gRNA中連續的 T(RNA Pol III terminator)到底會不會影響CRISPR效率?
01-08
根據 protocol 上面說 TTT 是 RNA Pol III terminator 信號會影響gRNA效率,可是我們平時常用的gRNA構建載體上的gRNA骨架上也有連續的 TTTT,請問這到底應該怎麼算呢?
最近在幫忙檢查編輯失敗的gRNA設計,已經碰到3次設計裡帶4個T的情況了。我自己設計的話是會避免這種情況,但是對於別人的設計我應該給他指出並要求他們重新設計嗎?
由於gRNA的設計,目前還處於玄學狀態,所以那些雷區,不管是真的還假的,都要盡量避免。在gRNA中間出現連續T,會導致gRNA轉錄提前中止,所以到時候出來的gRNA就不完全。從理論上推導的話,這個說法完全成立。
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