0.前言

　　雖然很早就知道R被微軟收購，也很早知道R在統計分析處理方面很強大，開始一直沒有行動過。。。直到

　　直到12月初在微軟技術大會，看到我軟的工程師演示R的使用，我就震驚了，然後最近在網上到處了解和爬一些R的資料，看著看著就入迷了，這就是個大寶庫了，以前怎麼沒發現，看來還是太狹隘了。直到前幾天我看到這個Awesome R文檔，我就靜不下來了，對比了目前自己的工作和以後的方向，非常適合我。所以毫不猶豫的把這個文檔漢化了，所以大家一起享受吧。

說明：本文已經提交到github，地址：asxinyu/awesome-R ，由於個人知識和能力限制，部分組件特別是機器學習方面比較專業的術語無法翻譯，如果有懂的朋友可以留言或者在github直接修改。一起完善。

這裡有很多非常不錯的R包和工具. 該想法來自於awesome-machine-learning.

這裡是包的導航清單，看起來更方便 Awesome R - Find Great R Packages

　　通過這些翻譯了解這些工具包，以後幹活也就方便多了。不過翻譯這個東西的確要靠耐心，翻譯，編輯花費了至少一周的空餘時間。　　

　　在編輯本文的過程中，驚喜的發現原來 伯樂在線 也在翻譯Awesome系列的其他資源：地址在github：

1.jobbole/awesome-dotnet-cn

2.jobbole/awesome-java-cnJava資源大全中文版（Awesome最新版） - 張果 - 博客園

3.https://github.com/jobbole/awesome-javascript-cn

JavaScript資源大全中文版（Awesome最新版） - 張果 - 博客園

1.集成開發環境

• RStudio - 一個非常強大高效的圖形界面開發環境，可以在Windows, Mac, 和Linux運行. 官網：Home
• Emacs + ESS - ESS是一個emacs文本編輯器的一個統計分析的插件. 官網：Emacs Speaks Statistics
• Sublime Text + R-Box - 一個在Sublime 2/3中使用R語言編程的插件. 官網：randy3k/R-Box
• TextMate + r.tmblundle - TextMate 1/2的插件. 官網：textmate/r.tmbundle
• StatET - 一個基於Eclipse的R語言IDE. 官網：WalWare - Homepage
• Revolution R Enterprise - 專註於大數據,大規模多處理器的功能,可以對學術用戶免費提供和商業使用. 官網：R Server Overview-R Data Analysis
• R Commander - 一個包括基本圖形用戶界面的R包. 官網：R Commander
• IRkernel - Jupyter的R語言內核. 官網：IRkernel/IRkernel
• Deducer - 一個菜單驅動的數據分析的GUI工具,類似電子表格數據編輯器. 官網：Deducer: A GUI for R
• Radiant - 一個使用R語言，獨立的基於瀏覽器介面的業務分析平台,基於Shiny. 官網：Radiant - Business analytics using R and Shiny
• Vim-R - Vim中R語言插件. 官網：vim-scripts/Vim-R-plugin
• Nvim-R - Neovim中R語言插件. 官網：jalvesaq/Nvim-R
• JASP - 一個完整的貝葉斯和概念論相關方法的R包,和使用SPSS非常相似。 官網：A Fresh Way to Do Statistics
• Bio7 - 一個包括創建,科學圖像分析和統計分析的IDE. 官網：http://www.bio7.org/
• RTVS - Visual Studio中R開發工具. 官網：Welcome to R Tools for Visual Studio Preview!

2.語法

• magrittr - 一個R語言高效的管道操作包. 官網：tidyverse/magrittr
• pipeR - 多泛型管道的實現. 官網：renkun-ken/pipeR
• lambda.r - R語言中函數式編程和簡單的模式匹配. 官網：zatonovo/lambda.r
• purrr - 一個高級函數編程語言包. 官網：hadley/purrr

3.數據操作

• dplyr - 快速數據操作和資料庫查詢. 官網：hadley/dplyr
• data.table - 使用短小靈活的語法操作數據. 官網：Rdatatable/data.table
• reshape2 - 靈活的數據排列,聚合處理. 官網：hadley/reshape
• readr - 一個快速簡單的讀取表格數據到R中的包. 官網：tidyverse/readr
• haven - 對導入SPSS,STATA和SAS的文件進行改進. 官網：tidyverse/haven
• tidyr - 方便對數據進行整理、傳播和收集. 官網：tidyverse/tidyr
• broom - 將統計分析對象轉換成整齊的數據框(一種數據組織和呈現的方式). 官網：tidyverse/broom
• rlist - 一個操作非規範化數據的工具箱. 官網：renkun-ken/rlist
• jsonlite - 一個快速解析JSON文件的包. 官網：jeroenooms/jsonlite
• ff - 設計用來存儲大型數據集的數據結構. 官網：ff
• lubridate - 一組日期和時間函數. 官網：CRAN - Package lubridate
• stringi - 基於ICU的字元串處理方案. 官網：stringi: THE string processing package for R
• stringr - 基於stringi之上的對字元串處理API. 官網：tidyverse/stringr
• bigmemory - 提供共享內存和內存映射矩陣,同時也包提供額外的工具,包括線性模型.(biglm) 和隨機森林 (bigrf). 官網：CRAN - Package bigmemory
• fuzzyjoin - 使用不精確匹配的方式連接表數據. 官網：dgrtwo/fuzzyjoin
• tidyverse - 簡單從tidyverse下載和安裝包. 官網：tidyverse/tidyverse

