關於ChemDraw的幾個基本技巧

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ChemDraw is a molecule editor first developed in 1985 by David A. Evans and Stewart Rubenstein later by the cheminformatics company CambridgeSoft.

說到繪製化學式和化學反應的工具軟體,ChemDraw算是最常見的一個。因為用起來真得很方便,所以在科學工作者中傳播率很廣,很多學校和組織也會購買ChemDraw的使用許可權。第一次使用ChemDraw的人會覺得好多按鈕、好複雜、這麼多選項到底用哪個,那麼ChemDraw到底有多少個功能按鈕/工具條,看看下面這張截圖,除了模板和一些不重要的小工具條外,這些是所有我們可以用到的功能鍵。

在正常使用ChemDraw的時候,肯定沒必要把這些工具條全部拖拽出來,然後再開始工作,一般保留ChemDraw默認的繪圖、文件編輯、文字編輯功能就可以了,其他工具條可以在軟體抬頭的查看(View)按鈕下查看到,隨用隨點。


幾個技巧

除了尋找工具條外,還有些快捷小功能,能幫我們快速上手ChemDraw,提高工作效率,下面聊到的幾點對CD老手來說絕對是司空見慣,習慣這些小功能,你也一樣能成為ChemDraw的高端玩家。

1,多選取消

ChemDraw給使用者兩種選擇工具,一個是套索(Lasso),一個是矩形選取框(Marquee)。套索功能就是畫個圈圈,把想選擇的符號、鍵價等東西框在一起,這個很簡單;另一種就是矩形選取框,畫個長方形把東西框進去就行了。

使用這兩種選取框就會有個問題會出現,多框了一些東西進來。這個時候按住Shift鍵+滑鼠左鍵就可以取消任何你想取消選擇的內容。

2,平行拖拽

在選取化學結構後,可以隨意進行拖拽。如果需要進行平行或垂直複製拖拽的話,難道還Ctrl+C,Ctrl+V,再平行對齊嗎?自然不是,Shift+Ctrl+滑鼠左鍵,只要你移動就是對正位置的橫向或豎向複製粘貼。

3,清理結構

Clean up structure 算是比較經典的功能,能把手繪的分子結構轉換成標準的書面的分子結構,十分實用。快捷鍵就是Shift+Ctrl+K

4,名字對結構的轉換

寫出化學分子的通用名,ChemDraw自動將其轉換成標準分子式,快捷鍵為Shift+Ctrl+N

舉例如下圖,輸入diclofenac,就會跳出下面的分子式,免去自己繪製的麻煩。

如果你輸入的名字沒有對應的分子式怎麼辦,可以嘗試高級一些地搜索功能:

Find Stucture from Name at ChemACX.com

一般來說,複雜的不常見的分子式都可以通過這個方法一步導入。

5,化學性質分析

Analysis window 和Chemical property window。可以在軟體抬頭的查看(View)菜單中找到。這兩個窗口給出一些基本的化學屬性,比如MW、pKa、MassSpec等等。舉個栗子如下:

6,NMR預測

NMR圖譜預測也是一個比較實用的功能,但是預測圖譜和實際實驗得到的圖譜可能是有差別的,所以NMR預測只能作參考。對於不擅長分析化學的同學應該算是個利器,通過了解預測圖譜,至少我們可以開始看懂NMR信號圖啦!舉個栗子:

7,熱鍵設置

HotKeys就是熱鍵功能,能幫助我們在繪製化學分子式的時候快速添加元素、基團或者化學鍵。在ChemDraw中國的網站上有一個原子熱鍵和化學熱鍵的表格。

[引用於:巧妙使用ChemDraw快捷鍵-ChemDraw中文官網]

總結如下:

除了這些系統內默認的熱鍵外,我們還可以設置自己習慣的熱鍵,這就牽扯到修改ChemDraw的系統文件,在科學網中有一篇關於自定義ChemDraw熱鍵的詳細博客,貼在這裡有興趣可以去參考參考[修改Hotkeys.xml 自定義 ChemDraw 快捷鍵的方法]


ChemDraw看起來複雜,用起來簡單,熟能生巧,願大家早日成為CD高玩,科研順利!文章首發於「BioEngX生化工程實驗室」微信平台,想了解更多,來平台看我們咯~


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