bioinformatics歐洲或澳洲的phd program申請者一般背景如何?哪些機構實力比較雄厚?

如題,希望在讀的或者畢業的提供下關於對申請者背景要求的信息,生物學方向的學生(國內碩或本)自學python和R後競爭力和CS或者math背景的學生相比如何?在歐洲和澳洲哪些機構的bioinformatics研究實力較雄厚(發表文章和經費)?


看運氣……

特別是,學CS和math的娃大多對生物沒興趣,所以這塊還得招能做CS的生物娃。

bioinformatic 的面並不寬,如果我沒理解錯主要還是集中於數據挖掘。

system biology 的招牌很大,做什麼的都自稱是做系統生物學的,但是其實行內人知道,現在誰做的都不是真正的系統生物學。

比較具體的方向還有:

分子模擬/藥物設計,用各種計算化學的軟體。

生物物理,這貨也是個筐,說不明白自己做什麼的就說自己是做生物物理的。這塊上到搭顯微鏡、玩軟X射線,下到折騰蛋白,離子通道……生物力學,生物礦化,想扔這個筐都沒啥問題。

現在所謂「交叉學科」比較多,就是說,這個實驗室可能有做有機的,無機的,計算的,就缺一個做PCR的;可能有做雜交的,純化的,就缺一個建庫的;可能一個部門的人都是做計算的,只有一個組做實驗,看看這群傢伙計算的靠譜不靠譜……可能性真的很多,你永遠不知道會有怎樣的職位等著你。

第二個問題,只說德國我知道的機構。

馬普系列,你最好把幾十個所,名字稍稍相關一點的,都點開來看看大方向。不要因為名字看著奇怪就放過去。

比如我們所叫做膠體與界面所,五個部,理論部一群算分子馬達和基因組進化的,生物材料部一群做生物力學的,生物分子部反而是一群做有機合成的。

我們隔壁的植物分子所,一群做代謝途徑的,還有建資料庫的。

德雷斯頓的計算生物所估計你會重點看,可是另一個分子生物所(如果我沒記錯名字的話),我知道有個師兄跑去做計算了。

哥廷根有生物物理所和「動態系統所」,其實兩邊做的東西重疊很多……

以上是我申請時候關注過的。

此外海德堡還有個癌症中心。我一個師姐應該是去那裡了。

加油。


不一定要走bioinfomatics,System biology可能更好一些。說實話和數學計算機的競爭力沒法比,但是我們的長處又不在這一方面。他們會寫程序,我們會構思程序,我們會用數據,會從數據發現結果,這才是我們的優勢。對澳洲歐洲不太了解,不建議純去生物信息學的實驗室,現在做以前分子啊之類大老闆的實驗室都在招相關人才,可以去試試。


不需要和數學背景的比吧,因為一個生信實驗室既有生物背景又有計算機背景,甚至數學、物理背景的人,有個生信老闆是物理出身就很喜歡招來的物理出身的博後。

就我自己覺得生物背景的學python、perl都比較容易(僅限於生信所需要掌握的程度),計算機數學背景的要對生物學有一個系統的理解相對來說比較難。

反正別管什麼出身,加強自己的能力優勢就會增加一點。另外還要看申請的老闆看重什麼,我自己是計算機基本小白,生化也不及格,面試時居然因為英語好被老闆看中了......讓我對這個世界的不確定性又加深了認識......


請問,什麼是CS?


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