4.圖形顯示

• ggplot2 - 強大的繪圖統計和計算圖形系統的實現.強烈推薦. 官網：tidyverse/ggplot2
• ggfortify -一個ggplot2(流行的統計軟體包)統一的介面(使用一行代碼即可). 官網：sinhrks/ggfortify
• ggrepel - 排除重疊的文本標籤. 官網：slowkow/ggrepel
• ggalt - ggplot2額外的坐標系統,幾何和統計. 官網：hrbrmstr/ggalt
• ggtree - 可視化和注釋的系統樹. 官網：GuangchuangYu/ggtree
• ggplot2 Extensions - ggplot2擴展顯示例子. 官網：ggplot2 extensions
• lattice - 一個強大優雅的高級數據可視化系統. 官網：trellis graphics for R
• corrplot - 圖形顯示相關矩陣或一般矩陣。它還包含一些矩陣重新排序演算法. 官網：taiyun/corrplot
• rgl - R中3D可視化系統. 官網：CRAN - Package rgl
• Cairo - 一個使用cairo組件創建高質量顯示輸出的R圖形包. 官網：CRAN - Package Cairo
• extrafont - 在R中圖像中使用字體的工具. 官網：wch/extrafont
• showtext - 讓R圖形設備顯示文本的時候使用系統字體. 官網：yixuan/showtext
• animation - 一個使用 ImageMagick在R中產生動畫圖形的工具. 官網：animation by yihui
• gganimate - 用ggplot2創建簡單的動畫. 官網：dgrtwo/gganimate
• misc3d - 強大的3D繪圖工具. 官網：CRAN - Package misc3d
• xkcd - 在圖表中使用xkcd風格. 官網：CRAN - Package xkcd
• imager - 一個基於CImg庫的圖像處理包. 官網：http://dahtah.github.io/imager/

5.HTML部件

• d3heatmap - 使用D3繪製互動的熱圖. 官網：rstudio/d3heatmap
• DataTables - 將R矩陣或數據框作為交互的HTML表. 官網：DT: An R interface to the DataTables library
• DiagrammeR - 在R中創建JS圖表和流程圖. 官網：rich-iannone/DiagrammeR
• dygraphs - 在R中繪製時間序列數據圖形. 官網：rstudio/dygraphs
• formattable - 可格式化的數據結構. 官網：formattable by renkun-ken
• ggvis - R中互動式的圖形處理語法. 官網：rstudio/ggvis
• Leaflet - 一個非常流行的互動式地圖JavaScript組件. 官網：Leaflet for R - Introduction
• MetricsGraphics - 可以輕鬆創建D3散點圖、折線圖和直方圖. 官網：http://hrbrmstr.github.io/metricsgraphics/
• networkD3 - D3 JavaScriptR網路圖. 官網：http://christophergandrud.github.io/networkD3/
• scatterD3 - D3 互動散點圖. 官網：juba/scatterD3
• plotly - 使用plot.ly進行互動式ggplot2和Shiny繪圖. 官網：ropensci/plotly
• rCharts - 互動式JS繪圖. 官網：ramnathv/rCharts
• rbokeh - Bokeh的R介面. 官網：rbokeh
• threejs - 互動式3D散點圖和地球儀. 官網：bwlewis/rthreejs
• timevis - 創建完全互動式的時間軸可視化圖形. 官網：daattali/timevis
• visNetwork - 使用vis.js類庫進行網路可視化. 官網：datastorm-open/visNetwork

6.復用組件研究

• knitr - R中簡單的動態報表生成工具. 官網：knitr: Elegant, flexible and fast dynamic report generation with R
• xtable - 將表格導出到LaTeX或者HTML. 官網：CRAN - Package xtable
• rapport - 一個R模版系統. 官網：rapport: an R templating system
• rmarkdown - R動態文檔工具. 官網：R Markdown
• slidify - 創建和發布漂亮的html5展示效果. 官網：ramnathv/slidify
• Sweave - 使用R創建LaTeX報表的R包. 官網：LMU - Prof. Friedrich Leisch
• texreg - 在LaTex和HTML中格式化統計模型. 官網：texreg: Conversion of Statistical Model Output in R to LaTeX and HTML Tables
• checkpoint - 從檢查點快照伺服器安裝包. 官網：RevolutionAnalytics/checkpoint
• brew - 報告模板的生成框架.可以和knitr合併. 官網：CRAN - Package brew
• ReporteRs - 一個生成微軟Word, PowerPoint和HTML報表的R包. 官網：Microsoft Word and PowerPoint Documents Generation ? ReporteRs package
• bookdown - 使用R Markdown編寫書籍. 官網：bookdown: Easy Book Publishing with R Markdown
• ezknitr - 避免使用"knitr"帶來的工作目錄的痛苦. 官網：ropensci/ezknitr

