基於Cpf1一次實現多基因編輯的技術
02-01
昨天去大神實驗室網頁(Zhang Lab @ MIT)轉的時候發現還是上次那個樣子沒有一點更新,第一反應就是這不科學啊,Yinqing Li的單神經元轉錄組的文章(Div-Seq)在去年就在Science上出來了,然後就PubMed檢索了一下,發現了這篇文章。說起來也是很簡單,Cpf1不同於Cas9之處就是它自己可以根據需要將crRNA切割並形成有效的複合體(圖1)。也就是說理論上只需
圖1來源:http://www.nature.com/nbt/journal/v35/n1/full/nbt.3737.html將多個crRNA線性排列在一個啟動子之後,就可以實現用一個質粒完成多個基因的編輯了(圖2a)。然後他們就設計了單個crRNA以及不同長度的串聯靶標序列和Cpf1識別序列的組合來檢測其對多基因的編輯效果,結果顯示多個串聯crRNA表達後對每個基因的編輯效率都蠻高(圖2b),隨後在小鼠大腦內實現了三敲之後整篇文章的重點結束。
圖2來源:http://www.nature.com/nbt/journal/v35/n1/full/nbt.3737.html通過這篇文章咱又學習了一點:Cpf1具有多基因編輯的能力。這和之前咱介紹的借用tRNA處理機制實現多基因編輯的方法(戳此查看)相比而言,需要的序列更短了,對於全基因組範圍內高通量基因編輯的實踐意義也是非同小可。為啥?因為需要的crRNA長度更短唄,更容易合成和操作,不同crRNA之間發生重組的概率也得以降低。
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參考文獻:Multiplex gene editing by CRISPR–Cpf1 using a single crRNA array
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