【地球演義】Single Cell

  相信大家在中學生物課上都有過觀察草履蟲的經歷。看一個個毛茸茸的小細胞在視野里游來游去,可能還用鹽粒刺激它們的逃避反應。課本里把草履蟲和變形蟲歸入原生動物門,作為最原始的動物;而把另一些能進行光合作用的真核單細胞生物歸入「藻類植物」,比如硅藻,甲藻,小球藻等等。

所謂「原生動物」,通體只有一個細胞,這個單細胞能夠完成所有生命活動:運動,消化,呼吸,繁殖。圖片來源自網路。

  不過基因測序結果顯示,所謂的「原生動物」根本不是動物。草履蟲和我們的親緣關係甚至比蘑菇和我們的親緣關係還要遠。而大雜燴一樣的「藻類植物」的身世也逐漸明了。目前學界普遍接受的真核生物域(Eukarya)主要有這幾大單系群:

  傳統的後生動物和真菌構成了後鞭毛生物(Opisthokonts)的主體。沒錯,在這個分類尺度上,我們確實和蘑菇是近親,都是由一種古老的,帶有後鞭毛的單細胞祖先演化而來。

  傳統的植物界分家後,只剩下綠色植物(包括綠藻,輪藻,苔蘚和維管植物),紅藻和灰藻,它們起源自同一吞噬了光合藍菌的真核祖先,構成了泛植物(Archaeplastida)。

  變形蟲自立門戶,和神奇的粘菌一起,構成了變形蟲界(Amoebozoa)。

  一些之前被分入「原生動物」和「藻類植物」的單細胞生物,比如既能光合又能捕食的眼蟲藻,還有寄生性的滴蟲,組成了古蟲界(Excavates)。

  然後,就是近年來的一個熱門:SAR超群(SAR

supergroup)。SAR是三大類群首字母的合稱:異鞭毛類(Stramenopiles),囊泡蟲類(Alveolates)和有孔蟲類(Rhizaria)。異鞭毛類包括曾經歸入植物的褐藻,黃藻,金藻,硅藻等等,其中褐藻獨立演化出結構複雜的大型多細胞種類。囊泡蟲類也是從傳統動植物界中脫離出來的單細胞生物,包括草履蟲(總算找到組織了),瘧原蟲和甲藻等。

  鋪墊了這麼多,接下來就是本回的重點:有孔蟲類了。

真核生物域(Eukarya)的系統發生關係簡圖。除了虛線引出的關係不明的類群外,目前比較清晰的單系群有:SAR超群(SAR supergroup),包括異鞭毛類(Stramenopiles),囊泡蟲類(Alveolates)和有孔蟲(Rhizaria)三大類群。另外還有泛植物(Archaeplastida),古蟲類(Excavates),變形蟲(Amoebozoa)和後鞭毛生物(Opisthokonts)。

  有孔蟲是一大類單細胞生物的統稱,大多分布在海洋底層,也有少數種類營浮游生活。有孔蟲曾經和變形蟲一起,被歸入原生動物門肉足蟲綱。但現在我們知道,「有孔蟲」 ,「變形蟲」和「動物」其實分屬三家,並無關係。和赤條條的變形蟲不同,有孔蟲會給自己穿上鎧甲:它們的細胞質能夠分泌碳酸鈣,二氧化硅或者假幾丁質,形成各種質地的外殼(test)。也有少數有孔蟲不分泌硬質,而是用黏液粘接細沙,構築膠結殼。有孔蟲殼形態複雜,結構精巧,如果不是太小必須用顯微鏡來看,它們真的可以像貝殼一樣被人收藏把玩。

這些美麗的「海螺」其實是有孔蟲殼,它們只有沙粒大小,形狀,色澤,紋理和質地千變萬化。仔細觀察一下,可以分得出哪些是鈣質殼(陶瓷光澤的),哪些是硅質殼(玻璃光澤的)和膠結殼(一堆沙子粘成的)。圖片來源自網路。

有孔蟲殼的真正尺寸,和針鼻對比一下就知道它們有多小。圖片來源見水印。

  有孔蟲的殼上有一個開口(口孔,aperture),是細胞體和外界的通道。有孔蟲的細胞核和重要細胞器在殼內受到嚴密保護,形成細胞內質。稀薄的細胞外質從口孔伸出殼外,延展成細絲狀的偽足(pseudopodium)。偽足的作用是呼吸,運動和捕食。這些細絲會粘住水中的小生物,包裹進細胞中,形成食物泡,然後慢慢消化。

有孔蟲活著的時候,看上去像是一團亂糟糟的線球。細長的偽足從口孔伸出,向四面八方蔓延。這隻有孔蟲抓到了幾個硅藻,正要飽餐一頓。圖片來源自網路。

  有孔蟲不只捕食各種單細胞生物。一些小型的線蟲或者甲殼動物也可能被它們抓住塞進細胞。文獻[1]設計了一項實驗,用剛孵化的鹵蟲(鹹水豐年蝦)幼體餵養漂游生活的有孔蟲Globigerinoides sacculifer。這種有孔蟲體內有共生的單細胞藻類,可以進行光合作用。但結果顯示,如果不投餵食物,只靠光合作用生產有機物,即使環境中有豐富的氮磷元素,有孔蟲也會很快餓瘦變小。