7.Web技術和服務

• Web Technologies List - 關於如何使用R和網路的相關信息. 官網：ropensci/webservices
• shiny - 使用R創建簡單的Web交互應用. 官網：rstudio/shiny
• RCurl - 常規的網路客戶端介面 (HTTP/FTP/...) . 官網：CRAN - Package RCurl
• httr - 使用更加友好的RCurl封裝. 官網：hadley/httr
• httpuv - HTTP和WebSocket服務程序. 官網：rstudio/httpuv
• XML - R中生成和解析XML的工具. 官網：CRAN - Package XML
• rvest - 簡單的web信息抓取,使用CSSSelect 和 XPath 語法. 官網：hadley/rvest
• OpenCPU - HTTP API. 官網：Producing and Reproducing Results
• Rfacebook - Facebook API. 官網：pablobarbera/Rfacebook
• RSiteCatalyst - Adobe 分析服務的R語言客戶端. 官網：randyzwitch/RSiteCatalyst
• plumber - 一個將現有的R代碼轉換為API的包. 官網：trestletech/plumber

8.並行計算

• parallel - R語言高性能的並行計算平台. multicore and snow. 官網：CRAN Task View: High-Performance and Parallel Computing with R
• Rmpi - Rmpi對MPI APIS提供了一個包裝過的介面,它也提供一個互動式的R環境. 官網：CRAN - Package Rmpi
• foreach - 使用並行來執行循環. 官網：CRAN - Package foreach
• SparkR - R for Spark. 官網：amplab-extras/SparkR-pkg
• DistributedR - 一個來自惠普Vertica Analytics團隊的可伸縮的高性能平台. 官網：vertica/DistributedR
• ddR - 提供分散式數據結構,簡化了R中的分散式計算. 官網：vertica/ddR
• sparklyr - 來自RStudio的Spark介面. 官網：http://spark.rstudio.com/

9.高性能

• Rcpp - Rcpp在R中提供了一個高效的API,使得函數更快執行. 官網：Seamless R and C++ Integration
• Rcpp11 - Rcpp11完全重新設計,以C++11為目標. 官網：Rcpp11/Rcpp11
• compiler - 使用JIT提高R代碼的速度. 官網：http://spark.rstudio.com/

10.語言API

• rJava - R語言對JAVE介面. 官網：CRAN - Package rJava
• jvmr - 集成了R, Java, and Scala. 官網：cran/jvmr
• rJython - R語言對Python/Jython的介面. 官網：CRAN - Package rJython
• rPython - 允許R調用Python. 官網：CRAN - Package rPython
• runr - 在R中運行Julia和Bash. 官網：yihui/runr
• RJulia - R中調用Julia. 官網：armgong/rjulia
• RinRuby - 一個Ruby庫,整合了R用Ruby解釋器. 官網：https://sites.google.com/a/ddahl.org/rinruby-users/
• R.matlab - 讀寫mat文件,將R和Matlab連接到一起. 官網：CRAN - Package R.matlab
• RcppOctave -Octave and Matlab的介面. 官網：renozao/RcppOctave
• RSPerl - 雙向介面,R中調用Perl和在Perl中調用R. 官網：http://www.omegahat.org/RSPerl/
• V8 - 嵌入JavaScript引擎. 官網：jeroenooms/V8
• htmlwidgets - R中把JavaScript數據可視化的最好方法. 官網：htmlwidgets for R
• rpy2 - Python對R的介面. 官網：http://rpy.sourceforge.net/

11.資料庫管理

• RODBC - R中ODBC資料庫範圍. 官網：CRAN - Package RODBC
• DBI - 在R和資料庫管理系統之間定義一個公共的介面. 官網：rstats-db/DBI
• elastic - Elasticsearch HTTP API的包裝器. 官網：ropensci/elastic
• mongolite - R中Mongo客戶端. 官網：jeroenooms/mongolite
• RMySQL - R語言的MySQL資料庫介面. 官網：CRAN - Package RMySQL
• ROracle - R中Oracle資料庫的介面. 官網：CRAN - Package ROracle
• RPostgreSQL - R語言的PostgreSQL資料庫系統介面. 官網：https://code.google.com/p/rpostgresql/
• RSQLite - R語言SQLite資料庫介面. 官網：CRAN - Package RSQLite
• RJDBC - 通過JDBC介面訪問資料庫. 官網：http://cran.r-project.org/web/packages/RJDBC/
• rmongodb - R中MongoDB驅動. 官網：dselivanov/rmongodb
• rredis - R中Redis驅動. 官網：CRAN - Package rredis
• RCassandra -Apache Cassanda直接介面(不是JAVA)，提供了最多的基本功能. 官網：CRAN - Package RCassandra
• RHive - 通過Apache Hive的R擴展促進分散式計算. 官網：nexr/RHive
• RNeo4j - Neo4j圖形資料庫驅動. 官網：nicolewhite/RNeo4j

