在生物信息學領域,美國和歐洲的研究方向有什麼區別嗎?

特別是針對癌症和生物信息學的交叉領域,美國和歐洲哪些研究機構比較強?


謝邀

可以關注德克薩斯癌症研究中心

我不太懂什麼叫生物信息學和癌症的交叉。。


非常可惜的是我是研究病毒的,不做腫瘤。但是歐洲生物信息比較厲害的有EBI和Sanger,他們都招phd。具體方向你就得去看他們主頁了,他們研究所都很大,所以各種方向都有。哥本哈根大學的生物信息也很厲害,不過主要是做古生物的,跟你要求不搭邊。德國有幾家跟EBI有合作,是誰我就不知道了,應該能查到。美國據說MIT很牛,但是具體是誰說不清楚,我沒在美國混過。


不請自來。我不是很清楚研究方向有什麼不同。這裡就是提供一些牛的單位,供你參考:

這是Biostar上的答案:

List Of Genome Sequencing Centers/Institutes

這個是人類基因組計劃2001年發表在Nature上的文章列出的參與單位,現在癌症和生物信息結合的很多人都是來自於當時的這批人:


謝邀~

對歐洲不是很了解,美帝的話生信圈內做cancer的非常多,主要方向有癌症早期診斷、癌症發病機制、癌症的精準醫療/個體化醫療等等。

首先,圈內非常重要的資料庫The Cancer Genome Atlas (TCGA)的主導者都在美帝,而除了TCGA這個非常大的腫瘤基因組資料庫是一大優勢外,美帝這邊各大醫院與實驗室聯合的wet lab和臨床平台也為前期的計算部分提供了非常優質的樣本源及後期非常高效的驗證平台,可以說整個研究體系是非常完善的,因而,無論你是注重測序數據挖掘演算法開發的實驗室、針對某一種癌症進行分子分型的實驗室,還是癌症治療藥物個體化差異的實驗室,都可以在這個超大的沙漠里淘出金塊。

圈內比較前沿的在美帝的平台有MD Anderson Cancer Centre、Broad Institute、不少醫學院藥學院及某CS大校,題主可以根據自己感興趣的方向看看文章和文章的作者單位,有精力的話和作者郵件談談人生,這是入圈比較快的方式。

希望可以對題主有幫助,最後謝謝閱讀~


不知道區別,但感覺腫瘤生物信息學方面美國的較多。舉個例子,腫瘤方面最重要的資料庫TCGA是美國人主導的。

美國好的研究機構,比如Broad Institute;側重腫瘤的話就是MD Anderson也就是德克薩斯癌症中心,號稱美國最好的治療癌症的醫院,裡面有專門做腫瘤生物信息研究的。

如果對某種特定組織類型的腫瘤感興趣的話,可以去搜TCGA發的該類型腫瘤的文章(一般是在Nature上),看看下面的作者單位就知道了。


推薦閱讀:

mRNA-seq技術能篩除掉Pol II 轉錄的其他非編碼RNA嗎?
生物信息學入門需要具備什麼能力?
Perl,R,Python在生物信息學中分別扮演著怎樣的角色?
複製出來的人是否於原來的人擁有完全相同的記憶、世界觀和價值觀?

TAG:生物信息學 | 計算生物學 | 基因組學 |