快報——江蘇檢驗檢疫局：南京口岸發現人體新圓環病毒

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原標題是：江蘇檢驗檢疫局：南京口岸發現人體環狀新病毒

　　央廣網南京12月15日消息（記者景明通訊員吳海磊李衛紅）江蘇檢驗檢疫局15日發布消息稱，近日，該局聯合江蘇省衛生計生委在對一例經南京口岸入境既往發熱患者的生物樣本進行病毒宏基因組測序檢測時，發現了一種全新的感染人體的環狀病毒。
　　這位男性患者是一名從新加坡回國的勞務人員，在經南京祿口國際機場入境時，紅外體溫監測儀顯示其體溫超過37℃。南京檢驗檢疫局口岸檢疫人員複測確認該男子處於發熱狀態，立即對其進行了詳細的流行病學調查和醫學排查，並在知情同意後採集了血液、尿液、唾液等生物學樣本。經口岸現場快速篩查和江蘇國際旅行衛生保健中心實驗室病原體檢測，排除了其感染寨卡病毒、黃熱病毒、登革熱病毒、瘧原蟲、西尼羅熱病毒和基孔肯亞熱病毒等多種病原體的可能。
　　近期，江蘇檢驗檢疫局與江蘇省衛生計生委聯合對口岸既往多份發熱患者的生物樣本進行宏基因組測序檢測，在上述患者的生物樣本中發現了一種新型環狀單鏈DNA病毒片段，通過進一步測序、序列組裝、PCR擴增，得到完整的病毒基因組。該病毒基因組全長由3018個核苷酸組成，編碼2個主要蛋白。經與現有基因庫比對，與該病毒最相似的為豬糞相關的環狀病毒-5（PoSCV5），但其核苷酸同源性僅為84%，氨基酸同源性低於50%。經過專家複核，認為這是一種在人體首次檢出的新型環狀單鏈DNA病毒。

　　對於該病毒的致病性，江蘇國際旅行衛生保健中心孫立新博士表示，目前還不能明確該環狀病毒與患者所患疾病的關聯性。病毒結構與致病性不存在特別關係，不能僅從環狀來判斷它的致病性有無及強弱；相關性需要做進一步研究才能確定。
　　目前，江蘇國際旅行衛生保健中心和江蘇省疾病預防控制中心正在對該病毒進行分離培養，以進一步開展其生物學特徵、流行病學特點、可能的致病性等研究，並繼續隨訪該患者及其家屬和相關人員，適時進行詳細的流行病學調查和生物樣本檢測工作。

看到這條新聞第一是感覺好奇怪，因為圓環病毒（Circovirus）【註：新聞報道使用的名稱都不是正確命名】里最耳熟的是豬的圓環病毒，人裡面是從來沒有過的。豬的圓環病毒，比如下圖的PCV-1（porcine circovirus，還有PCV-2），對豬就不致病。但是PCV-2確實養殖業上一大公害，感染的豬可以水平也可以垂直傳播PCV-2。鼻腔，唾液，糞便等等途徑可以排毒，而呼吸道和消化道也都是可行的傳播途徑。但是這些病毒的基因組都比較小，大概在2kbp左右，這次從患者體內分離出來的卻超過3kbp。對了，圓環病毒是基因組最小的病毒之一，只編碼兩個蛋白。直徑僅有14~17nm，正二十面體對稱，並且沒有包膜。所以脂溶劑不能滅活病毒。

圓環病毒之所以叫圓環病毒，還因為它的複製方式比較有意思——滾環複製。圓環病毒基因組是單鏈閉合環狀的DNA，進入細胞以後互補鏈被補上，之後就可以被細胞的轉錄酶翻譯出來上面僅有的兩個蛋白——Rep和Cap，Rep可以在雙鏈DNA上打一個缺口，這樣細胞核里的DNA多聚酶就可以複製基因組，方式就是滾環複製/rolling circle replication。在兩個蛋白的閱讀框之間認為有一個發卡結構，這也是多數新聞報道表示的那樣，基因組上有一個突出來的一個結構，序列主要是AGTATTAC，這也是單鏈DNA複製的起始位點。病毒最後組裝之後會將細胞裂解釋放。

因為剛發現，是不是像SARS一樣會成為新的大規模流行病毒，這應該不可能，可能現在的當務之急是看看這種病毒能不能培養出來，因為發現它是用宏基因組測序得到的，對該病毒的生物學特性了解幾乎沒有，只有拿到活病毒才能開展後續的研究，才能看看這東西是不是對人致病，再表達一下相關抗原，看看人群里是不是抗體陽性，到底是不是普通流行，還是說只是偶然從別的宿主突破限制跳過來的。