Mac 安裝Circos軟體

系統macOS High Sierra 10.13.1

（一）安裝perl的模塊

這是一個基於Perl的軟體，依賴很多Perl模塊，先安裝好這些模塊。

1. 進入perl：

perl -MCPAN -e shell

2.安裝模塊：

> install Config::General

> install Font:TTF

> install GD

> install List::MoreUtils

> install Math::Round

> install Math::Bezier

> install Math::VecStat

> install Params::Validate

> install Readonly

> install Regexp::Common

> install Set::IntSpan

> install Text::Format

3.查找指定安裝模塊，確定成功安裝以上模塊：

$ perldoc -l List::MoreUtils

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其中GD模塊的安裝非常麻煩，依賴的包和軟體都很多

我選擇安裝一個軟體管理器來安裝這些軟體包：

軟體管理工具brew (http://blog.csdn.net/wx19900503/article/details/52956598):

安裝非常簡單，這一個命令就裝好了: $ruby -e "$(curl -fsSLhttps://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)"

然後安裝以下依賴包：

$ brew install zlib

$ brew install libpng

$ brew install libjpeg

$ brew install truetype

$ brew install libgd

然後這時候安裝GD就能夠成功了，如果還是提示缺少某些依賴模塊，根據報錯提示繼續安裝相應模塊。

如果不想安裝軟體管理器，可以選擇下載文件到本地手動安裝，例：

查看是否安裝：$ pkg-config

顯示「-bash: pkg-config: command not found」說明系統沒有安裝

先去網站下載 http://pkgconfig.freedesktop.org/releases/pkg-config-0.29.2.tar.gz

然後解壓安裝

$tar -xf pkg-config-0.29.2.tar.gz

$cd pkg-config-0.29.2

$./configure --with-internal-glib

$make

$sudo make install

成功安裝pkg-config

但我還是建議使用軟體管理，因為真的會方便很多。

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(二) 安裝Circos

官網下載Circos軟體「http://circos.ca/software/download/circos/」

解壓：$ tar xvfz circos-0.69-6.tar

$ perl bincircos

繼續報錯提示缺少 Perl 模塊：Statistics::Basic, SVG, 按照上面的方法裝好。

再次運行OK了

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