文獻管理器有什麼軟體比較好，它們是怎樣使用的？

01-13

最好能支持下工科領域的需求，工科會經常讀掃描格式的老文獻，這方面很多新興的管理軟體（如readcube）支持很一般

離線軟體方面，我很早的時候，用過一段時間Reference Manager，當時我試用過Note Express，後來轉到EndNote之後，就一直用到現在了。其實我很早就聽說過EndNote，之所以一直用Reference Manager這麼長時間，其實是懶得搬數據。所以我原本認為，其實用戶轉換文獻管理軟體的門檻是很高的，新軟體很難搶到老用戶。事實是不是這樣呢，我沒有統計數據，但我就很不明白為什麼這麼多人喜歡用Mendeley（Zotero我也用過，覺得不錯，但是自從我瀏覽器改用Chrome之後我就不用Zotero了。我對它的喜愛不至於像某些人那樣「裝Firefox完全只是為了用Zotero）。

我還用過CiteULike、Connotea等網站，也都很快就棄用了。最近ACS出了一個ChemWorx，我也試用了一下。還有ReadCube我也用過。由於上述說的軟體我很久都沒用了，現在的情況是如何，我也不大清楚。

先講所有這些應用最大的問題。EndNote的老用戶往往已經把文獻分成不同的Group了。所以，除非有軟體能夠直接破解EndNote的enl文件（以及同目錄下的.data文件夾），實現「完美導入」，否則只要換軟體，原來的Group分組信息就一定要丟失。我從讀博士開始到現在，幾乎所有文獻，都放在一個庫中，叫做gelation.enl（凝膠化）。它包括了流變學方面和膠體物理方面的所有文獻。我也分了很多Group。不把這個庫全導出來的話，我是沒辦法真正更換一個新的文獻管理軟體來工作的。但是，估計破解EndNote的文件格式是違法的，所以那些遵紀守法的老外是不會動這個心思，所以Group信息是永遠無法順利地導出的了。當然，有一些權宜的辦法。例如對於Mendeley，可以先在EndNote里給同一個Group的文獻添加相同的label（可以一次批量操作），再導出成bib-tex格式。導入到Mendeley時，label項會導入成tag，然後在Mendeley中按tag來fil-ter就可以看到原本屬於同一個Group的文獻了，這時再把這些文獻搬到Mendeley相應的folder里。這個工作量至少是還可以接受的。

第二個也很普遍問題就是字元。這也應該是EndNote本身的錯。EndNote導出的文本格式沒有辦法處理帶重音符號的拉丁字母（很多人名會有，而且我還有一些文獻是德語的），在EndNote軟體里是正常顯示的，但導出成文本文件之後就會變成一個中文亂碼。這個中文亂碼就會被導入到任何其他文獻管理軟體中。

第三個問題就是排序。除了Reference Manager、EndNote和NoteExpress（印象中）之外，其他的管理軟體的排序功能都很局限。可能是因為我學過一點資料庫原理，我明白無論界面多麼傻瓜，文獻管理軟體其實都是一個資料庫。一條文獻包含這麼多的屬性，都是可以用來排序的，可以先按屬性一升序、再按屬性二降序、再按屬性三升序……可是，除這三個軟體之外的其他軟體，最多只支持一按一個屬性排序，而且只能在年份、作者、題目等屬性中選擇。

我在EndNote里是會使用Label項來進行一些標記。最常見的方式是標記了筆記本的頁碼。由於我閱讀文獻會有記筆記的習慣，在筆記本上會有頁碼。因此，一個文獻記錄，如果label上有個數字，就說明這個文獻我看過，當時記過筆記，可以翻開筆記的相應頁碼來快速回顧，就不用重新看全文了；如果label上是空的，就說明我沒有認真閱讀過。所以，如果先對Label排個序，所有沒記過筆記的文獻就會全部集中在一起；再按年份排個序，這些沒記過筆記的文獻就會按年份來排序，我可以按此順序一篇一篇地閱讀和記筆記。

再有，由於我從讀博開始的近三千篇文獻都放在一個庫中。如果我在閱讀文獻的時候，看到一篇被引文獻我也需要，首先就要判斷我是不是已經有這篇文獻了，因為這麼多篇文獻我腦子是記不得某一篇我是否已經有了的。這時我就要在EndNote里，先後按期刊名、卷和頁來排序，這樣我一拉scroll bar就很快能夠找到相同期刊相同卷的地方，有沒有這一頁就一目了然了。

總之，我會經常善用屬性排序（而不是search）來查找定位，這也許是資料庫的思維習慣使然。在添加條目操作時就具有一個杜絕重複和冗餘的機制，而不是等產生了冗餘之後再查重，這一原則可能也來自於資料庫原理。因此對那些光有個search功能但排序功能很弱的文獻管理軟體我都覺得不適應。

有的文獻資料庫，文獻多起來就反應慢，這是資料庫引擎比較低級的反映，這些都比不上EndNote。

接下來就是關於PDF文件的管理問題。我一直都很不明白為什麼這麼多人會青睞這一功能。稍微有點常識的人就會知道這一功能是超出目前技術水平的，是絕對做不好的。首先，PDF文件有兩種情況，一種情況就是裡面的文字和圖象都是基於元數據重新渲染的，另一種情況就是完全是未進行OCR的圖象。要從PDF文件中識別出年份作者標題等信息，就需要PDF文件是前一種情況，能從中讀出文字信息。而我這個人是喜歡看上世紀中葉的文獻的，這些PDF都是影印版或者不良OCR版。再加上，這樣的過刊很多時候網路資料庫沒有全文全限，我都是通過中科院文獻互助系統從別的圖書館影印回來的，連字都是歪的，很難指往有什麼OCR能把這些字識別好。光這一條滿足不了就基本沒戲了。我的庫可能有一小半都是這種情況。ReadCube的設計似乎是要讓用戶完全依賴於從PDF識別來導入信息的。它的PDF導入功能確實比我想像中的要出色（主要是它充份利用了PubMed和Google Scholar的api，只要能從PDF中識別出任何最少的足夠信息就直接可以在PubMed或Google Scholar上獲得其他信息），但也難免有很多無法識別的PDF。ReadCube對這些PDF的處理方式是：仍然要用戶從PubMed或Google Scholar上找到相應的條目來應用到PDF上，不允許自己輸入！問題是有很多PDF，我自己在瀏覽器上Google Scholar是能查得到條目的，但是在ReadCube裡面上Google Scholar卻查不到。我猜這可能是Google Scholar的API有問題，但ReadCube就自願受API問題的限制了？事實上，如果ReadCube對這類PDF可以支持像Zotero那樣，訪問文獻網頁抓取信息，就能夠很好地解決此問題。除了PDF識別問題之外，識別出來的信息，也需要分類編排。學術文獻是有很多種的，有Book、Book chap-ter、jour-nal、patent、dis-ser-ta-tion等等，這些都以是PDF文件。ReadCube的PDF識別好像默認了這個庫里只能有jour-nal這一類型的文獻。可是至少我在寫論文的時候我不會只引用jour-nal。假如我工作完全用ReadCube，我要引用book的時候我豈不是要另外再打開我的EndNote？要求一個軟體把PDF的文字識別出來之後，從排版和頁眉頁腳信息的特徵識別出這是一個book還是book chap-ter還是jour-nal還是dis-ser-ta-tion，要求實在太高了，在可以預見的將來這一點都肯定是做不到的。無論如何，想要直接從PDF中識別信息，願望很美好，但只要它不是接近100%可行，我就不想依賴它。為什麼說這個願望很美好而又要求它100%呢？因為，假如能從PDF中識別所有信息，我下載任何PDF就不用重命名，也不用記得同時導出RIS並導入到EndNote庫中以保持一一對應了，以上的好習慣一旦不遵循，我的PDF文件夾將會是一團糟，這時就真的要完完全全地依賴資料庫的PDF識別功能了。假如這一功能還不是100%有效，想想我有幾千篇文獻（和PDF），有個那麼1%我就要手動輸入十幾篇了，還找不到源PDF在哪兒（因為命名全是亂的）。正因為如此，我根本就不會對文獻管理軟體的PDF自動識別管理功能抱有任何期望。像ReadCube這種完全依賴在這個功能上的產品，用處就相當於零了。

至於像Mendeley這樣（以及EndNote X5以上版本），把已有文獻數據跟硬碟中的PDF文件鏈接起來，可以直接在文獻資料庫中打開PDF文件來閱讀的功能，我覺得也沒必要。我對一個PDF閱讀器產品本來就另有要求。首先，你有沒有給我的電腦添加一個PDF印表機？如果沒有，我豈不仍然要另外再裝一個Acrobat Professional嗎？假如我反正要裝一個Acrobat Pro我有啥為何不在那兒看？Acrobat Pro支持畫下劃線（而不僅僅是高亮。我討厭用高亮，偏好用下劃線），而且還可以設置成波浪形的下劃線。Acrobat還支畫圈畫框畫箭頭，有時一個公式我框一下，曲線有一個轉折點我用箭頭指一下。Acrobat還支持基本的窗口操作例如把同一個文件的窗口分成兩半，這樣的話，我上一半看正文，下一半看參考文獻列表，那就不用在正文和參考文獻頭尾兩種來回拖動了。如果可以的話我恨不得分三半，第三半看圖，解決文中說「see Fig. 3(b)」結果Fig. 3(b)在下一頁的問題。對於一些較新的PDF文件Acrobat還可以進行搜索。可以對PDF進行修改。例如有的paper會另外有一個sup-port-ing infor-ma-tion文件，我就會把原文和sup-port-ing infor-ma-tion合併為一個PDF文件，類似這樣的操作在Acrobat里都可以解決。相比之下，那些文獻管理器附帶的PDF閱讀功能實在是雞肋，不明白為什麼這麼多人青睞，還作為一個賣點了。是不是像我這種哪類軟體都成為深度用戶的人就註定不幸福，可我也不見得是什麼深度用戶啊？果粉們不是說，品味高的用戶必然會不約而同地選用蘋果產品嗎？我都沒有選用蘋果產品，用Windows用得這麼爽，我一定是個壞品味的吊絲。為什麼我仍然不滿呢？我還要補充一下，學術文獻的文件格式，不僅僅只有PDF文件。中文文獻會需要用CAJViewer來閱讀（就算期刊論文在CNKI可以選擇下載為PDF格式，但博士和優秀碩士論文只能下載為.nh格式文件，必須在CAJViewer里看），光整合PDF閱讀功能，也並沒有100%。不是100%的話，我就不敢全依賴在它上面。