12.機器學習

• AnomalyDetection - 來自Twitter的AnomalyDetection R包. 官網：twitter/AnomalyDetection
• ahaz - 半參數添加風險回歸的正則化. 官網：CRAN - Package ahaz
• arules - 挖掘關聯規則和頻繁項集. 官網：CRAN - Package arules
• bigrf - 大隨機森林:大型數據集的分類和回歸森林. 官網：CRAN - Package bigrf
• bigRR - 廣義回歸(特殊是在p >> n情況下). 官網：CRAN - Package bigRR
• bmrm - 風險最小化方案的正規化方法. 官網：CRAN - Package bmrm
• Boruta - 所有相關的特徵選擇演算法的一個封裝 . 官網：CRAN - Package Boruta
• BreakoutDetection - Breakout Detection via Robust E-Statistics from Twitter.[暫時不明真相] 官網：twitter/BreakoutDetection
• bst - 梯度增加. 官網：CRAN - Package bst
• CausalImpact - 利用貝葉斯時間序列結構模型進行因果推斷. 官網：google/CausalImpact
• C50 - C5.0決策樹和基於規則的模型. 官網：CRAN - Package C50
• caret - 分類和回歸訓練. 官網：CRAN - Package caret
• Clever Algorithms For Machine Learning
• CORElearn - 分類、回歸、特徵評價和排序. 官網：CRAN - Package CORElearn
• CoxBoost - Cox models by likelihood based boosting for a single survival endpoint or competing risks. 官網：CRAN - Package CoxBoost
• Cubist - 規則和基於實例的回歸建模. 官網：CRAN - Package Cubist
• e1071 - Misc統計函數 (e1071),主要功能有類別分析、傅里葉變換,模糊聚類,支持向量機,最短路徑計算,樸素貝葉斯分類器等等. 官網：CRAN - Package e1071
• earth - 多元自適應回歸模型. 官網：CRAN - Package earth
• elasticnet - 稀疏估計和稀疏主成分分析. 官網：CRAN - Package elasticnet
• ElemStatLearn - 書籍"The Elements of Statistical Learning, Data Mining, Inference, and Prediction"中的數據集,函數和例子. 官網：CRAN - Package ElemStatLearn
• evtree - 全局最優樹的進化學習. 官網：CRAN - Package evtree
• forecast - 使用ARIMA, ETS, STLM, TBATS,和神經網路進行時間序列預測. 官網：CRAN - Package forecast
• forecastHybrid - 使用"forecast"包對ARIMA, ETS, STLM, TBATS,和神經網路模型進行交叉檢驗. 官網：CRAN - Package forecastHybrid
• FSelector - 一個基於subset-search或特性排名方法的特徵選擇框架. 官網：CRAN - Package FSelector
• frbs - 使用模糊規則系統處理分類和回歸的任務. 官網：CRAN - Package frbs
• GAMBoost -　　基於廣義線性和加法模型. 官網：CRAN - Package GAMBoost
• gamboostLSS - GAMLSS方法的改善. 官網：CRAN - Package gamboostLSS
• gbm - 改善廣義線性模型. 官網：CRAN - Package gbm
• glmnet - Lasso 和 elastic-net正規化廣義線性模型. 官網：CRAN - Package glmnet
• glmpath - L1 Regularization Path for Generalized Linear Models and Cox Proportional Hazards Model. 官網：CRAN - Package glmpath
• GMMBoost - 廣義混合模型. 官網：CRAN - Package GMMBoost
• grplasso - Fitting user specified models with Group Lasso penalty. 官網：CRAN - Package grplasso
• grpreg - Regularization paths for regression models with grouped covariates. 官網：CRAN - Package grpreg
• h2o - Deeplearning, Random forests, GBM, KMeans, PCA, GLM. 官網：CRAN - Package h2o
• hda - 異方差判別分析. 官網：CRAN - Package hda
• ipred - 預測器改進. 官網：CRAN - Package ipred
• kernlab - kernlab: 基於內核學習的機器實驗室. 官網：CRAN - Package kernlab
• klaR - 分類和可視化. 官網：CRAN - Package klaR
• kohonen - 監督和非監督自組織映射. 官網：CRAN - Package kohonen
• lars - Least Angle Regression, Lasso and Forward Stagewise. 官網：CRAN - Package lars
• lasso2 - L1 constrained estimation aka 『lasso』. 官網：CRAN - Package lasso2
• LiblineaR - 基於C/C++庫的線性預測模型. 官網：CRAN - Package LiblineaR
• lme4 - Mixed-effects models. 官網：lme4/lme4
• LogicReg - 邏輯回歸模型. 官網：CRAN - Package LogicReg
• maptree - 映射、修剪和圖形樹模型. 官網：CRAN - Package maptree
• mboost - Model-Based Boosting. 官網：CRAN - Package mboost
• Machine Learning For Hackers
• mvpart - Multivariate partitioning. 官網：CRAN - Package mvpart
• MXNet - MXNet brings flexible and efficient GPU computing and state-of-art deep learning to R. 官網：dmlc/mxnet
