我做的pcr跑完膠完全沒條帶怎麼回事?就好像沒加DNA似的。?
從基因組P還是從質粒P?marker是啥?目標片段多大?
上面有一條暗暗的窄帶,是模板還是產物?如果是(切開的)質粒或者固定長度的大模板好理解,如果是基因組模板未免也太窄了,看你把marker的條帶跑的這麼寫意不感覺那麼整齊的窄帶是基因組dna。 PS,看上去marker那條帶也有這個,是不是啥玩意兒污染了?
引物是固定的還是簡併的?根據保守序列、二聚體什麼的專門設計過么?是不是說確定可以p出來?模板有沒有測過序?把兩邊引物往外擴一段、改改反應參數試試?
模板dna質量很好么,沒有碎掉、沒有離子污染什麼的?引物質量沒問題?酶、緩衝液、水、etc都是好的?PCR儀是好的?放倆陽性對照看看啊
少年想解決問題要多給點信息啊……
從最底部的引物條帶看確實是加了引物的,但是要麼反應掛了,要麼產物就是上面沒跑下來的那個超大片段。
首先普及一下實驗常規,PCR圖譜應該標好上樣樣品名、marker大小、目標條帶大小、日期,操作者名字。其次如果沒有你要的產物,檢查模板、引物和酶有沒有用對,最後調整條件重試
(這還是前不久的一道面試題.....)
除marker之外亮的部分是引物二聚體。
作為昔日的pcr磚工,按我的經驗來看,這種豪無smear的條帶應該是啥都沒p出來。下面你需要檢查幾個部分:1. 酶和buffer是否過期or配套(聽起來很荒謬,但這是很多人都會犯的錯誤)2. 檢查引物與模版是否正確……(嗯、根本問題不能錯,尤其是右端引物在設計時有沒有反向互補,推薦傻瓜軟體snapgene)3. 檢查模板量是否過量,模板過多會導致無法p出來,建議將模板進行10的梯度稀釋,做梯度pcr
3. 檢查引物的結構,ncbi中有相關的工具,雖然我的經驗是不論結構多差只要和模板有10bp以上的重複序列都能p出來。4. 上述都確定完沒問題依然p不出來請降低退火溫度,嘗試進行溫度梯度pcr。5. 加少量鎂離子6. 最後不行的話……把taq換成primestar吧……高保真酶,貴,好用。taq酶p不出來的很多奇怪的序列primestar一上就靈……最後,你加反應體系的時候攪勻離心了么……暴力實驗的時候我會拿槍頭進去攪攪…防止酶和dntp分布不均……
這個問題為什麼會出現在我的時間線上呢?我為什麼會來回答呢?我明明已經……引物問題,我遇到過類似情況
前面部分都是用的新訂引物,最後面七個重複試驗仍舊用的舊引物 與前面七個DNA模板一樣,其他條件也一樣。 結果差異很大
加好陽性對照。瀉藥。
引物不合適,酶不合適,條件不合適,從圖上我只能感覺模板量太多了,我能看到基因組條帶,當然我不知道你上樣了多少。同學,提問時你應該自己先排除一些問題再來問,比如你確定條件沒錯操作沒問題啥的。
這麼明顯的引物二聚體,說明酶 dNTP buffer等都加了,這些一般沒什麼問題,排除。做pcr加的也就這麼幾個東西,很明顯是引物不特異或者模板不對。解決方法1.換模板重p。模板要麼加錯了,濃度太高或者太低了,要麼降解了2.針對你的模板重新設計引物,最好設計簡併引物
瀉藥
從膠孔的樣子來看,你的電泳液很臟啊。估計跑了很多膠了。也沒洗乾淨。所以marker孔都有污染帶。
有引物二聚體,說明引物加了。
模板加沒加,酶加沒加。乃至溫度對不對,無法判斷。老兄,這裡是學生物的。不是學推理的。給的信息太少。別人咋給你判斷?你要看看
你pcr之前是不是沒 離 心哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈(苦笑)抖機靈(其實也不算)完畢
1.看看模板引物加沒加錯,酶以及體系其他成分加沒加錯2.都沒問題的話嘗試降低退火溫度。實在p不出來降到55℃到50℃都可以試試補血藥…… 陽性呢? 水對照呢?看到了疑似引物二聚體的東西 也看到了疑似模板的東西 但是 不確定
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