生物信息雲分析平台,哪家做得好?求推薦
01-12
經歷幾次伺服器宕機,特想把已有數據放在雲伺服器上,但是不知道哪家在數據安全性和數據分析服務上更專業,讓用戶更放心的。
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在我的時間線上看到這個問題,正好我年初也做過類似的評測,具體可以看我的分享。簡單說下我的看法。
國內真正做生物雲計算做的不錯的公司就那麼幾家,首推華大BGIonline,此外做的不錯的還有百邁客BMKCloud,烈冰NovelBrain,聚道GeneDock。簡單說下他們的特色:
BGIonline,NovelBrain,GeneDock都可以定製自己的pipeline。
BGIOnline業內標杆,無論是界面,數據樣本存儲API還是支付系統等各方面都做的相當優秀,分析工具也很全面。可以跟七橋一拼。BMKCloud不能自定義pipeline,不過上手非常簡單,且勝在個性化分析工具眾多,各種取交集、聚類圖等小工具都有了,甚至我記得還有預測蛋白信號肽的小工具。資料庫整合也不錯。NovelBrain要稍微學一下,其pipeline設計的很適合複雜的個性化分析,且分析工具也不少。樣本-數據管理模塊很實用。
GeneDock面向B端用戶和生物信息專家,所以API介面等做的很好,當然pipeline也不難用。此外其主要針對人類數據,人重分析速度很快,其使用了sentieon加速軟體,可以4小時分析完一個人類重測序。其他的雲系統還有一些。
葯明康德的系統我聽朋友有在測試,不過我沒有親自感受過。美吉的i-sanger我大體看了下,跟百邁客的有點像,但是還有很大的改進空間。GCBI號稱是給醫生使用的,基本上不適合定製和科研。中科晶雲、華點雲、海雲這些我只是聽說,沒有用過,不做評價。GeneDock
強烈推薦百邁客雲平台
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