linux集群使用命令

存儲NASn文件操作

df -h查看空間使用情況

警惕超大 nohup.out

任務提交

任務提交前

qhost--查看集群負載狀態

qsub / qsub-sge.pl--提交任務

qstat--查看任務狀態

qdel / qmod--任務控制

任務查看

qhost -j---列出所有用戶在每個節點上的任務

qhost -q---列出每個節點上每個隊列的任務數

qhost -u username---列出某個用戶在每個節點上的任務

提交命令

qsub -cwd -q queue.q test.sh

qsub-sge.pl --maxproc 50 --resource vf=5G --queue queue.q test.sh

任務查看2

qstat -u username---查看某個用戶的任務

qstat -u *,---查看所有用戶的任務

qstat –j jobs_ID---查看某個任務的詳細信息

查看.e和.o文件

• .e：錯誤信息

• .o：標準輸出

任務控制

qdel jobID---刪除某個任務

qdel -u username---刪除某個用戶的所有任務

qmod -s jobID--掛起某個任務

qmod -us jobID---繼續運行某個掛起的任務

按任務佔用內存大小選擇相應的隊列

查看隊列 qstat -g c

QUEUE

PE.q--並行

cloud.q--雲平台

general.q--96G節點

middle.q--96G節點

great.q--大內存節點

plus.q--大內存節點

single.q--Trinity組裝

single._p.q---Trinity組裝（佔用內存較大）

TOP監視

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