• ncvreg - Regularization paths for SCAD- and MCP-penalized regression models. 官網：CRAN - Package ncvreg
• nnet - eed-forward Neural Networks and Multinomial Log-Linear Models. 官網：CRAN - Package nnet
• oblique.tree - Oblique Trees for Classification Data. 官網：CRAN - Package oblique.tree
• pamr - Pam: 小矩陣預測分析. 官網：CRAN - Package pamr
• party - A Laboratory for Recursive Partytioning. 官網：CRAN - Package party
• partykit - A Toolkit for Recursive Partytioning. 官網：CRAN - Package partykit
• penalized - L1 (lasso and fused lasso) and L2 (ridge) penalized estimation in GLMs and in the Cox model. 官網：CRAN - Package penalized
• penalizedLDA - Penalized classification using Fisher"s linear discriminant. 官網：CRAN - Package penalizedLDA
• penalizedSVM - 使用懲罰函數的特徵選擇支持向量機. 官網：CRAN - Package penalizedSVM
• quantregForest - quantregForest: Quantile Regression Forests. 官網：CRAN - Package quantregForest
• randomForest - 隨機森林: Breiman and Cutler"s random forests for classification and regression. 官網：CRAN - Package randomForest
• randomForestSRC - randomForestSRC: Random Forests for Survival, Regression and Classification (RF-SRC). 官網：CRAN - Package randomForestSRC
• rattle - 圖形界面式的數據挖掘工具. 官網：CRAN - Package rattle
• rda - Shrunken Centroids Regularized Discriminant Analysis. 官網：CRAN - Package rda
• rdetools - Relevant Dimension Estimation (RDE) in Feature Spaces. 官網：CRAN - Package rdetools
• REEMtree - Regression Trees with Random Effects for Longitudinal (Panel) Data. 官網：CRAN - Package REEMtree
• relaxo - Relaxed Lasso. 官網：CRAN - Package relaxo
• rgenoud - R version of GENetic Optimization Using Derivatives. 官網：CRAN - Package rgenoud
• rgp - R基因編程框架. 官網：CRAN - Package rgp
• Rmalschains - 使用本地文化基因演算法進行連續問題優化.[這裡翻譯不準]. Search Chains (MA-LS-Chains) in R. 官網：CRAN - Package Rmalschains
• rminer - 在分類和回歸問題中簡單的使用數據挖掘方法(如神經網路和支持向量機). 官網：CRAN - Package rminer
• ROCR - 可視化評分分類器的性能. 官網：CRAN - Package ROCR
• RoughSets - 使用粗糙集和模糊粗糙集理論進行數據分析. 官網：CRAN - Package RoughSets
• rpart - Recursive Partitioning and Regression Trees. 官網：CRAN - Package rpart
• RPMM - Recursively Partitioned Mixture Model. 官網：CRAN - Package RPMM
• RSNNS - Neural Networks in R using the Stuttgart Neural Network Simulator (SNNS). 官網：CRAN - Package RSNNS
• Rsomoclu - Parallel implementation of self-organizing maps. 官網：CRAN - Package Rsomoclu
• RWeka - Weka的R介面(Weka是基於JAVA環境下開源的機器學習以及數據挖掘軟體). 官網：CRAN - Package RWeka
• RXshrink - RXshrink: Maximum Likelihood Shrinkage via Generalized Ridge or Least Angle Regression. 官網：CRAN - Package RXshrink
• sda - Shrinkage Discriminant Analysis and CAT Score Variable Selection. 官網：CRAN - Package sda
• SDDA - Stepwise Diagonal Discriminant Analysis. 官網：CRAN - Package SDDA
• SuperLearner and subsemble - Multi-algorithm ensemble learning packages. 官網：ecpolley/SuperLearner
• svmpath - svmpath: the SVM Path algorithm. 官網：CRAN - Package svmpath
• tgp - Bayesian treed Gaussian process models. 官網：CRAN - Package tgp
• tree - 分類和回歸樹. 官網：CRAN - Package tree
• varSelRF - 使用隨機森林進行變數選擇. 官網：CRAN - Package varSelRF
• xgboost - eXtreme Gradient Boosting Tree model, well known for its speed and performance. 官網：tqchen/xgboost

