[原]R語言工程化實踐:RStudio Server環境快速配置教程
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介紹
RStudio Server 是 RStudio 公司打造的一款基於 Web 的開源編輯器,如果你熟悉 RStudio的桌面版本,那麼使用RStudio Server對你來說基本上沒什麼難度。
在實際的工程中,我們的伺服器大多是基於Linux的,比如常見的 ubuntu、centos 等。這些操作系統有時並不提供圖形化界面,這時候RStudio的伺服器版本就派上用場了。啟動RStudio Server後,進入在瀏覽器中進入某一個頁面後就可以像桌面版一樣使用RStudio編輯器。當R的代碼在伺服器上出現bug了,線上的hotfix是在所難免的,這時候必然會用到 RStudio Server 應個急。
這一次,我們將繼續利用Docker神器,快速初始化RStudio Server環境的配置,並結合Git實現代碼的版本控制。
準備
一個 Ubuntu 伺服器
第一步:安裝 RStudio Server
首先,我們通過docker 安裝一個標準的RStudio Server
docker pull quantumobject/docker-rstudiondocker run -d -p 8787:8787 quantumobject/docker-rstudion
這樣在你的電腦的8787埠就可以訪問到rstudio的登陸界面了。
第二步:初始化 RStudio 賬號
接著,我們需要初始化一個rstudio的賬號
docker exec -it container-id /bin/bashnadduser harryzhu # 設置新用戶名npasswd harryzhu # 設置該用戶的密碼nmkdir /home/harryzhu # 初始化工作空間nchmod -R harryzhu /home/harryzhu # 給工作空間賦權n
第三步:安裝 git
然後,我們進入rstudio的伺服器,我們打算引入git版本控制
sudo apt-get install git-coren
第四步:解決 ssh 的認證問題
使用 git 的過程可能遇到SSL certificate problem。對於ssh的問題,我們可以選擇建立一個ssh認證的key,也可以在git中設置為忽略。
生成一個key:
$ssh-keygen -t rsa nGenerating public/private rsa key pair.nEnter file in which to save the key (/root/.ssh/id_rsa): nCreated directory /root/.ssh.n
連續按下回車,跳過密碼設置
顯示秘鑰信息:sudo cat /root/.ssh/id_rsa.pubn
如果沒有ssh認證的需求,也可以選擇忽略:
git config --global http.sslVerify falsen
第五步:在 RStudio Server 中配置Git
在最上方的菜單欄中可以選擇Project Options。
接著填寫配置。
第六步:克隆 Git 項目到本地
Git 功能已經集成在 RStudio-Server 中了,在新建項目時可以選擇新建一個Version Control 的 Git 項目。
大功告成!
參考資料
docker-rstudio 手冊
張丹老師的 RStudio-Server 配置實戰
Rstudio 官方 git 解決方案
劉坤老師的 Git 中文教程
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