為什麼我反覆提到如果不是100%我就不敢全依賴呢？所謂「依賴」是什麼意思呢？我在知乎上說過，我的工作思維是，先花專門的時間把規則設計和定義好，然後不加思索地按規則辦；先編程再運行；先把CSS樣式表設置好，再在編寫HTML應用相應的樣式；在Word里先把樣式表定義好了，再按要求應用樣式；而不是在打字的過程中，這裡要加粗就加粗，那裡要斜體就斜體。如有修改，就是修改定義，同時應用在所有實體上。按照相似的思維，在工作上，我一定要保證我所遵循的work-flow是比較合理，能夠適應大多數情況的，因為之後我做的事情就是不假思索地按照這個work-flow去操作，就好像電腦嚴格按照已編好的程序來運行一樣。因為，如果你的工作流程是每步都需要你看當時的情況來取捨，每步都要「隨機應變」；工作流程也不固定，一會兒這樣一會兒那樣的話，你工作的需時就不好估計，你對你的工作進度就容易失去控制。你的work-flow越是連個機器人都能完成，就越高效。越是要你時時處處都用模糊智慧去取捨、去回味、去條件判斷分支，就越低效。所以如果一個工具給到我的功能不是100%能實現，這就等於在我的work-flow中種下一個不可靠因素，一個隱患；我的work-flow就定義得不嚴密。真按它那樣長期運行，很容易就栽在這個隱患上，到時我就要很麻煩地脫離機器人狀態，花時間研究解決臨時發生的問題，很拖進度。

最後就說到整合Word軟體了。但這個功能，我只有EndNote的經驗，其他軟體因為在以上指標都有各種不適之處，所以我都沒有長期使用。但我有一個印象比較深，就是Mendeley和Zotero都採用CSL，採用啥我不管，CSL想開源通用化我原則上也歡迎。但你必須同時提供有一個可視化的編輯器以便用戶自行定義cita-tion style啊。現在我再搜，似乎有一些第三方的編輯器了，也不知道好不好用。但在我當年使用Zotero和Mendeley的時候，我是找不到第三方編輯器的，我也沒有精力去自己學習CSL語法。

最後就是「雲」功能。「雲」的概念大家都歡迎。大家都希望啥都能「雲」。但是中國大陸目前的帶寬和訪問國外網路的狀況，限制了我們不是什麼東西都適合「雲」。就好像我上一篇關於筆記軟體的文章那樣，我的筆記，以及我的文獻資料庫，都可能會佔用一個比較大的文件空間。同步這樣的文件往往需要很長的時間。假如我使用一個軟體，工作的時間花掉了，還要花額外的時間等它同步完畢，那談何提高工作效率呢？如果我用Mendeley識別我的PDF文件夾（2734個PDF文件），它會死。如果不識別PDF文件夾光導入文獻數據（2.8k+），倒還可以（反應還是會慢些），但如果僅僅是這樣我幹嘛不用EndNote呢？EndNote更明快，前面也提到了還有排序功能的問題。再者，我為何啥軟體都要自帶雲同步？現在已經有drop-box了。就好像我在上一篇文章里談到的那樣，OneNote就算沒有整合SkyDrive，由於它的筆記文件是很清晰可以找得到的，也可以按用戶意願來修改存放位置。想要雲同步的話，把文件放在Dropbox里就解決了。但若像Evernote這樣，數據存在神秘的文件組合里，你還真只能依賴它自己的雲功能，碰上恰好它的伺服器很爛你每次同步都很痛苦，那就只好跟它說88了。EndNote的資料庫文件也不算複雜，一個.enl文件帶一個同名的.data文件夾，我習慣把這個跟我的PDF文件放在Dropbox的同一個文件夾里，就一起同步掉了，何需EndNote自帶什麼同步功能？我知道還有個EndNoteWeb，但我從來不用。EndNote是收錢的軟體，當然做得好。Mendeley和Zotero是免費的，很多人說這很難得，做得不好情有可原。事實上如果它做得好，收費我也不是不願意花錢，做得不好，我才不管它是不是免費。既然做免費軟體壓力這麼大，我覺得花時間開發網上同步的功能框架就是完全浪費時間。有Dropbox用戶不會用嗎？你只需要把資料庫文件做得簡單易找些就行了。多花點資金和精力放在軟體本身的細節上豈不更好？

Read more: 我用過的文獻管理軟體 : 萬物皆流

===經過比較，還是覺得 @孫尉翔的文獻管理方案更好：捨棄Mendeley，使用Endnote X6管理文獻，該版本支持在文獻pdf內搜索。使用dropbox（或其它文件同步軟體）同步數據（包括endnote文獻庫、pdf文獻等一系列文件）。庫內內容可同步至endnote web。===

我的文獻不是很多，只有幾百篇，所以對大量文獻快速管理沒有要求。主要用Web of Science 結合 HistCite做領域入門，用Mendeley管理文獻，用Endnote做批量下載和參考文獻生成。使用PDF-Xchange Viewer閱讀。

1. 文獻檢索

1.1 快速搜索、剛剛入門一個領域的時候，使用google search和google scholar，隨便看看。

1.2 大概知道領域關鍵詞、研究熱點前沿和確切了解自己要研究哪一個小分支以後，用Web of Science的Advanced Search搜索文獻，相當贊啊！

1.3 Web of knowledge (Web of Science)的檢索結果可以導出給HistCite分析，看到領域的重要文章和發展脈絡。可參考科學網—引文分析軟體histcite簡介

2. 下載文獻

2.1 大部分不是很重要的文獻只看摘要，或者在網頁上看fulltext，只下載重要的文獻。

2.2 單篇或少量文獻下載：有許可權就可以下載。

2.3 大量文獻下載：Endnote。比如，用Web of Science搜索到關於抗體晶體結構的文獻，可能有幾百篇，如果想要批量下載，可以從Web of Science導出文獻目錄到Endnote，使用Endnote的Find fulltext功能批量下載。Mendeley好像沒有這個功能。

3. 管理文獻：Mendeley （Endnote管理方式也很好，見 @孫尉翔的答案）

3.1 導入文獻：可以批量導入文件或文件夾，也可以直接拖動PDF到Mendeley。

3.2 同步文獻：所有文獻自動雲同步（citation信息和pdf文件全都自動同步噢耶）。

3.3 管理：支持folder、tag、needs review、favourites等方式管理。

3.4 搜索：不僅可以搜索文件citation信息，同時也在文獻內部搜索，高科技啊（不知道新版Endnote有沒有這個功能）。

3.5 共享：可以建群組，群組內的文獻自動同步。也可以方便在Mendeley軟體內部share文獻給同事。

3.6 從pdf文件識別的citation信息自動更正。

3.7 不識別中文pdf。

3.8 Mendeley支持windows, Mac, Linux。

4. 論文參考文獻生成：Endnote

Endnote有大量現成的output style文件，並可以靈活自定義，和MS Word、Open Office（可能還有Latex？沒用過）都可以聯用。

5. PDF閱讀：PDF-Xchange viewer

支持鍵盤快捷鍵自定義（單鍵也可以，比如可以定義，按鍵盤上的L自動切換Highlighter工具）。Foxit Reader最近也開始支持這個功能。

6. 補充

文獻管理軟體ReadCube可以支持自動識別PDF文獻中最後的被引文獻，並把這個被引文獻列表放到閱讀器的右邊，這樣想要閱讀哪個被引文獻的時候，就不需要滾到最後再滾回來了，是個貼心的功能。只是ReadCube其它功能實在不夠強大，只能忍痛割愛。

==2013年8月8日補充==

買了ipad來折騰，試用iOS上的Endnote來同步文獻，感覺很好。所有電腦上的文獻條目、附件和分類都可以通過Endnote Web同步到ipad，標記、閱讀也很方便。

mendeley！

喜歡這個軟體，迭代更新快，不斷推出喜歡的新功能，就像人的進步，很多功能，已經遠遠超越endnote了。

先簡要說幾個值得提的功能：

1. mendeley的pdf編輯器（我現在很少用本地的foxit閱讀器了）

2. 同步功能（多個電腦，ipad直接同步文獻，同步標記等。）

3. pdf全文檢索（寫論文的時候，就知道有多愛這個功能了。）

4. 多種快速的添加文獻的方法（我最喜歡doi直接添加，chrome下的小書籤也值得推薦）

5. 共享功能

6. 多級分組

7. 預測相關文獻（後期的一個更新功能，可以根據你文件夾中的論文，給你推薦相關論文）

8.目錄content功能（1.11 新功能）

自動識別pdf中的目錄，類似於書籤功能.

9. Enrichments - For supported papers, the Enrichments tab displays tables and figures found in the paper, allowing you to navigate the paper more quickly. You can also copy table data directly to the clipboard for further analysis in other apps.

10.