13.自然語言處理

• text2vec - 一個快速文本挖掘框架。 Fast Text Mining Framework for Vectorization and Word Embeddings. 官網：dselivanov/text2vec
• tm - 一個全面的文本挖掘框架. 官網：CRAN - Package tm
• openNLP - Apache OpenNLP工具介面. 官網：CRAN - Package openNLP
• koRpus - 一個文本分析的R包. 官網：CRAN - Package koRpus
• zipfR - 詞頻分布統計模型. 官網：CRAN - Package zipfR
• NLP - 基本自然語言處理功能. 官網：CRAN - Package NLP
• LDAvis - 主題模型的互動式可視化. 官網：cpsievert/LDAvis
• topicmodels - Topic modeling interface to the C code developed by by David M. Blei for Topic Modeling (Latent Dirichlet Allocation (LDA), and Correlated Topics Models (CTM)). 官網：CRAN - Package topicmodels
• syuzhet - Extracts sentiment from text using three different sentiment dictionaries. 官網：CRAN - Package syuzhet
• SnowballC - Snowball stemmers based on the C libstemmer UTF-8 library. 官網：CRAN - Package SnowballC
• quanteda - 文本數據的定量分析. 官網：kbenoit/quanteda
• Topic Models Resources - 主題模型的學習和R相關資源. 官網：trinker/topicmodels_learning
• NLP for - NLP related resources in R. @Chinese. 官網：BZRLC/R-notes

14.貝葉斯

• coda - 輸出MCMC(馬爾可夫鏈蒙特卡爾理論)的分析和診斷信息. 官網：CRAN - Package coda
• mcmc - 馬爾可夫鏈蒙特卡爾理論(MCMC). 官網：CRAN - Package mcmc
• MCMCpack - 馬爾可夫鏈蒙特卡爾理論 (MCMC). 官網：MCMCpack
• R2WinBUGS - 在在R/S-PLUS中打開WinBUGS 和 OpenBUGS. 官網：CRAN - Package R2WinBUGS
• BRugs - OpenBUGS MCMC 軟體的R介面. 官網：CRAN - Package BRugs
• rjags - JAGS MCMC組件的R介面. 官網：CRAN - Package rjags
• rstan - Stan MCMC軟體的R介面. 官網：RStan

15.最優化

• minqa - Derivative-free optimization algorithms by quadratic approximation. 官網：CRAN - Package minqa
• nloptr - 一個免費開源的非線性最優化程序包. 官網：CRAN - Package nloptr
• lpSolve - Lp_solve解決線性和整形問題的R介面. 官網：CRAN - Package lpSolve

16.金融

• quantmod - 定量金融模型和交易框架. 官網：Quantitative Financial Modelling Framework
• TTR - 技術交易規相關的數據和功能函數. 官網：CRAN - Package TTR
• PerformanceAnalytics - 計量經濟學性能和風險分析工具. 官網：CRAN - Package PerformanceAnalytics
• zoo - S3 Infrastructure for Regular and Irregular Time Series. 官網：CRAN - Package zoo
• xts - 可擴展的時間序列. 官網：CRAN - Package xts
• tseries - 金融時間序列分析和計算. 官網：CRAN - Package tseries
• fAssets - 金融資產分析和建模. 官網：CRAN - Package fAssets

17.生物信息學

• Bioconductor - 用於分析和理解高通量基因組數據的工具. 官網：Bioconductor - Home
• genetics - 處理基因數據的R包. 官網：CRAN - Package genetics
• gap - 一個人口家庭遺傳數據分析的綜合工具. 官網：CRAN - Package gap
• ape - 分子系統學和進化分析. 官網：CRAN - Package ape
• pheatmap - 一個使用簡單的熱圖工具. 官網：CRAN - Package pheatmap
• ddpcr - Analysis and visualization of Droplet Digital PCR data. 官網：daattali/ddpcr

18.網路分析

• Network Analysis List - 網路分析相關資源. 官網：briatte/awesome-network-analysis
• igraph - 一個網路分析工具集合. 官網：igraph R package
• network - 一個操作數據關係的基本工具. 官網：CRAN - Package network
• sna - 基本的網路測量和可視化工具. 官網：CRAN - Package sna
• netdiffuseR - 網路擴散的分析工具. 官網：USCCANA/netdiffuseR
• networkDynamic - 支持動態和時序網路. 官網：CRAN - Package networkDynamic
• ndtv - 構建動畫的可視化動態網路工具,支持多種數據格式. 官網：CRAN - Package ndtv
• statnet - 大量網路數據的分析,模擬和可視化工具. 官網：Statnet
• ergm - 指數隨機圖模型. 官網：CRAN - Package ergm
• latentnet - Latent position and cluster models for network objects. 官網：CRAN - Package latentnet
• tnet - Network measures for weighted, two-mode and longitudinal networks. 官網：CRAN - Package tnet
• rgexf - 從R導出網路對象到GEXF, for manipulation with network software like Gephi or Sigma. 官網：gvegayon / rgexf / wiki / Home
• visNetwork - 使用vis.js類庫進行網路可視化. 官網：datastorm-open/visNetwork