如果食物充足(SWf和NPf組都是兩天投喂一次),有孔蟲會很快長大(雖然也只是微米級的),建造新的房室。如果不餵食,有孔蟲就會越養越抽抽,原有的房室也會破碎脫落(SW和NP組都是不餵食的)。圖片來源自[1],標尺長度200微米。

正在被有孔蟲消化的橈足類。想想這隻甲殼動物也是挺慘的:和同伴一起游著泳,吃著藻球還唱著歌,突然就被一個野細胞給嘬了。圖片來源見水印。

  除了顯微鏡下的微型獵手,有孔蟲家族中還有已知最大的單細胞生物:Xenophyophores。它們棲息在深海底部,用沉積物粘結成殼,最大的直徑可以達到25厘米。在一些區域,比如海溝底部,Xenophyophores的密度可以達到每100平方米2000個以上[2]。它們是深海生態系統的重要組成部分。

Xenophyophores是深海食物鏈的重要環節,可以把稀薄的營養物質匯聚成動物可以利用的大小,多孔的殼也為許多生物提供了棲身之所,比如上圖中的海蛇尾正緊緊抱著一個單細胞。

  有孔蟲的歷史可以追溯到寒武紀以前,在漫長的演化過程中產生過數以萬計的不同種類,各個時期的獨特蟲殼沉落海底,埋入地下,成為判定地層年代的標準化石。

不同地質時代的代表性有孔蟲。時間軸自上至下:石炭-二疊紀(PERMO-CARB.),三疊紀(TRIASSIC),侏羅紀(JURASSIC),白堊紀(CRETACEOUS),古近紀(PALEOGENE),新近紀(NEOGENE),全新世(HOLOCENE)。圖片來源自網路。

  之所以把這一回放到石炭紀篇,是因為這一時期出現了地質學上非常重要的一類有孔蟲:?(Fusulinid)。「?」 (音tíng)是李四光給這類史前有孔蟲取的漢字名。這個字可能不能顯示,是這樣寫的:

  ?也被稱為紡錘蟲,顧名思義,它們的殼中間粗兩頭尖。?類屬於大型的有孔蟲,一些種類的殼長足有1,2厘米。用肉眼也可以清楚地看到了。

大型?類化石。這些石頭粒都曾經是一個個會吃會爬的活細胞。圖片來源自[3]。

一種現代大型有孔蟲Alveolinella quoyii,有著和?類相似的紡錘形殼。?類活著的時候可能就像是這貨的放大版。圖片來源見水印。

  ?類代表著有孔蟲演化史上的第一次高峰。它們的殼有複雜的分層結構。位於殼中心的是最早形成的初房,隨著細胞的生長,新的殼壁圍繞著初房的中軸盤旋生長,形成新的房室。背著這樣沉重的鎧甲,自然沒法漂游,?類主要生活在淺海海底,以各種微小生物為食。而它們自己也是小型的食肉動物的食物,在一些?殼化石上發現了捕食者造成的破損和修復痕迹[4]。

想像圖:正在捕食?的塔利怪物。不知它們一頓能吃幾個細胞。圖片來源見水印。

?殼結構示意圖。細胞核和細胞器就藏在重重包裹之下的房室(chamber)內。?沒有口孔,偽足從最外層的前壁(antetheca)上的小孔中伸出。圖片來源自網路。

一些?殼的軸截面,不同種類區別明顯。?類是石炭繫到二疊系地層的標準化石。圖片來源自[5]。

  ?類在地球上的存在時間並不長,它們在石炭紀中期出現,消失於二疊紀末的超級大滅絕。有孔蟲類也隨之陷入低谷,直到1億年後的中生代晚期才再次繁盛。在白堊紀篇中,還會繼續講述它們的故事。

地球名片

生物分類:真核生物域-SAR超群-有孔蟲界-有孔蟲門-有孔蟲綱-?目

存在時間:石炭紀中期 至 二疊紀末

現存種類:無

化石種類:6000種以上

生活環境:海洋

代表特徵:紡錘狀殼,複雜的隔壁和房室結構

代表種類:各種?

參考文獻:

[1] Haruka Takagi, Katsunori Kimoto, Tetsuichi Fujiki, et al., Effect of nutritional condition on photosymbiotic consortium of cultured Globigerinoides sacculifer (Rhizaria, Foraminifera). Symbiosis, doi.org/10.1007/s13199-

[2] oceanexplorer.noaa.gov/

[3] thefossilforum.com/inde

[4] SCOTT A. HAGEMAN, ROGER L. KAESLER, FUSULINIDS: PREDATION DAMAGE AND REPAIR OF TESTS FROM THE UPPER PENNSYLVANIAN OF KANSAS. Journal of Paleontology, 76(1): 181-184. 2002

[5] Calvin H. Stevens, Forrest G. Poole, Ricardo Amaya-Martínez, Late Paleozoic fusulinids from Sonora, México: Importance for interpretation of depositional settings, biogeography, and paleotectonics. RE VISTA MEXICANA DE CIENCIAS GEOLóGICAS, v. 31, núm. 1, 2014

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