DNA雙螺旋結構中大溝小溝的作用是什麼啊?

01-12

先佔坑。。。

以下內容引自或參考（以下非標準引用格式）：

J.D.Watson etc. 編著，楊煥明主譯 | 《基因的分子生物學（第七版）》 | p86~87

1.大、小溝的結構基礎

在分子的世界裡，結構和化學鍵可以解決所有（如果不是絕大多數的話）問題，因此了解大小溝的結構基礎是必要的。

「鹼基對上凸起的兩個糖（糖苷鍵間的夾角）之間的角度大約120°（指窄角，廣角則為240°）」，「結果，當越來越多的鹼基對上下堆積起來時，其一側糖間的窄角就形成了小溝（minor groove），而另一側的廣角就形成了大溝（major groove）。（如果糖和糖之間呈直線相對，也就是180°的角度，那麼所形成的兩個溝大小相同，不存在小溝和大溝之分）「。

2.大溝中有豐富的化學信息

考慮到上述存在於糖苷鍵間的夾角，我們可以想像到鹼基對暴露在大、小溝中時的形狀（圖1）。其中A、D、M、H（紅色標示）分別表示氫鍵受體、氫鍵供體、甲基和非極性氫，這些鹼基對錶面的特有模式可以分別出究竟是A：T、T：A，還是C：G、G：C之間在配對。

換言之，大溝中的分子表面提供了特異性信息，為和蛋白質等大分子的互作提供了結構基礎。

圖1.鹼基對邊緣的化學基團暴露於大溝和小溝中

14.12.25

題主我錯了T_T

我太無知了！我終於找到答案了!

『怒改答案！』

樓上是對的！確實跟轉錄因子有關！

轉錄因子又叫反式作用因子，一個完整的反式作用因子通常有3個主要的功能結構域：DNA識別結合域、轉錄活化域和結合其他蛋白質的調節結構域。

其中有一種DNA識別結合域叫同源結構域，在它所含的至少兩個 α螺旋中，其間有由短氨基酸殘基形成的「轉折」，而第三個 α螺旋與DNA大溝相互作用是同源盒蛋白與DNA結合的主要力量。結構域N端伸入到DNA小溝中，成為與DNA的第二個特異性接觸位點。

Merry Xmas～

14.12.26

我又發現了一個作用。。。

做實時熒光PCR的時候，熒光染料SYBR Green I 是嵌入到DNA的小溝里的。

鹼基側面的功能基團暴露在大溝中，DNA結合蛋白往往結合在大溝中，DNA與蛋白質相互作用時，蛋白質可以準確識別其中的鹼基對，小溝的生理意義不造(?ω? *)

先佔坑

可供轉錄因子什麼的插入結合。

主要起調節作用。

PS：個人知道的比較少，請大神作答吧~