19.R 開發

• Package Development List - 提高整體開發能力的包. 官網：ropensci/PackageDevelopment
• devtools - 然R開發人員的生活變得更簡單的工具. 官網：hadley/devtools
• testthat - 一個R包測試工具. 官網：hadley/testthat
• R6 - simpler, faster, lighter-weight alternative to R"s built-in classes. 官網：wch/R6
• pryr - Make it easier to understand what"s going on in R. 官網：hadley/pryr
• roxygen - 在函數定義中描述說明. 官網：klutometis/roxygen
• lineprof - R中在線分析結果可視化. 官網：hadley/lineprof
• packrat - 讓R項目更加簡單,便攜和可重構的工具. 官網：rstudio/packrat
• installr - R中按照軟體的相關函數(Windows平台). 官網：talgalili/installr
• import - R的導入機制. 官網：smbache/import
• modules - 另外一個R模塊系統(Python風格). 官網：klmr/modules
• Rocker - R configurations for Docker. 官網：rocker-org
• RStudio Addins - RStudio插件列表. 官網：daattali/addinslist
• drat - Creation and use of R repositories on 使用R在GitHub或其他平台創建和使用倉儲. 官網：eddelbuettel/drat
• covr - Test coverage for your R package and (optionally) upload the results to coveralls or codecov. 官網：jimhester/covr
• lintr - R靜態代碼分析. 官網：jimhester/lintr
• staticdocs - 為一個R包生成靜態html文檔. 官網：hadley/pkgdown

20.日誌

• futile.logger - R中類似log4j的日誌記錄包. 官網：zatonovo/futile.logger
• log4r - R中的log4j介面. 官網：johnmyleswhite/log4r
• logging - 一個在R中實現log4j的日誌處理包. 官網：CRAN - Package logging

21.數據包

• engsoccerdata - 英國和歐洲聯賽結果數據(1871-2016年). 官網：jalapic/engsoccerdata
• gapminder - 從Gapminder摘錄的數據集. 官網：jennybc/gapminder

22.其他工具

• git2r - 在R中使用git. 官網：ropensci/git2r

23.其他編譯器

• CXXR - Refactorising R into C++. 官網：CXXR: Refactorising R into C++
• fastR - FastR is an implementation of the R Language in Java atop Truffle and Graal. 官網：allr / FastR / wiki / Home
• incanter - Clojure-based, R-like statistical computing and graphics environment for the JVM with Lisp spirit. 官網：incanter/incanter
• pqR - 一個更快的R實現. 官網：pqR - a pretty quick version of R
• renjin - 一個基於JVM的R編譯器. 官網：Renjin.org | The JVM-based interpreter for the R language for statistical computing
• rho - Refactor the interpreter of the R language into a fully-compatible, efficient, VM for R. 官網：rho-devel/rho
• riposte - 一個R快速編譯和JIT工具. 官網：jtalbot/riposte
• RRO - R革命性開放平台(Microsoft R Open). 官網：Microsoft R Open: The Enhanced R Distribution
• TERR - R的TIBCO企業運行環境. 官網：TIBCO Spotfire - TIBCO Enterprise Runtime for R (TERR)

24.R學習

• swirl - 一個在R控制台中互動式學習指南. 官網：swirl: Learn R, in R.
• DataScienceR - 一個數據科學,神經網路,和機器學習的指南. 官網：ujjwalkarn/DataScienceR

25.資源

25.1 網站

• R-project - R 項目的官方網站. 官網：The R Project for Statistical Computing
• R Bloggers - R語言的一個綜合性博客網站. 官網：R-bloggers
• DataCamp - 在線學習R數據分析. 官網：Learn R, Python & Data Science Online | DataCamp
• Quick-R - 一個非常好的快速參考手冊. 官網：Quick-R: Home Page
• Advanced R - 書籍高級R編程的在線版. 官網：Welcome · Advanced R.
• Efficient R Programming - 書籍"Efficient R Programming"的在線主頁. 官網：Efficient R programming
• CRAN Task Views - CRAN包的任務列表. 官網：CRAN Task Views
• The R Programming Wikibook - 一個R協作手冊 官網：Wikibooks, open books for an open world
• R-users - R語言的求職板塊. 官網：Jobs for R-users
• R Cookbook - 一個R問答網站,由[R Graphics Cookbook]進行支持(http://shop.oreilly.com/product/0636920023135.do). 官網：Cookbook for R
• tryR - 快速開始使用R. 官網：Try R
• RDocumentation - 使用RDocumentation搜索所有的CRAN, Bioconductor, Github包和文檔. 官網：RDocumentation

