如何建立管理文獻的總體框架和思路？

01-23

本人正在讀博，第一年，平常閱讀文獻都是下載下來用PDF閱讀器直接看，直接注釋，然後按照興趣點將這些文獻分類。但是感覺這樣做容易亂，而且不夠連貫。有時候讀一篇文獻，想看它的參考文獻，看了參考文獻又想看參考文獻的參考文獻，一層套一層，很容易亂掉。有同學向我推薦Mendeley，感覺還行吧，但是用它來整理文獻，建立一個一個的虛擬文件夾，而我的電腦硬碟里的文獻可能實際上是全亂的。並且在Mendeley裡面做批註，對原文件是無效的，這也讓我完全無法接受，萬一我要考文獻給同學，他不能在我的批註上繼續。這種虛假得整理，讓我我受不了。不知道各位前輩是如何對待這個問題的，有沒有什麼好的建議。

其實看完你的描述，我首先想到的不是文獻管理類的軟體，我覺得你需要的不是大量文獻的積累，而是對這些文獻閱讀時產生的想法的積累和交流。畢竟，在學校的環境下，有很多資料庫可以很方便的使用，獲取文獻很方便，本地大量地存儲文獻顯得有些冗餘。

那麼，你是不是可以嘗試Onenote、Evernote之類的筆記產品或是思維導圖類的產品，這些軟體相比起文獻管理軟體要成熟得多，各種分享功能也做的很到位。如果同學間能夠統一使用同一款軟體，那麼交流分享想法（而不是文件）是非常方便的（在我們公司內部就實現了這一點，我們基本棄用Outlook，而且實現了團隊層面的知識庫建設，長期看來可以沉澱很多行業知識和個人見解。這些見解如果分散在郵件、文件中的話，重複利用的可能性就會很低）。

對於思維導圖類的軟體，我也不是很精通，你可以研究研究。開源、簡潔的Freemind好像很受推崇：

當然，文獻管理軟體也是可以使用的，推薦Readcube（老版介紹視頻ReadCube功能簡介）：界面美觀，對PDF導入支持較好（應該可以在軟體內對PDF進行批註，分享給朋友，解決你提到的Mendeley的問題），標註功能做的很棒，還有relevant paper recommendation的功能，目前內嵌了Pubmed, Google Schoolar檢索。

有問題歡迎交流~

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2015-11-23更新（Readcube）相關：

由於中國區訪問問題，我前幾天安裝Readcube後一直登陸不了。今天登陸成功了，發現確實可以解決既有PDF導入的問題：

登陸後界面（除了PDF外，也支持其他文獻管理軟體文件的導入，換平台就方便多了）：

第一次導入涉及文獻元數據的抽取（作者信息、期刊信息等），所以速度較慢。我測試了69篇中英混雜文獻的導入，耗時5分鐘。導入後發現中文文獻抽取元數據不成功（這也是情理之中的，中文文獻很多都存在排版混亂的問題，且有很多電子版也是掃描生成的，元數據當然難以抽取）
當然，除了導入之外，也支持手動添加reference

檢索模塊（目前支持Google Scholar和Pubmed，檢索功能較為簡單，但是出奇的是，Scholar訪問居然沒有問題）：

檢索速度也是挺快的，也支持題錄直接導入本地文獻庫：

還有一個不錯的功能，Readcube會根據你自建的文獻資料庫推薦相關文獻，這個功能很不錯的，推薦的文獻很契合我的興趣點——許多出版商（例如國內的萬方、CNIKI）也有這個服務，但是做的很雞肋

Readcube也開發了IOS、Android應用，各平台之間的同步很便捷；廣泛地與國外大的出版商合作，提供在線PDF全文預覽及Readcube導入——這個功能很適合在學校的環境下的工作流：檢索，跳轉到出版商閱讀全文，標註，存儲。https://www.readcube.com/publishers

總結，由於Readcube在國內沒有伺服器（我諮詢了這個問題，正在等他們的回復），且許多分享功能都是基於牆外的服務（這一點對於國內用戶來說很遺憾），所以使用起來還是會有不流暢的情況。但是我覺得這點不妨礙他作為目前做的最好、最漂亮的文獻管理工具這個基本事實。而且，他們的開發活動很活躍，這點在文獻管理軟體這個小小的領域中是難能可貴的。期待他們能關注大陸市場~

說說我的經驗吧。謝謝邀請

讀博士開始，老師大概介紹方向後，給了一篇文章，然後自己就從這篇文章開始，首先是把這篇文章看懂用了大兩個月的時間，這裡的看懂是完全理解，加上完全實現。這其中為了看懂這篇文章又查閱其中的參考文獻。那段時間，基本對其中的文章作者，發表時間，雜誌都可以默寫下來。後來自己的研究節奏一直是這樣，精讀一篇文章，然後查閱很多很多參考文獻，陸陸續續看了有快上千篇文章.全部保存在自己的根據自己理解對文章分類後的文件夾里，也算對自己的研究稍微入門了。

所以說一說自己的體會吧，讀博士對文獻的態度一定要記住不在於多，而在於精讀重要的經典文獻，徹底弄懂，後續的參考文獻自然會記到腦子裡。試想放在腦子裡的東西怎麼也比放在冷冰冰的文件夾，軟體里好的多。很多人會提到使用文獻管理軟體。自己試過很多，感覺這些軟體最大的作用就是寫畢業論文的時候，或者寫參考文獻幾百篇的長文章會好用。平時科研還是自己用心整理，對研究慢慢入門後，也會對自己的研究進行更好的分類，就放到電腦一個一個的文件夾里就行了。由於自己整理的，也都看過找起來是很快的。很有人情味。軟體整理出來後總是懶得看不如自己直接打開自己做的文件夾直接。

當然，在自己開始寫論文的時候，把自己論文中所有的素材放到一起，參考文獻整理到endnote的一個庫里，方便寫論文用，還是很實用的。但是從看論文，以後查閱的角度，按照自己習慣的方式是最好的。