缺點：

1. 同步可能出現失敗問題，這個是國內環境的問題，因人而異。

2. 參考文獻格式經常出現小錯誤，這個是個大硬傷，只能先忍著了。

3. 標記不能導出（pdf上的標記是獨立於pdf文件而存在於個人的mendeley賬戶的，說是優點也是優點，這樣我不用管我的pdf文件是否丟失，反正標記都不會丟失）（現在可以了。-2015-01-11）

2014年3月8日14:06:27補充

2014年3月12日根據今天的1.11更新信息補充8

==============mendeley與endnote===========

前幾天懷念了一些endnote，就順手查了一下最新的x7的新功能，看看有沒有激動人心的地方，最後大失所望。

Endnote X7 新功能簡介

1、PDF自動導入：PDF Auto Import Folder

2、PDF自動重命名：PDF Auto Renaming Options

3、PDF導入自動分組：PDF Import Create a Group Set

4、參考文獻分組功能：Categorize References

5、PowerPoint插入功能

6、可查詢PDF標註文字

7、 Sync 同步功能進一步加強

8、改進閱讀與未讀（Read/Unread）及評分（Rating）功能

9、新增文獻類型：Podcast, Interview, Press Releases

10、手動更改Library 位置

和mendeley相比，真的沒有幾個殺手鐧的功能，很多的更新，mendeley本身就有，或者用其他方法很容易實現，比如第五條，mendeley中直接郵件copy as formated citation就是相似的結果。

當然了，軟體只是個工具，各有優缺點，軟體也是生活態度的體現，過分追求軟體，就忘了自己是做什麼的了，要警示自己。

果斷Mendeley

因為在linux上似乎好像只有這個比較好用，不醜，還能高亮標註pdf……除了時不時會卡一下，但也沒遇到crash

Windows下的話感覺沒那麼好用，字體丑爆

外貌黨對endnote接受無能啊

我來推薦一個強大的文獻管理軟體：Papers 3，Mac、Windows 和 iOS 平台都有。用過 NoteExpress 和 EndNote，還是覺得 Papers 3 最好用。其實 EndNote 已經是夠用的文獻管理軟體，和 Web of Science 結合起來之後找文獻、保存文獻信息、引用文獻都很方便，夠用但畢竟平淡，而 Papers 3 就更為出彩了。下面我從搞科研的基本工作流程來說明 Papers 3 好在哪裡。

第一步一般是根據關鍵詞查文獻、搜集文獻，這一切都可以在 Papers 3 內置的搜索引擎里完成，這個搜索引擎整合了大部分文獻資料庫，支持各種欄位的搜索。文獻信息可以一鍵導入，如果此時你在學校內網環境，甚至可以直接下載PDF文件。下載的PDF文件可以設置自己喜歡的格式自動重新命名，比如我就是「作者－刊名－卷－頁碼－年份」的命名格式，萬一需要找到特定的PDF文件（其實一般不需要）就可以很方便。假如已經有 PDF 文獻了但是 Papers 3 里沒有文獻信息，只需要把 PDF 文件拖入 Papers 3 即可，它會自動識別文獻信息，除了早期的一些圖片版 PDF，識別率還不錯。就算識別不出來或者識別不全，還可以通過 Match 功能利用內置搜索引擎補全文獻信息。如果喜歡在瀏覽器直接在 Google、Google Scholar或者各個資料庫搜索，也可以通過瀏覽器 Bookmarklet 導入文獻信息。我個人有時會瀏覽專業雜誌主頁，看的感興趣的文獻，用 Chrome 插件一鍵加入到 Papers 3 的 reading list 裡面以備不時之需。

第二步是整理和閱讀文獻。 Papers 3 通過收藏集（Collections）來歸類不同的文獻信息，除此之外它還支持智能收藏集（Smart Collection），設置一定的規則，導入的文獻信息就自動進入到這個收藏集里。Paper 3 內置了功能足夠的 PDF 閱讀器，標註、做筆記、文字標籤、顏色標籤一應俱全。不同屬性的排序和標記基本上可以迅速定位到想要找的文獻信息。不僅如此，Papers 3 支持 PDF 全文和筆記標註的搜索，這樣在寫文章的時候想起某句話、某個觀點但就是想不起哪篇文獻的時候就很有用了，一搜便知。

做完實驗得到數據，第三步就是寫文章引用文獻了。不同於 EndNote 或者 Mendeley 用 Word 插件的方式，在寫作的時候通過 Papers 3 喚起插入文獻的小窗口，簡單的搜索就可以快速插入想要引用的文獻。引文格式當然是可以修改的，支持大多數主流期刊樣式。相比 EndNote 插入引文的方式，我覺得這種方式更自然。

（本圖來自 Papers 3 官網）
除了以上介紹的，Papers 還支持用 Dropbox 同步，這樣結合 iOS 客戶端，在移動設備上也可以愉快的看文獻了，換了電腦同樣沒有問題。其他特色功能感興趣的自己去探索吧，免費用一個月，一個月後79歐元，但是如果是學生的話可以申請到49歐元的優惠價，一個授權支持三台機器。

總之， Papers 3 是我用過的最好的文獻管理軟體，而且也是最漂亮的——這很重要，用的時候就心情愉悅，美就是生產力之一啊。

詳見： http://songchunlin.net/cn/2016/03/papers-3/

把上面提到的大部分軟體都大致的研究了下。最終選擇Mendeley。

下面針對我目前用到的功能進行對比分析，其他功能以後用到再補充。

1.文獻搜索：

Paper：支持很多主流文獻資料庫搜索，如arXiv，google scholar；

Endnote：雖然也有很多資料庫，但是上面列舉的兩個就沒有；

Mendeley：不知道是在什麼資料庫中搜索；

Readcube：自帶的搜索引擎，加上pubmed，google scholar（在翻牆狀態下，仍然無法使用該選項搜索）；而且沒有高級選項。

Paper收費，所以不用它了。

2.文獻管理

Endnote：

優點：

可以直接在軟體內搜索WOS等資料庫文獻記錄並批量下載PDF
可以方便的用不同雜誌的模板寫論文，引用格式多樣
雲同步

缺點：

不支持全文搜索
不支持直接拖拽PDF文件或文件夾到軟體中
PDF文件重命名最大支持40個字元（可是大多時候都超過40個）
有Label功能（但是是在中間的排序窗口中顯示Label結果，並不是像Mendeley在左邊窗口顯示而且可以選擇不同的Tag，也不能及時在窗口中顯示出來，還得保存一下）
基本沒有參考文獻記錄解析能力

Mendeley：

優點：

支持全文搜索
支持直接拖拽PDF文件或文件夾到軟體中（個人習慣這個操作，一步步選有點麻煩）
PDF文件重命名沒有字元數限制
免費Tag功能
免費雲同步
對參考文獻記錄解析能力強
支持推薦相關參考文獻

缺點：

不能下載PDF

Readcube：

優點：

支持直接拖拽PDF文件或文件夾到軟體中
PDF文件重命名沒有字元數限制
可以將PDF文件按照年份，期刊，作者，標題分到不同的子文件夾中（但是實際上我需要的是按照標籤來分類，所以這個功能沒什麼用）
支持推薦相關文獻，並且可以選擇時間範圍（不錯）

缺點：

Tag功能專業版才有，要收費
雲同步要收費
對參考文獻解析能力不如Mendeley
可以單個下載PDF，但不能批量下載，且速度慢

3.文獻分析

文獻分析軟體主要用來找到本領域的綜述性的、經典的、貢獻大的參考文獻，並從中分析出當前的研究熱點以及未來的發展趨勢。我只用過Refviz和CiteSpace這兩個軟體。

Refviz：可以根據某個關鍵詞得出相關的熱門的研究方向，可以參考博士應該採取什麼策略讀文獻？ - Esquirrel 的回答 - 知乎

CiteSpace：結合WOS可以找到某個領域相關的經典文獻。主要是根據被引次數來判斷。功能很強大，但是操作繁瑣，還不如直接在WOS和google scholar中看被引次數。並且經典文獻就那幾篇，用不著根據軟體來判斷，除非是新的研究方向。

4.總結：

Paper的文獻搜索功能最好
考慮文獻搜索和文獻管理，Endnote綜合性能最好
不考慮文獻搜索，Mendeley性能最好

因此，我目前的文獻管理方法為，首先在電腦中建幾個大類的文件夾，再在每個文件夾中慢慢積累參考文獻，由於下載的PDF文件名稱通常很亂，再用Mendeley按照時間-標題-期刊進行重命名。具體過程如下：

用google scholar和WOS進行文獻搜索和分析
用Mendeley進行文獻管理（PDF重命名，在所有PDF全文中查找某個關鍵

詞，查看推薦文獻，同步文獻，標籤功能）

在Mendeley中選擇用Foxit Reader打開PDF文件，在Foxit Reader中對PDF 進行標註

這樣的做結果是，硬碟中每個文件夾中的PDF是按照時間來排序的，並且PDF文件裡面包含自己的注釋筆記。事實上，Menleley只是輔助搜索自己想要查找的某篇文獻或者某個關鍵詞，主要還是用Foxit Reader來閱讀、注釋。

以上只是從個人需求和個人習慣的角度來分析的，僅供大家參考。

「文獻管理軟體這麼多，我究竟該用哪一個？」

這是每個科研工作者都會碰到的問題。據不完全統計，目前文獻管理類軟體至少有幾十種。其中，主流的有以下幾款：Endnote、Mendeley、Zotero、Papers等。初看來，這幾款軟體的功能都差不多，難分伯仲。在各大學術論壇和網路媒體上有些比較，但是大多不夠系統、或者個人偏好明顯。為了方便各位選擇，小編將從各個方面出發，比較這些軟體。根據這些比較，各位可以根據要求選擇適合的文獻管理軟體。

一、綜合比較：PDF識別和信息提取

目前，文獻多以PDF格式保存和傳播。所以文獻管理軟體對PDF的識別和信息提取能力必須足夠強。目前，Endnote、Mendeley、Zotero、Papers都具有PDF信息提取能力。本期內容，小編以不同出版時間的英文文獻、中文文獻、專利和書籍（都為PDF格式）為例，來考察各大軟體的提取能力。