25.2 書籍

• R Books List - R相關書籍清單. 官網：RomanTsegelskyi/rbooks
• The Art of R Programming - 一個很好的資源,可以系統地學習基礎類型的對象,控制語句,變數的範圍,以及調試等. 官網：The Art of R Programming
• Free Books - CRAN貢獻的多種語言文檔. Contributed Documentation in many languages. 官網：Contributed Documentation
• R Cookbook - 快速簡單的介紹R及相關常見的統計任務. 官網：R Cookbook
• Johns Hopkins編寫的數據科學專業的一部分教程:
  • Exploratory Data Analysis with R - 基本的各種數據分析技能. * R Programming for Data Science - 依賴於R的一些高級數據分析. * Report Writing for Data Science in R - R語言的報表生成和可重用組件研究. 官網：Exploratory Data Analysis… by Roger D. Peng [PDF/iPad/Kindle]
• R Packages - 一個用R包編寫的書籍 (有論文和網站2鍾格式). 官網：Welcome · R packages
• R in Action - 一本旨在幫助所有級別R用戶的書籍. 官網：R in Action, Second Edition
• Use R! - This series of inexpensive and focused books from Springer publish shorter books aimed at practitioners. Books can discuss the use of R in a particular subject area, such as Bayesian networks, ggplot2 and Rcpp. 官網：Use R! (Titles in this series)
• R for SAS and SPSS users - 一個對已經熟悉SAS和SPASS用戶的資源庫. 官網：Free Version
• An Introduction to R - 一個很好的介紹R的文章,也涵蓋了一些高級主題. 官網：https://cran.r-project.org/doc/manuals/R-intro.pdf
• Introduction to Statistical Learning with Application in R - A simplified and "operational" version of The Elements of Statistical Learning. Free softcopy provided by its authors. 官網：Introduction to Statistical Learning
• The R Inferno - Patrick Burns gives insight into R"s ins and outs along with its quirks! 官網：http://www.burns-stat.com/pages/Tutor/R_inferno.pdf
• R for Data Science - Free book from RStudio developers with emphasis on data science workflow. 官網：R for Data Science

25.3 博客

• Not So Standard Deviations - 數據科學博客
  • @Roger Peng and @Hilary Parker.
• R World News - R行業的社區新聞,可以讓你與時俱進.
  • @Bob Rudis and @Jay Jacobs.
• The R-Podcast - 使用R的一些實踐建議.
  • @Eric Nantz.
• R Talk - 關於R語言和統計軟體的新聞和討論.
  • @Oliver Keyes, @Jasmine Dumas, @Ted Hart and @Mikhail Popov.

25.4 參考文獻

• R Reference Card 2.0 - Material from R for Beginners by permission of Emmanuel Paradis (Version 2 by Matt Baggott). 官網：http://cran.r-project.org/doc/contrib/Baggott-refcard-v2.pdf
• Regression Analysis Refcard - R Reference Card for Regression Analysis. 官網：http://cran.r-project.org/doc/contrib/Ricci-refcard-regression.pdf
• Reference Card for ESS - Reference Card for ESS. 官網：http://ess.r-project.org/refcard.pdf
• R Markdown Cheat sheet - Quick reference guide for writing reports with R Markdown. 官網：http://shiny.rstudio.com/images/rm-cheatsheet.pdf.zip
• Shiny Cheat sheet - Quick reference guide for building Shiny apps. 官網：http://shiny.rstudio.com/images/cheatsheet.pdf.zip
• ggplot2 Cheat sheet - Quick reference guide for data visualisation with ggplot2. 官網：https://www.rstudio.com/wp-content/uploads/2015/08/ggplot2-cheatsheet.pdf
• devtools Cheat sheet - Quick reference guide to package development in R. 官網：https://www.rstudio.com/wp-content/uploads/2015/06/devtools-cheatsheet.pdf

25.5 網路課程

• The Analytics Edge - Hands-on introduction to data analysis with R from MITx. 官網：The Analytics Edge
• Johns Hopkins University Data Science Specialization - 9 courses including: Introduction to R, literate analysis tools, Shiny and some more. 官網：Specialization | Coursera
• HarvardX Biomedical Data Science - Introduction to R for the Life Sciences. 官網：HarvardX Biomedical Data Science Open Online Training Curriculum launches on January 19
• Explore Statistics with R - Covers introduction, data handling and statistical analysis in R. 官網：Explore Statistics with R

25.6 列表

• Books - R書籍清單. 官網：RomanTsegelskyi/rbooks
• DataScienceR - R數據科學、神經網路和機器學習的指南清單. 官網：ujjwalkarn/DataScienceR
• ggplot2 Extensions - ggplot2擴展案例. 官網：ggplot2 extensions
• Natural Language Processing - R. @Chinese中NLP 相關資源. 官網：BZRLC/R-notes
• Network Analysis - 網路分析相關資源. 官網：briatte/awesome-network-analysis
• Open Data - 使用R獲取,轉換,操作,創建和貢獻數據. 官網：ropensci/opendata
• Posts - 創建R博客或者文章. 官網：qinwf/awesome-R
• Package Development - 提高包開發的資源工具. 官網：ropensci/PackageDevelopment
• R Project Conferences - 使用R的相關信息,DSC會議. 官網：R: Conferences
• RStartHere - 一些非常有用的R包指南. 官網：rstudio/RStartHere
• RStudio Addins - RStudio插件清單. 官網：daattali/addinslist
• Topic Models - 主題模型的學習和R相關資源. 官網：trinker/topicmodels_learning
• Web Technologies - 如何使用R和萬維網的信息. 官網：ropensci/webservices

大家也可以加小編微信：tswenqu，進R語言中文社區 交流群。

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