表觀遺傳學如何入門?
01-24
本人科研小白一枚,方向是表觀遺傳學的,請大神推薦幾本書為科研做準備
從你的實驗室開始。
你的老闆是誰?現在在做哪個方向?發過哪些文章?
師兄師姐們是如何畢業的?畢業論文寫的是什麼東西?
你們實驗室能夠提供怎樣的硬體環境?使用著哪些實驗技術?你會不會做?懂不懂原理?能不能根據自己的實驗需要調整protocol?
你們實驗室研究著哪個科學問題?你知不知道這個問題是誰提出的,如何提出的;是誰推進的,如何推進的;最終期望能夠得到怎樣的成果?如果你正準備開始研究生階段,強烈建議從你的實驗室開始。生命科學博大精深,就表觀遺傳學來說,你是做組蛋白的,做DNA的,還是做RNA的?
如果做組蛋白,你是做variant還是PTM?
要是做variant,你是做H3還是H2A或是H2B的?要是做PTM,你是做甲基化、乙醯化還是磷酸化?要是做甲基化,你是做甲基化酶、去甲基化酶還是甲基的reader?你要是做甲基化酶,你是做結構還是做功能?你要是做功能,你是在tissue culture上做做,還是得上轉基因動物?
......你看,可以有很多方向,你需要掌握的知識可以天差地別。所以,最最實際的也最最有用的,就是從你的實驗室開始。樓上說的那些課本,等你在研究生階段干出成績,打算在科研生涯上再進一步,期望自己能在表觀領域開疆拓土時再看,私以為也是來得急的。雖然epigenetics不是我的研究方向,但也略有涉及。知道一本比較經典的教材是表觀遺傳學 (豆瓣) 中文版是NIBS朱冰譯的,還是挺靠譜的。另外這個領域更新太快,比如前段時間聽報告就是有個組通過C. elegans生殖系細胞的發育證明epigenetic marks是可以隔代遺傳的。所以也建議樓主多讀讀近期的文獻和綜述。
NCBI搜索老闆的名字或者找到他的主頁/簡歷,publications,把他發表的相關的文章都讀一遍,足夠了。
推薦書必須是 Allis 的 Epigrnetics,最近出第二版了。
表觀已經不熱,施揚,張毅之類的業界大牛都在轉方向,做這行的表示,冷暖自知。如果真的有興趣還是可以入門。主要包含:1.DNA甲基化;2.組蛋白甲基化和乙醯化;3.非編碼RNA。RNA我不熟,前面兩類,輸入dna methylation, histone methylation, histone acetylation,文獻選nature review或annual review系列,讀兩篇綜述就可以。經典教材Epigenetics那本書值得一讀,知識太老,趕不上時代。
另:DNA/histone也有其他修飾,太複雜看起來反而不易,了解基礎修飾的相關酶和生物學功能就行了
表觀遺傳學相對來說比較新,沒有像其它二級學科那樣有非常經典的教材,除了C.D.Allis那本表觀遺傳學之外,蔡祿的表觀遺傳學前沿可以作為科普/入門/綱要來看吧。。。雖然叫作前沿但是現在看來好像已經沒有那麼前沿了囧,覺得也還是多看文獻和綜述為好。
我覺得還是直接刷文獻,讀文獻遇到問題,再回頭看書比較好
先從「表觀」兩個字或者這個詞入門。先從「epi」這個前綴入門。
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