在對比之前，簡單介紹軟體是如何實現PDF信息提取的。一般分為三步：1. 如果PDF文件帶有元數據信息，軟體就可以直接提取信息；2. 如果PDF文件沒有元數據，軟體可以檢測PDF文件，尋找文獻DOI號、專利號、或者ISBN號，然後通過網路檢索文獻信息；3. 萬一PDF中DOI號都沒有，部分軟體還可以直接從PDF中提取文題、作者、頁碼等信息。注意：很多軟體通過Google Scholar來檢索文獻，而國內有無法連接Google Scholar，從而導致軟體的PDF識別能力大大削弱（以下對比是在沒有翻牆的情況下測試）。

1. 主流英文期刊

因為平時閱讀最多的是英文文獻。本節選擇了不同時期的JACS文獻（2015、2004 、1993 、1983）為例。

a. Endnote：如圖1，僅能自動識別出2015年文獻、而04/93/83年發表文獻均未能識別。

圖 1

b. Mendeley：全部識別，信息全面，包括文題、作者、頁碼、雜誌名等，如圖2所示：

圖 2

c. Zotero ：能識別2015/2004年文獻，無法識別93/83年文獻。注意：導入文獻時，Zotero並不能像Endnote一樣自動識別，需要選中文獻，右擊選擇「重新提取元數據」。提取結果見下圖3：

圖 3

d. Papers: Papers能識別2015/2004/1993年文獻，但無法識別83年文獻。如圖4所示;

圖 4

2. 中文文獻

雖說大多中文文獻都很水，但偶爾也還是會看看。特別是博士論文，對於了解一個陌生領域有一定幫助。以上者四款軟體都是國外團隊開發，中文識別能力怎麼樣呢？我們先看看測試結果。如下圖5 - 8。

圖 5

圖 6

圖 7

圖 8

幾乎全軍覆沒，要麼是根本無法識別、要麼是亂碼、最多也就提取個標題。Zotero的中文網頁的提取能力雖然強，但是對中文PDF也是愛莫能助。即使翻牆，這些軟體對中文PDF也毫無辦法。所以對於中文文獻，只能手動碼字了。如果你平時中文文獻看的非常多，請關注我們後期會推出的Noteexpress或者醫學文獻王。

3. 專利的識別能力

除了期刊文獻，科研工作者還會閱讀大量專利文獻。有時專利的及時性要比期刊更好，這是因為在發表文章之前，作者都會先申請專利（專利相關內容請到我們專利專欄查看）。各大文獻管理軟體對專利的鑒別能力如何呢？

a. Endnote：如圖9，毫無鑒別能力，多次reference Update無果。

圖 9

b. Mendeley ：3篇US Patent中識別出一篇。如圖10所示。

圖 10

c. Zotero ：在沒有翻牆的情況下，Zotero對Patent也毫無識別力。如圖11所示：

圖 11

d. Papers：對於專利Papers也是沒什麼識別力。如圖12。

圖 12

4. 書籍識別力

除了期刊文獻和專利，平時閱讀最多的當屬各類專業書籍。現選擇兩本PDF格式英文書籍為例。

a. Endnote: 兩本書籍都未能識別，如圖13所示：

圖 13

b. Mendeley: 成功識別兩者，但其中一本（CRC）信息不全。識別出書名和作者，但是頁碼有誤。如圖14所示：

圖 14

c. Zotero: 識別一本，未能識別出CRC Handbook of Chemistry and Physics。如圖15所示;

圖 15

d. Papers:兩本書籍都沒能識別。如圖16。

圖 16

通過以上四大比較，各大軟體的PDF提取能力一目了然。從類別來分析，他們的期刊文獻的提取能力都很強，但對於專利、書籍的提取能力較弱，對中文期刊則毫無辦法。各軟體的綜合評分如下：Zotero（VPN）~ Mendeley &> Zotero ~ Papers &> Endnote 。

當然選擇一款軟體不僅僅要看其PDF的提取能力，小編將在後期內容陸續從其他方面對各個軟體進行逐一介紹。敬請期待哦。

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二、Papers的使用與特點:

A. papers基本功能介紹

1. 文獻識別與整理：

Paper的一大特色是可以從PDF原文抓取文獻信息，比如你從電腦端拖一個pdf格式文獻放到Papers中，軟體就能夠自動識別文獻信息，如標題、作者、年代。文獻分類簡潔明了。當你把你平時文件夾里的文獻分類拖到Papers里，頓時感覺清爽不少，井井有條，各種信息，一目了然。部分年代比較久遠的文獻，如圖片格式PDF，Papers無法識別。如果無法識別，有兩種解決方式：a. 通過軟體中Match功能（選中文獻，滑鼠右鍵，下拉菜單中有match），搜索該文獻，如果發現對應的文獻，添加即可。b. 可以在右側屬性區域手動編輯。另外：Papers似乎無法識別專利信息（有待加強）。

2. 文獻閱讀與標註：

Papers內部即可打開PDF，Word等格式文件，但主要針對PDF文件。閱讀模式下，Papers就相當於一個文獻閱讀器。Papers的文獻閱讀功能比較強大，基本可以滿足日常需求。最突出的特色是標註和筆記功能很強大。還有一個很好用的功能，看完之後可以根據文獻重要程度進行評級。

3. 文獻檢索功能

Papers內置二十多個常用資料庫，化學相關的Web of Science、Google Scholar等都包括在內。輸入一個詞條，眾多資料庫同時搜索（老師再也不用擔心找不到文獻啦！）。如果是你有下載許可權，就可以直接下載PDF文件。但是因為國內對谷歌的封鎖，所以谷歌學術無法成功實現搜索，真是一大遺憾。

4. 文獻引用

Papers並不是通過Word插件的方式來引用文獻，而是通過彈出窗口的方式添加文獻。在添加文獻之前請在papers的屬性中設置好引用格式。寫作過程中，需要插入引用文獻時雙擊鍵盤control鍵，會彈出小窗口，搜索所需要文獻插入即可。對於Papers引用格式的全面性，小編我還沒有認真考察過，求大神指點。

B. Papers中如何實現多終端的互聯

互聯網的移動化正在逐漸成為主流，眾多文獻管理軟體也紛紛開發互聯功能。最早期是實現瀏覽器和軟體的互聯，後發展為與智能移動設備的互聯，最近又發展出與各種雲服務的互聯。本期內容分享在Papers中如何實現多終端的互聯。

1. Papers與瀏覽器互聯

雖然多數文獻管理軟體都具有在線文獻搜索功能，但是主流的文獻搜索和瀏覽方式依舊是通過瀏覽器（個人觀點，沒有統計）。兩者常通過插件的方式相關聯。以Chrome瀏覽器為例，在「 Chrome網上應用店」中搜索Papers即可找到相關插件，如圖1所示：

圖 1

按照步驟安裝，瀏覽器右上角會出現Papers插件圖標，如圖2所示。

圖 2

瀏覽到感興趣的文獻時，點擊Papers插件、並添加到Reading list（初次使用時，需要登錄），如圖3所示。

圖 3

添加完成後，在Papers軟體的Reading list里就能找到相應的文獻，如圖4所示：

圖 4

這一功能非常實用。平時可以用熟悉的瀏覽器來閱讀和搜索文獻，發現感興趣的文獻導入到Papers軟體中以方便管理和再次閱讀。

2. Papers與iPad、iPone互聯

隨著智能移動設備的迅猛發展，越來越多的人開始在移動設備，如iPad，上瀏覽文獻。本人就很喜歡在公交車上用iPad看文獻。Papers已經推出iPad版和iPhone版。通過雲盤即可實現文獻的多終端閱讀。Papers官方推薦的雲盤是Dropbox，但是很遺憾國內Dropbox無法使用。此外，Papers還支持以下六大雲盤：

Box
Google Drive
iCloud
OneDrive
SugarSync
Network file shared

同步的步驟如下：

a. 在雲盤文件夾下創建Papers Library，如圖5。

圖 5

b. 按照要求輸入相關信息並登錄，圖6。

圖 6

在該資料庫中的文獻都可以通過雲盤導入iPad（前提是iPad上也安裝有Papers和相關雲盤）。

3. 創建Shared Collection與朋友們分享文獻。

a、在Papers軟體中創建共享文件夾（File - New Collection - Shared Collection）。

b、將需要共享的文獻拖到該欄中。

c、右擊Shared Collection，有多種分享方式。如圖7所示：

圖 7

每個Shared Collection都對應一個URL。只需發送該鏈接給朋友。他們通過這個URL即可下載文獻，如圖8。

圖 8

為什麼是半個贊？雖然這些功能的出發點好。但是國內的朋友用起來不是很方便。國內Chrome瀏覽器無法打開網上應用商店，Dropbox也不好用。這些方面有待加強。

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C. Papers如何實現參考文獻的插入？

從參考文獻插入角度分析，Papers與Endnote的最大不同之處在於其與Word的結合方式（這裡默認使用Word作為編輯工具）。Endnote是在Word中直接生成一個模塊，成為Word的一部分。這樣做的優點是兩個的結合更緊密，更一體化。缺點是導致Word更加臃腫、且很有可能導致Word運行緩慢。而Papers是通過彈出窗口的模式實現與Word的結合。顯然這種方式對Word自身的運行影響很小、但同時協同性就沒有Endnote好。插入文獻的具體操作方式如下：

1. 打開Papers Citation功能（在第一篇Papers內容里已經介紹）。

2. 設置參考文獻統一格式，雙擊鍵盤Ctrol鍵，在對話框中選擇Select Type。如下圖所示。目前Papers中提供8000多種文獻格式模板（來源於CSL）。

3. 在Word中找到指定文獻引用處，雙擊Ctrol，出現如下圖所示對話框。

4. 在對話框中輸入關鍵詞搜索所需文獻。（簡潔明了）

5. 雙擊相關文獻，出現下圖所示對話框。

6. 選擇Insert Citation，即可插入文獻。如果需要同時插入多篇文獻，則點擊Search Other Papers，然後在搜索欄繼續搜索，找到目的文獻，雙擊。以此類推。找出多篇文獻後，點擊Insert Citatation。如下圖所示。

