs, John ODoherty也都是大牛,不過更偏高層的認知(前者是Emotion 和 Social Cognition, 後者是RL 與 Decision Making)。

UW: UW Computational Neuroscience。另外西雅圖也有Allen Institute。其中 Rajesh Rao 和 Adrienne Fairhall 還在 Coursera 上有一門計算神經科學的課程。

UChicago: 有專門的CNS PhD Program。有做視覺認知的Yali Amit,David Freedman有很多建模和電生理的工作。

UT Austin:Center for Perceptual Systems UT College of Liberal Arts:。德州還有Baylor College of Medicine,也有一些做計算的組。

Upenn: 有一個Computational Neuroscience Initiative http://cni.upenn.edu。不同方向都有很好的Faculty。有Joshua Gold是做Decision Making的大牛,Vijay Balasubramanian是物理背景,做Perception的有Nicole Rust (MIT James DiCarlo 的博後), Alan Stocker, 還有David Brainard (Psychtoolbox 是他們組做的哦)。

Princeton: Hopfield在那裡(而且還在發文章!) 他的學生Carlos Brody是做Dynamical System Model和Rodents Behavior的大牛。RL方面有Yael Niv, Nathaniel Daw和Matthew Botvinick(似乎是全職去了DeepMind)。Jonathan Pillow兩年前從UT Austin 跳槽去了 Princeton。

NYU: 做計算的組非常多,並且各個方向都有: NYU/CNS : Faculty。簡單的列一些:Neuroeconomics的作者之一Paul Glimcher,做Perception的Wei Ji Ma,Eero Simoncelli和Michael Landy,以及做fMRI的David Heeger。另外紐約的CSHL(冷泉港)也有幾個很好的計算神經科學的實驗室。

Columbia: 有Larry Abbott在,Theoretical Neuroscience的作者之一(另外一個作者是Peter Dayan,在Gatsby)。 Decision Making則有Michael Shadlen。 可以看一下這個頁面:Center for Theoretical Neuroscience

MIT: Brain Cognitive Science 還有 CSAIL都有相應的組。新成立的 Center for Brain Minds and Machines http://cbmm.mit.edu 也是非常賽艇。

按照題主給出的信息,可以先考慮在北師大或者是上海紐約大學做一段時間,明確一下具體感興趣的方向。另外NYU的CNS有一個新開的Shanghai Track,可以考慮申請。


首先知乎上相關問題特別多,建議你先去北師大腦院吳思老師組了解一下,另外紐約大學上海track也不錯,這都比較方便你先了解這個領域。

第二,計算神經國外神組太多,UCL Gatsby Unit非常強,馬普,美帝就點不過來了。還是建議先確實是不是真愛,要不然很累,到最後發現自己喜歡深度學習圈錢大法


推薦賓大Bassett組,Bassett本人數學物理背景出身,課題組方向也很廣泛,主要研究複雜網路,結合神經影像,基因等。題主可以了解一下


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