我們課題組想買伺服器跑生物信息學的數據，有必要嗎？

01-12

我們課題組都是很破爛的計算機，所以有時候一個數據要跑一個月。。想想就嚇人，所以想買幾萬塊的伺服器來跑，我想問下伺服器主攻方向好像不是跑數據？cpu是不是不強勁？因為我覺得伺服器優勢貌似都是大吞吐量的io？
還是買幾台性能強勁的計算機來跑數據比較合適呢？

建議你買一個。

伺服器不見得會讓你的程序跑得更快。但伺服器可以非常穩定地保證跑一個月不掛（有ECC校驗），台式機不太容易做到。

然後，伺服器通常有硬碟陣列，你將來數據多了就知道好處了。

最後，伺服器好歹可以弄雙路的，而且E5 CPU的總計算能力還是強。如果你程序的並發程度高，提升還是會明顯的。特別是在你原來台式機很破的情況下。

我們實驗室有倆戴爾的雙路2U伺服器，都配滿了硬碟或者掛了額外的陣列，每台在5W左右。如果你不配那麼多硬碟，價格可以便宜一半。

伺服器的優勢是穩定性。

要提高性能，應當從優化軟體入手，增大並行計算量，充分利用計算機群和顯卡加速。

對於要跑一個月才能出結果的程序，這不是可以簡單依靠硬體升級來獲得改善的。

優化這種事情，哪裡有通用解決方案呢？都是依照每個案例的特殊情況進行處理的。

說用GPU加速的，用超算來算的，都TM扯淡，憑這不過百字的問題描述就給別人開方子不是坑人是什麼？。一個問題本身難以並行計算，你買10000塊GPU，用天河來算也快不了。

把預算的一半拿出來，找幾個有經驗，有實力的程序員來幫你們寫程序才是正道。否則憑這點錢，連個水花都砸不出來。

首先伺服器也有專門計算用的，我們院里就有一台浪潮的伺服器，分了七個計算節點來跑並行計算。

實話說，如果沒有專門的管理員，從搭建並行環境到寫並行程序一整個下來一般人搞不來的，這些活都是苦逼的It民工的幹活= =，而那些要跑程序的哥們，老師會分帳號給他們，讓他們自己傳程序上去跑。

所以，真的想花幾萬塊來解決這個問題的話，買伺服器明顯不是好主意。不知道題主具體跑的是什麼，所以也沒有辦法給出什麼具體的建議。

恩，其實我真正想說的是，這點錢真的不夠好嘛，一台正兒八經的伺服器單單硬體都幾十萬，請個碼農寫程序一個月工資也不低，買國外的雲計算服務又不一定適用啊= =

苦逼的小管理員路過...

應該先確定性能的瓶頸，是浮點運算能力？內存？IO？

再考慮軟體的限制。如果是商業軟體，它是否支持伺服器、集群？正版的話還要考慮授權的問題。自編程序的話，要考慮程序是否有能力擴展到多核、多CPU。

為什麼不考慮公共雲？

不知道GAE或者BAE能否滿足題主的需要

我覺得這種事情去問問老闆比來知乎提問好的多

為什麼自己買，而不是不試試 vps paas 之類的東西

現在有沒有伺服器採購計劃？

先分析一下你們程序運行時時間消耗在哪些環節了，再根據情況優化代碼和增強硬體吧。

如果有實力自己做軟體跑，那麼你需要並行運算很強大的GPU。很多時候好一點的台式機自己配一台也夠了。

如果可以用Mathematica處理數據，這東西支持聯網並行計算；或者買Wolfram Alpha的Pro帳戶。

花幾萬配台塔式伺服器（其實就是一台配置高的PC機，怕你不懂），類似於什麼96G內存，什麼12核24線程的就可以了，信我的，沒錯的，什麼買幾台強勁的計算機一塊跑（分散式？），或是弄個嚇死人的集群（裝B拉項目專用）都是耍牛氓，因為到最後你會發現，你們課題組用不了那麼牛逼的東西，或者分析數據時的軟體根本並行不起來而內存又非常的不夠用，恩，就是這樣

強勁不強勁主要看配置, 伺服器和計算機沒有本質區別

具體的我不知道，但是我知道一個北大的學姐就是生物這方面的博士生，他們用的是伺服器。所以，以此推斷，是有必要的。