7. 全部文獻插入完成後，雙擊Control。點擊Format Manuscript，在文末生成參考文獻。如下圖所示：

Papers插入文獻的一大特點是在插入文獻並不立即在文末生成相應的參考文獻。修改時同樣。只有手動選擇Format Manuscipt才能更新參考文獻。就如同Endnote中的Update Bibliography。

在介紹Endnote時我們已經介紹過，因為軟體的智能程度不夠，所以常常需要手動修改參考文獻的格式。比如期刊名縮寫。在Papers中同樣可以修改。方法如下：

打開Papers，找到相關文獻，在右側信息區找到文獻名，左擊出現如下圖所示對話框。其中即可添加和修改縮寫模式。

總結：

從功能性來考慮，Papers確實可以勝任文章中參考文獻的插入與管理工作。但不得不承認其與Endnote比，仍有一定差距。比如我在Papers中沒有找到分節插入文獻的功能，而這一功能在寫畢業論文是必不可少的（如果有哪位發現有這項功能，請在評論區指正，謝謝）。對於參考文獻細節格式的設置，Endnote要詳盡的多：如作者名的顯示方式、標點的設置。Papers中創建新的文獻格式也更加複雜。

三、Endnote的使用與特點:

A. 個人文獻管理與文獻檢索

在文獻管理和文獻引用管理領域，Endnote一直霸佔著老大的位置。能成為老大，必有過人之處。小編將分兩至三期內容向各位介紹Endnote。Endnote有三大功能：1. 寫文章和論文時，管理參考文獻（很強大）；2. 個人文獻管理； 3. 文獻檢索。本期內容介紹後兩項；下期內容專門介紹第一項。

資料庫的創建與分組的建立

打開Endnote界面如圖1所示。

圖1

對於初次使用者，你需要新建一個Library：依次選擇File - New，在彈出對話框中選擇一個文件夾存放資料庫。新建Library完成後會在該文件夾中生成兩個子文件，如圖2所示，一個是資料庫文件，另一個是附加文件夾。附加文件夾的作用是存放每篇文獻所對應的附加文件（如果有的話）。

圖2

資料庫建立完成後，返回主界面，如圖3所示。主界面大致分為三個部分：左側區域為分組和搜索區；中間顯示文獻詳細信息；右側為摘要、全文以及附加文件顯示區。

圖3

作為一個科研工作者，文獻閱讀量在與日俱增。幾年下來，個人文獻庫中文獻數量達到幾千篇，甚至上萬篇，所以文獻分組必不可少。選中主界面左側My Group標籤，右擊創建子Group。也可以通過軟體頂部Group選項卡來設置分組。本例中設置分組名為Quantum Dots（一直沒有發現如何在一級分組下再創建二級分組，比如在Quantum Dots分組中創建一個子分組CdSe，請高手指教！）。

如果想改變主界面的排布方式，比如將右側的摘要、全文等信息放到下部，請點擊主界面有下方的Lay out圖標，如圖3所示。

文獻的導入

Endnote中文獻的導入方式也可以大致分為三類：直接輸入、PDF導入、網頁導入。

&<1&> 直接輸入：依次選擇Reference - New Reference （或者「單擊New Reference 圖標」再或「Control + N快捷鍵」）。出現如圖4所示對話框，

圖4

根據對話框中要求填寫信息即可，不用填寫全部信息，能夠區分辨別就好。注意：在輸入作者姓名時，每位作者要佔一行，如圖4所示。

顯然，手動編輯很麻煩。一般也只有在萬不得已的時候才手動直接輸入。較為常用的是後兩種方式：PDF導入和網頁導入。

&<2&> PDF導入：依次選擇File - Import。在Import目錄下有File...和Folder...兩種方式，分別表示導入單個PDF文件和PDF文件夾。本例中選擇File...，出現如圖5所示對話框。

圖5

注意：如果要導入PDF文件，記住要把第二行的Import Option欄改成PDF。

導入PDF後，Endnote能夠自動獲取文獻信息並排版好，非常方便。但是也有部分文件無法識別，需要手動添加這些信息。

通過PDF方式導入的文獻，其全文都呈現在主界面右側附件文件欄。如果想要添加附加文件，請點擊右側全文PDF旁的回形針形狀按鈕添加附件，如圖6所示。

圖6

&<3&> 網頁導入

網頁導入也是常用的導入方式之一，在各大資料庫和期刊主頁都能夠看到Download Citation之類的標誌。點擊該標誌，並選擇Endnote格式下載。再通過File - Import即可導入。現在許多期刊能夠能夠直接將引用信息導入到Endnote，免去了下載再導入的過程。下面以從知網導入參考文獻為例（圖7 - 9 ）：

圖7

圖8

圖9

文獻檢索

Endnote已經內嵌多種資料庫，在軟體內就可以進行搜索和查找文獻。首先在主界面左側搜索區選擇所需資料庫，然後展開搜索窗口，根據要求搜索即可，如圖10所示。

圖10

現在各大數據管理軟體都內嵌各種資料庫，可以實現搜索，並下載全文。但是個人感覺這一功能有點雞肋。在搜索文獻的時候，我還是會選擇通過瀏覽器到某一資料庫或者某期刊主頁去搜索。首先，因為平時我的瀏覽器基本上都是打開狀態，通過標籤進入常用資料庫和期刊主頁很方便，所以懶的去打開Endnote搜索。其次，國內的各種封鎖和限制，這些文獻管理軟體與資料庫的鏈接並不流暢，檢索起來常常不如人意。比如谷歌學術，需要各種代理才能瀏覽， Web of Science需要登錄等等（好像我扯的有點遠了）。

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B. 參考文獻的插入

Endnote雖然是一款文獻管理軟體，但其文獻引用功能卻最為常用。本期內容從實例出發，介紹如何插入引用文獻。

如果電腦安裝了Word和Endnote，Word中會自動添加Endnote插件，如圖1所示：

圖 1

建議在文章主體部分完成後再開始一一插入文獻。步驟如下：

1. 選擇投稿論文格式，鎖定插入位置：

圖 2

2. 選擇文獻，並插入。（注意：點擊下圖中Insert Citation圖標的下角標可以實現多種類型的導入，比如Insert Selected Citation等）

圖 3

3. 依據相同的方法依次插入文獻。插入完成後如圖4所示。

圖 4

這種導入文獻的方法比較簡單。當然，也可以先選擇插入位置，然後點擊」Go to Endnote「鍵回到Endnote界面。找到參考文獻直接導入。如下圖5所示：

圖 5

Endnote中的基本文獻導入方法就是這麼簡單。但是，因為Endnote還不夠智能，而各期刊對投稿論文的格式要求又非常高，所以需要逐條檢查參考文獻並修改格式。舉例如下：

上文中，我們以JACs的格式排版了參考文獻。但是很多參考文獻的格式不滿足JACs的要求。比如JACs中參考文獻的期刊名要縮寫，但上圖4中參考文獻9顯示的卻是期刊全名（這是由於在下載這篇文獻的時候沒能下載相應信息，此處為期刊名稱縮寫）。修改方式如下：

1. 回到Endnote，找到指定參考文獻及其文獻名，右擊、依次選擇「 Open Term Lists 」 — 「Journals Term List」，如圖6所示。

圖 6

2. 打開對話框之後，選中期刊名，點擊Edit Term..., 在縮寫框內填入相應縮寫，如圖7所示：

圖7

2. 修改完成後，點擊「Update Citations and Bibliography」。如圖8所示。

圖8

期刊名的修改只是眾多細節的一個方面。還有期刊頁碼的顯示方式、作者名縮寫方式等。建議先仔細閱讀投稿期刊的細節要求，再逐條檢查。

有些期刊要求將參考文獻放到腳註中。方法很簡單：首先在Word中添加腳註，然後按照同樣的方法來插入文獻。如圖9所示。

圖9

PS：本文分析實例來自浙江大學范傑老師課題組的文章：J. Am. Chem. Soc. (2010) 132, 9596-9507.

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相比於投稿文章，畢業論文參考文獻則更加複雜。本期內容介紹如何利用Endnote來管理畢業論文參考文獻。主要分為兩大部分：1.如何分章節插入參考文獻？2.如何新建或修改參考文獻導出格式？

如何分章節插入參考文獻？

畢業論文分為多個章節，每一章節的參考文獻位於該章的末尾，而並未位於整篇論文的末尾。具體設置步驟如下：

a. 圖1中所有參考文獻位於整篇論文末尾處。

圖 1

b. 在第一章的末尾處設置分隔符，如圖2。

圖 2

c. 切換到Endnote軟體，在Edit – Output Styles 欄中選中相應的Style，然後在Section選項中選擇分章節顯示參考文獻目錄，如圖3所示。

圖 3

d. 設置完成後，在Word中更新參考文獻即可，如圖4所示。

圖 4

如何設置參考文獻的導出格式？

Endnote中內置了絕大多數期刊的參考文獻格式模板。對於畢業論文，因為沒有固定的模板和格式，所以我們不得不手動設置參考文獻格式。請在寫畢業論文之前，到學校相應網站下載詳細的畢業論文排版要求。根據格式要求可以在Endnote中建立相應的參考文獻輸出格式。輸出格式的設置方式有兩種：一是直接建立新的排版格式（Edit – Output Style – New Style）。二是在已有的某種導出格式基礎上修改。建議選擇第二種方式（簡單，省力）。具體設置步驟見下圖：

圖 5

圖 6 （通過Edit - Output Style - 打開該圖所示對話框）

圖 7

圖 8

圖 9

圖 10

圖 11

圖 12

圖 13

圖 14

圖 15

圖 16

圖 17

圖 18

四、Zotero的使用與特點

A. Zotero的文獻管理能力

在文獻管理板塊，小編陸續向各位介紹了Endnote和Papers。兩者有諸多相同之處，但又各具特色。Endnote如經驗老道的霸道總裁；Papers是充滿藝術氣息的文藝小清新。

今天，小編將向大家介紹另外一款軟體「 Zotero 」。相比於霸道總裁和小清新，Zotero好比無微不至的貼心暖男。我們將分三到四期內容介紹Zotero這位暖男。為什麼「暖男」？待小編慢慢道來。

首先，Zotero是「羅伊茨歷史與新媒體中心」開發的一款免費、開源的「知識」管理軟體。它的管理能力不僅僅是對於文獻，而是涉及書籍、專利、百科以及新聞。好用還免費，你說暖不暖。

在介紹Endnote時，我們就介紹過文獻管理軟體的文獻搜索功能略顯雞肋。日常的文獻閱讀和檢索還是離不開瀏覽器。最初，Zotero的開發者們就直接從火狐瀏覽器出發，開發出了Zotero插件。很多發燒友為了能夠使用Zotero，特意下載火狐瀏覽器。但是火狐無法在瀏覽器領域一家獨大，所以Zotero又推出了桌面版。小編提醒，使用桌面版Zotero時一定要同步安裝瀏覽器插件。只有這樣才能最大限度發揮Zotero的優勢。

其次，Zotero的網頁端「文獻」信息抓取功能灰常好用！貼心到無法想像。無圖無真相，下面上圖舉例：

1. 當你打開Google學術搜索頁面（如圖 1 ）。瀏覽器的Zotero插件就變成文件夾狀，點擊進入就可以選擇要保存的文獻信息（圖 2 ）。當然這樣功能很多軟體都有, Endnote也可以批量導入。Zotero的強大之處在於它能夠盡最大可能在Google中找到PDF全文，並自動下載。好貼心，有木有！

圖 1

圖 2

2. 很多文獻管理軟體都是國外公司開發，其對中文資料庫和文獻的讀取能力比較弱。Zotero則漢化的很好。下圖三為國內常用的知網。搜索並找到相關文獻，通過插件可以直接單獨或者批量保存。這還不算厲害。Zotero的厲害之處在於其可以識別期刊、論文還是圖書。並可以通過網頁直接讀取相關信息。比如：如果你打開的文獻是一篇博士論文，Zotero插件圖標會變成一個博士帽（有沒有感覺一股暖意！！），輕輕點擊就可以將博士論文的全部信息導入Zotero軟體。

圖 3

圖 4

3. 很難想像Zotero竟然能夠辨識豆瓣網。當你在豆瓣看到一本好書的時候，點擊插件圖標，與該書有關的所有信息都導入到Zotero中（如圖5）。至於如何找到全文，等小編下次再介紹了。對於國外的很多與圖書相關的網站，Zotero也都能很好的識別。

圖 5

圖 6

4. Zotero對維基百科有識別能力，當你通過維基查詢相關詞條信息，可以通過插件可以很和諧的導入Zotero。

5. 對於各類新聞網站，比如Newyork Times等。Zotero統統識別。

對於網頁信息的提取，Zotero已經接近完美。同樣Zotero也可以對本地PDF文件進行識別和信息提取（這一功能和papers差不多）。至於Zotero如何安裝，請見下文：

1. 首先到Zotero官網，註冊帳號。不過國內無法有效註冊。只有翻牆才能出現驗證碼（不得不吐槽一下）。見圖7，圖8。

圖 7

圖 8

2. 下載插件版或者桌面版。因為我不愛火狐，所以不得不選擇桌面版+chrome插件（安裝chrome插件也要翻牆）。見圖9。

圖 9

3. 安裝Zotero並打開。打開首選項，設置相關參數。見圖10，圖11。

圖 10

圖 11

如果需要同步或者共享，可以將根目錄保存到網盤裡。Zotero支持絕大多數網盤。

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B. 利用Zotero來管理投稿論文的參考文獻

上期內容我們簡單概括的介紹了Zotero這款軟體。內容包括：如何安裝Zotero、Zotero強大的網頁抓取能力、Zotero與網盤的結合以及Zotero的簡單發展歷程。不得不再次強調Zotero在網頁和文獻信息提取方面的能力極強。Zotero可以名副其實的稱為一款文獻，更準確的說是，知識管理軟體。我們後期還會就這方面的內容進行更深入的分享。其實，Zotero不僅是文獻的管理方面能手、同時也是管理論文參考文獻的老司機。本期內容將從實戰出發，分三個部分，介紹如何利用Zotero來管理投稿論文的參考文獻。

1. Zotero和Word的結合方式：

在已有Word的前提下，正確安裝Zotero，Word中就會出現相應的插件或圖標。根據不同的Word版本和計算機操作系統（PC/MAC），Zotero在Word中的呈現方式略有不同。請見下圖1：

圖 1a

圖 1b

圖1a為MAC系統下Word2016以前版本下的情況。圖1b為Windows系統下Word中的Zotero插件，具體圖標的功能介紹如下圖2，具體用法我們將在下文一一介紹：

圖 2

2. 根據要求插入參考文獻

圖 3

圖3為一篇待插入參考文獻的論文。先將滑鼠放置於文中待插入文獻處。在Word中Zotero欄下選擇Add Bibliography，彈出如圖4所示窗口，選擇投稿期刊和相關格式（比如期刊名自動縮寫）。

圖 4

選擇完成後點擊OK，出現如圖5所示窗口（與Papers的方式很類似）。

圖 5

在圖5所示對話框中輸入相關詞條即可搜索文獻。選中目標文獻，點擊確認鍵，完成文獻引用。如果論文中同一處需要插入多篇文獻，可以在彈出對話框中依次搜索多篇文獻，然後一起插入，如圖6所示。

圖 6

以上這種通過「搜索窗口」來插入參考文獻的優點是方便、簡潔、免於在Word和文獻管理軟體之間的來回切換（來回切換太多次確實會導致眼花，也很容易導致錯誤）。但這種方式的缺點也很明顯。一旦對文獻信息（作者名、題名、期刊名等）的記憶不準確，就無法、或者多次嘗試才能找到目標文獻。為了解決這一問題， Zotero同時推出了經典引用模式窗口。點擊圖5或者圖6中彈出窗口左側Z字圖標，選擇經典視圖模式，彈出如圖7所示對話框，可以單篇輸入、也可以多篇輸入（從這一點來看Zotero比Papers想的周到）。

圖 7

如果需要修改文中某處的引用，首先將游標移至指定應用位置，然後選擇Edit Citation，出現同圖5所示對話框，即可繼續修改和編輯。

3. 參考文獻引用格式的修改

判斷一個文獻管理軟體在引用管理方面的強大與否，關鍵在於文獻引用的智能化程度。因為你所下載的引用文獻（比如RIS格式文件）、輸出格式以及所投稿期刊的要求格式這三者之間有一定的差異，所以當你導入參考文獻後你會發現，雖然你選擇了正確的輸入格式，但導入的參考文獻中還有很多錯誤，如作者名的縮寫方式、文題首字母大寫與否、標點形式、期刊名縮寫方式等等。需要手動修改的地方越少，說明這款軟體越智能。而Zotero在這方面做的很出色，比如期刊名稱自動根據要求縮寫。實例如下：

本文以JACs作為輸出文獻格式，而JACs要求參考文獻的期刊名為縮寫格式。如果使用Endnote和Papers直接導入，本例中參考文獻2和參考文獻9則無法實現期刊名稱縮寫（這是因為2，9的原始Ris不完整導致）。但在Zotero中可以自動實現縮寫，如圖8所示（請對比如何搞定投稿文章的參考文獻？和用Papers管理Papers中參考文獻2和9的初始格式）。

圖 8

雖然Zotero在文獻的智能化導入方面做了很多工作，但還是需要手動更改一些格式參數。下期內容小編將和各位分享Zotero修改參考文獻格式的幾種常見方法。

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C. Zotero修改參考文獻格式的幾種常見方法

接著上期Zotero內容（Zotero 可能是唯一讓你拋棄Endnote的理由），本期將介紹具體如何根據要求修改參考文獻格式。

1. 插入與修改參考文獻

一篇論文從起初動筆到最終發表，必然需要反覆修改。這些修改可能是邏輯結構的大調整，也可能是語句、詞語的小修改。無論是大改還是小修，參考文獻不得不隨之變動。如果是整句或者整段的刪除，請無視參考文獻，直接粗暴的刪除，最後在Word中用Zotero插件Refresh一下即可。如果需要修改某一處的參考文獻或者在文中某處添加參考文獻，直接將滑鼠放置到指定位置，點擊Edit Citation，再根據要求增加或減少參考文獻個數。

2. 在Zotero中更正參考文獻信息

在導入參考文獻時，雖然選擇了正確的期刊輸出格式，但是生成的參考文獻卻常差強人意。比如沒有終止頁碼，作者縮寫名格式不對，題名大寫問題等等。這些問題多需要手動來修改（上期內容已經提及，Zotero已經能夠實現期刊名稱的自動縮寫）。在下例中（圖1），參考文獻按照Nature格式排版。但是參考文獻4因為沒有出現終止頁（這是因為參考文獻4的原始文件中就缺少終止頁碼）。

圖 1

修改方法：首先在網上找到該文獻的終止頁碼。然後返回Zotero，找到並選中指定文獻，在Zotero右側的信息欄中找到頁碼欄，將終止頁碼輸入其中。如圖2所示。

圖 2

信息補全後，返回Word，點擊Refresh即可。如圖3所示：

圖 3

3. 在Word中修改參考文獻格式

參考文獻信息通過Zotero信息欄修改後，結果自動保存，之後可以隨時調用。但是有時只需要一次性改動，並不想影響後期引用。比如在某一篇投稿論文中需要將其中某一篇參考文獻的格式進行變化。這種情況下，可以通過Zotero中的格式編輯器完成。步驟如下：在Word界面下，點擊Zotero中的Edit Citation ，並展開編輯器。如下圖4：

圖 4

4. 選擇和創建參考文獻格式

在創建參考文獻前，Zotero會提示讓你選擇所投稿期刊。如果在默認的目錄內沒能找到你所要期刊，可以去Zotero Style Repository下載。步驟如下：在Zotero窗口下依次選擇「文件」 - 「首選項」 - 「引用」 - 「格式」 - 「獲取其他樣式」，如圖5、圖6所示。在圖6中搜索你所需要的期刊即可。

圖 5

圖 6

Zotero所包含的期刊數目已經十分龐大，完全可以滿足日常投稿需求。萬一還是沒有你所需要的期刊格式，可以去Zotero論壇搜索（https://forums.zotero.org/）。

如果你想要創建自己的期刊格式，可以去CSL官網（http://citationstyles.org）創建。不過很麻煩，還需要有一點編程基礎（這一點沒有Endnote智能）。

關於參考文獻格式的修改，小編只能幫你到這了。下期內容，小編將介紹Zotero和各種插件的聯合運用。

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D. 「Zotfile插件」 — 讓Zotero插上翅膀！

之前有說過，Zotero一大好處就是開源，免費。而軟體開源的好處是，會有很多技術大拿一起再GitHub上面給軟體寫各種各樣強大的插件。Zotero就是如此，藉助於插件， Zotero戰鬥能力倍增，可以讓大家更為輕鬆自如地學習與管理文獻。

今天，小編就為大家帶來Zotfile這個插件，感受下開源軟體的人性化設計。

2. Zotfile 插件的使用

2.1 安裝

直接進入Zotfile的官網進行下載，得到一個zotfile-4.2.6-fx.xpi的文件。

然後打開Zotero軟體的主界面==&>工具==》插件，將會彈出如下的對話框：

我們選擇Extenstions選項卡，找到齒輪按鈕，點擊出現如上圖5所示的插件安裝命令。此時在彈出的插件安裝中選擇剛下載的zotfile.xpi文件，即可成功安裝插件。

安裝成功後，我們重啟Zotero，在導航欄菜單可以發現多出了一個Zotfile Preferences的

設置項，即可說明安裝成功：

2.2. 自動添加附件

小編必須要吐槽Endnote的地方有兩點：一個是需要下載題錄文件，每次都要在網上下載一個Citation的文件，然後用endnote打開，添加到文獻庫中，另外一個就是手動添加附件，當我們沒有許可權下載全文，比如只能從小木蟲或者偉大的Sci-hub網站上面下載全文時，手動添加附件的重複機械都讓小編抓狂。Endnote必須要在所選題錄上面，單擊右鍵，從長長的下拉菜單中，找到file attachment菜單，然後找到我剛才下載的全文，添加上去，如果有支撐材料，不好意思，請再來一遍。。。文獻下載多的情形下，這幾個機械的步驟重複簡直是對寶貴科研精力與耐心的巨大浪費。然而Zotero+Zotfile徹底解放了我們的雙手，讚歎偉大的碼農工程師的巨大奉獻。

下面就介紹下，利用Zotfile的監視文件夾如何方便地實現手動添加附件。

1. 打開Zotfile的preferences，設置如下圖2中所示的監視文件夾，建議設置為瀏覽器默認下載位置。此處小編的監視目錄為D盤的pdfs文件夾：

2. 設置數據儲存目錄，即你所有的Zotero的附件的總目錄，此處小編用了一個同步網盤的目錄，這個目錄需要注意一下，最好設置為Zotero設置下的鏈接附件的根目錄：

這裡，可能有小夥伴表示被各種目錄的名稱搞暈了。但是只需保證，上兩圖中的數字標號3所指的目錄是一致的，就OK。

注意：安裝完的Zotero是絕對路徑的，需要設置成附件是相對路徑，點擊Zotero軟體的設置即可更改，見上圖中4箭頭所示。

3. 設置好之後，我們就可以享受Zotfile插件帶來的方便了。我們以一篇沒有附件的Zotero條目為例，單擊需要添加的條目，使其處於選中狀態，

然後在到偉大的sci-hub網站上面去下載附件，另存為附件為，上述步驟1.中設置的監視目錄：D:PDFs.

再在完成之後Zotfifle即可監測到新文件，然後在屏幕的右下方，會出現如下所示的對話框：

輕輕地點一下，這個對話框，文件即成功地添加到所選條目的附件了。

2.3 歸類附件PDF與重命名

利用Zotfile插件，我們還可以輕鬆地歸類附件PDF。

而重命名也可以從Zotfile的設置選項卡中找到，如上圖的5.重命名的格式也有很大的自由性，愛乾淨整潔的小夥伴可以自行摸索。

值得說明的是，在所有歸類，重命名規則設置好之後，下載附件後，Zotfile都在點擊右下角的對話框時，勤勞的完成所有工作！！

所以，見識到了Zotero自動抓取文獻信息的方便，以及Zotfile的強大，小編便直接把鑽研學習了五年多的endnote棄了。

2.4 自動提取注釋文本

有些閱讀仔細認真的童鞋們，喜歡在PDF上面做各種高亮，下劃線等注釋，但是有沒有遇到像將重要結論或者寫得很贊的英文語句保存下來的衝動？Zotfile插件也能完美地解決這個問題。

注釋提取支持多種主流的PDF閱讀器，下面以小編用的國產PDF軟體--Foxit reader為例，演示一下注釋的提取功能。

我們從Zotero中，直接打開PDF文件，然後在上面實現下劃線和高亮的標註，

然後，在Zotero軟體界面，對應條目上，單擊右鍵，在彈出對話框選擇「Extract Annotations」：

此時條目下面就會自動新建一個名稱為「 Extracted Annotations 」的筆記文件，如下右圖所示：

很貼心的是，在提取注釋的同時，Zotfile在每條注釋下還創建了超鏈接(見下右圖)，點開注釋文本後面的藍色超鏈接，就可以順利定位到你的筆記位置，大家試想，在讀一篇長達數百頁的綜述，如Chemical Review以及書籍時，可以先做高亮筆記，導出注釋，然後想查閱的時候，直接點擊超鏈接，直達目的頁面，非常方便！

註：目前Zotfile支持的注釋格式為高亮，下劃線以及相應的彈出式注釋。如果有文本框或者波浪線等形式的似乎暫時不支持。舉例如下：

可以看出，彈出式注釋，高亮，下劃線所在的文本均成功地導出，是不是很方便？

貼了這麼多內容，休息下，等有時間再來補充Mendeley和Noteexpress的相關使用方法

備註：本文首發於微信公眾號研之成理（rationalscience）以及知乎專欄：研之成理寫作實驗室，歡迎大家關注！

看了一圈，大家的發言都很有價值。但現在的回答中缺少對LaTeX對應文獻的描述。補一個。

我工作環境主要是Macbook Pro，寫論文主要用latex。latex對應的文獻格式是.bib的，可以參考BibTeX這個維基詞條。絕大多數資料庫搜索到的論文都支持bibtex格式（CNKI等國內的資料庫除外），在我寫完博士論文之後，驚喜的發現scholar.google.com現在也支持直接輸出bibtex格式的文獻源代碼了。只可惜精確度還有待提高。

支持用圖形化界面管理.bib格式文獻庫的軟體，推薦使用jabref http://jabref.sourceforge.net/ ，需要首先安裝java支持。優點么，圖形化，跨平台，免費。缺點么，功能比較簡單，與endnote note express之類的無法比。不過如果你用latex寫論文的話，就必須用bibtex，使用.bib格式的文獻庫，jabref就是幾乎唯一的選擇了（除非你像我最開始那樣，用emacs直接編輯.bib文件...）。我2007年開始讀phd以來，圍繞自己研究的這個領域建的bib文獻庫，目前收錄1600篇左右文獻，jabref打開還是很順暢。

jabref也有支持M$ office / open office的插件，當年也用它寫過幾篇word的論文。

但jabref畢竟還是太「簡單」，想要讓搜尋和整理文獻的工作更便捷，去年開始我用Papers這個軟體（只支持mac os x，而且我個人覺得是mac下最好的文獻管理軟體了），目前出到3了，student license 35歐，絕對物有所值，搜索文獻和整理文獻都很方便。推薦3的有一個理由是，與2相比，3支持同步所有文獻到dropbox，這樣筆記本上通過papers管理的文獻庫，轉頭在ipad/iphone上安裝papers軟體，也可以同步數據了（ipad還好，屏幕夠大；不至於真有人會用iphone讀文獻吧。。。）。

papers + jabref足以應付Mac環境下寫latex論文的一般需求。目前這個搭配的不足是：新文獻要導入papers先，然後再導入bib文件先，做兩遍工作。（papers其實也支持直bib格式直接輸出到latex，但個人用慣了jabref，沒辦法。。。）

關於工作流程的見解真的很對胃口。一直希望自己能找到合適自己的軌道，走下去，有效率，某些時候，只需要像機器一樣。

現實是還沒有形成自己讀文獻，存筆記，寫東西的模式。

Mendeley試過，果然是導入整個計算機的文獻就死翹翹。不過PDF識別的功能真的有助於識別重複文獻，避免讀了一遍又一遍，只因為放在不同文件夾或者在不同的渠道遇到。

Readcube也試過，也是導入整個計算機的PDF死翹翹，反省過是否電腦的CPU不給力，沒有答案。

Qiqqia不知道有沒人用過，挺有趣，有思維導圖的功能，也有找出所引文獻和被引文獻的功能。但是，界面和用法太複雜，沒有信心堅持下去。

CNKI對於不複雜的文獻處理還好吧，而且選擇文本右鍵可以直接存為筆記，對於很懶的人來說，是福音。

Endnote用得越多，越有感覺。

有沒有人用過Nvivo，是一個一年一千多RMB的軟體，具有處理文本音頻視頻的功能，本來是用來做質性研究的。但是，它處理PDF的功能也是很強大的。在PDF上做出的注釋可以直接用來編輯。而且，我們不只從文獻學習，還從書本，網頁音頻視頻中學習，它可以把所有相關的東西都整理到一個project裡面。有興趣的人可以試試，有一個月的試用。

順便必須贊一下置頂的回答，關於endnote的使用和處理文獻筆記的慣例，真的是很有啟發。我是方法論控，什麼事情走的不是我設想的，或者我想的不完美，常常不能著手。此乃讀博一大障礙。感謝！！！

2014-3-17 21:25:18

知道了一個更好的軟體 Docear，強烈建議大家試試。

給一個重要的網址，介紹如何利用Docear把文獻管理，PDF管理和寫作結合起來。

http://sciplore.org/docs/how_to_write_a_phd_thesis-ch.pdf

非常非常建議大家去看一下。

不過讀文獻是最主要的，工具只是輔助。

Endnote很好用，但是不支持中英文備選模版（一個與「和」搞死人）、中文模版沒有（當然確實可以自己寫）很煩。NoteExpress 有很多中國人的習慣，但是資料庫性能、軟體內在線搜索能力都弱於EN（誰叫EN是 Thomson 出品呢），插入引文的插件也不是很好用（office2007之後都是）。等他3.0的版本出來後，個人就會選擇付費了。EN是一年一更的穩定周期，NE就是不知道下次更新會是什麼時候。

group分的太細操作起來不如 search；smart group 功能太酷了。

話
說兩者同時用了超過7年了，EN 和 NE 感覺完全是在像兩個方向進化。 EN 在 endnote web
上努力，越來越高端洋氣了。NE在取悅國內用戶下越來越接地氣了。兩者都很好，只是身為用戶太糾結了，為毛這些優點不是在一個軟體上，要是那樣我真願意用
半個 ipad 價格去換。

其他亂七八糟的幾乎都用過一些，Mendeley（一次從EN遷移，我恨死 Mendeley了，不細表） Zotero（個人主力瀏覽器 Firefox）， Notefirst、Refwork 等等。Mac繫上 Paper 聽說是神器，那就不懂了。

Mendeley的社區功能很強大，喜歡找人同行人交流的推薦Mendeley。

Zotero對同步支持很好，多電腦的人可以考慮。Firefox重度用戶可以考慮，同瀏覽器的結合非常好，不用下載ris 等，但這些都是「表面功夫」，一個文獻管理的核心特點來看，比較 EN 、Mendeley、NE，Zotero 不夠先進。

Notefirst 有一個奇怪的 RSS列表（Notefirst http://www.notefirst.com/product/default.aspx?id=0pxdefalut），很有趣，但不太好用，一個個點擊添加太煩了。我很奇怪為什麼不直接集成在 Norefirst中。我手動將感興趣的加進去了（以前使用GReader，翻譯功能對我這種英文不好的人太有用了，因為一期雜誌上真正你感興趣的並不多，內置的translate 方便我快速過濾。GReader對SD的rss支持不好，殘念GReader 要關閉了）。價格也比 NE高，我就不想用了。

Refwork 團隊協作利器，如果你是高數據許可權下的實驗室老闆，推薦。

linux 下的也用過一些，不記得名字了。文獻管理軟體孫尉翔說是資料庫管理軟體，linux 下的都是這個水準，但軟體好用，UE（用戶交互）太重要了，比較一個工具你要是什麼都靠自我調教，真的很累。

文獻管理軟體好不好用是跟實驗室環境有關的，你所在學校、機構有很高的的資料庫許可權，再難用的文獻管理軟體實際上都有一條方便可行的路子。你所在學校、機構連 web of science 之類的文摘庫、SD什麼之類的都沒有，那什麼文獻管理軟體都難以使用。我讀過好的學校、差的學校，現在不在實驗室環境（用著朋友的代理），一言難盡。

如果在國內，你是 office 用戶，個人使用首推 noteexpress。高端洋氣、團隊用 endnote，多用用 endnote 和 endnote web 同步。這兩者資料庫轉換也方便。

CNKI E-Learning 確實很不錯，界面很舒服，用起來也很順手，閱讀學習文獻足夠用

Mac 上的 DEVONthink，招牌功能就是通過 AI 演算法（官方沒提，應該是基於機器學習演算法），根據你已有文獻資料來對新收集的文獻資料進行分類和相似推薦，你的文獻越多這個功能越有價值。

DEVONthink 對各類文件的組織方式很自由，和系統自帶的文件瀏覽器類似，文件怎麼扔進去就能怎麼拿出來，支持無限文件夾，並沒有像諸如 Evernote 等採用自建的存儲格式；除了自身有較強的搜索能力外，Spotlight 里也能檢索到存儲的文獻資料。

不過對 CJK 的分詞支持很弱，所以如果你的文獻里中文居多，那麼 DEVONthink 不是一個好選擇。

剛剛看到一個軟體 CNKI E-Learning, 推薦大家使用

以PDF文檔管理為核心的文獻管理軟體中，最好用的是ReadCube；

以引文為核心的文獻管理軟體中，最好用的是Endnote。

可惜這兩個軟體分別在對方的長項上做的不好，所以只能兩個一起用。

PS：

ReadCube是免費的，Endnote是收費的。

另外，兩個軟體都不做雲同步，我個人的理解是可能涉及到版權的原因。不過ReadCube在2013年初發給用戶的郵件中說它要在今年實現雲功能。

看古文獻和樂譜舞譜的表示連吐槽的機會都沒有…=_=

zotero的使用引導

1 引言

我在閱讀文獻的過程中，發現迫切需要這樣的功能：

對文獻進行歸類，其中重要一點是一個文獻可以屬於多個類別；
對文獻進行閱讀的同步，即我在這台電腦對文獻閱讀做了批註、標記後，換另一台電腦仍能繼續工作，這樣閱讀的思路就不會斷了。

文獻管理軟體zotero+堅果雲網盤能十分契合上述需求，這幾天剛剛對其剛上手，故寫此教程以拋磚引玉。註：以下教程在中文windows 10平台完成。

2 zotero和堅果雲網盤的註冊及安裝

zotero註冊網址為Zotero | Home。文獻管理軟體zotero有火狐瀏覽器版和單機版，單機版名稱為zotero standalone，這裡下載單機版。由於zotero其實本身支持同步，但由於其免費版只有300M，因此可以考慮將同步數據存儲在合適的網盤上。

堅果雲網盤用於存儲文獻、同步。註冊網址為堅果雲官網 - 堅果雲 - 雲盤|網盤|企業網盤|同步|備份|無限空間|免費網路硬碟|企業雲盤。堅果雲的免費版無存儲空間限制，但是每月的流量有限制：上傳1G/月，下載3G/月，這對於文獻來說是夠用的了。另外，堅果雲網盤支持WebDAV協議，能與zotero進行數據同步，配置起來也十分簡單，因此這裡採用堅果雲網盤。
zotero同步也可以搭配其他網盤軟體[1]，然後創建軟連接（windows下使用）使用，比如dropbox。我自己搗鼓了幾次，發現還是實現不了想要的功能，望能成功者告知:-D

3 zotero的配置與網盤的配合

實現zotero和網盤的配合需要對zotero和網盤進行設置。

1.首先打開堅果雲網盤網頁端，點開賬戶信息&>安全選項，下面有個第三方應用管理，用於授權第三方 WebDAV 應用訪問雲空間。然後添加應用，等會會生成該應用的密碼。如下圖所示，伺服器地址將會用於zotero的同步設置上

2.打開PC版zotero standalone，點開工具欄的工具&>首選項，然後進入同步選項。然後

Zotero同步伺服器框中，填上你zotero賬號和密碼。
文件同步框中，選擇使用WebDAV，然後填上上小節中所述的堅果雲網盤伺服器地址，賬戶和申請的應用密碼。

3.設置好堅果雲網盤在PC本地的存儲目錄，比如我將文獻都存儲到F:MyNutstorezotero。zotero本地的存儲目錄設置問題不大，可以忽略。然後在剛剛上小節所述的zotero首選項中，點擊高級，進入高級頁面，進行如圖所示的設置。

註：這裡最重要的是連接附件根目錄的設置，「在根目錄中，Zotero對鏈接附件使用相對路徑，因此只要文件結構相同，您可以在不同的電腦上訪問這些附件」這句話提醒在其他的電腦也要保持相同的目錄結構

4.其他設置。在zotero首選項的搜索頁面中，檢查更新；在導出頁面中，可以設置引用文獻的默認輸出格式。

4 zotero與谷歌瀏覽器的配合

在chrome的網上應用商店安裝Zotero Connector插件到瀏覽器上。該插件可以自動抓取網頁學術信息（比如書籍、谷歌學術、維基百科等）到zotero里，稍後介紹。

5 zotero有用的插件

安裝插件的方法為，下載該插件到電腦里，然後手動安裝，步驟為：打開Zotero，工具&>插件&>右上角圈圈&>install add on from file（從文件選擇添加插件），然後選擇文件後就可安裝啦。

ZotFile：對PDF文件進行分析，提取元數據等。下載地址Advanced PDF management for Zotero
Zotero Scholar Citations：獲取文獻谷歌學術引用數。下載地址beloglazov/zotero-scholar-citations
歡迎補充其他有用的插件呀

6 zotero的特色功能

至此，已完成對zotero的基礎配置，接下來介紹一些常用的功能。

自動抓取網頁學術信息。zotero可搭配谷歌瀏覽器對網頁學術內容進行抓取，比如用谷歌學術搜索文獻後，安裝的Zotero Connector插件點亮，表示可以下載，點擊該圖標即可。可移步[1]進行學習。
文獻管理。先把文獻下載到堅果雲本地目錄里，從zotero面板導入文件鏈接，然後對該文件滑鼠右鍵提取元信息，然後再對附件右鍵-附件管理&>重命名附件。（步驟如下圖所示）