在醫學圖像領域，python可以取代matlab嗎？

01-07

你好，我是ImageJ的開發者之一，現在我推出了更為強大，擴展更方便的ImagePy，依然開源免費，基於Python開發，可以輕鬆接入Scikit-image，OpenCV，ITK 等任何基於Numpy的第三方庫，讓開發變得無比高效和輕鬆。

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細胞計數

圖像匹配

地表重建地表重建地表重建地表重建

三維重建

目前開發，文檔，推廣都只有我一個人在做，希望更多的圖像處理愛好者多多支持，更多信息請關注 ImagePy 開源圖像處理框架 - 知乎專欄

還有比MATLAB的圖像和生物工具箱更專業的嗎？人家賣那麼貴是有原因的，雖然那麼貴但好在什麼東西到了中國都有盜版。這麼說吧，對你來說MATLAB和Python都免費，那你是選原價那麼貴的東西呢？還是原價本來就免費的東西呢？

python完全能取代Matlab。實際上身邊很多人就不用Matlab做醫學圖像方面的research

有幾個原因。

Python有人說是個glue語言，就是可以把一些其他語言寫成的腳本，軟體等，用python做個wrapper。醫學圖像經常需要處理大量文件，多個目錄，各種預處理，需要各種不同的軟體。Matlab不擅長處理這些，python更好。

如果直接用python寫演算法，scikit0-image等python的工具已經具備基本的圖像處理的而功能。Matlab裡面有些所謂高級演算法，一般也用不著。如果處理3D的數據，演算法包當然首推ITK。樓上說的ITKSnap就是基於ITK的。這個跟matlab沒關係。文件格式，Python支持nifti等很多格式。

另一個3D slicer處理三維圖像的軟體，也是有python介面的。這是主流的醫學圖像的開源軟體。還有個Mevislab，好像也有python介面。

python作圖和Matlab相比，差不多，看個人喜好。

我在boston Mabla工作的同學說，他們公司現在Matlab都不怎麼開發，專註企業用戶，專註simulink了。

上邊有人問「值化、邊緣檢測、濾波、骨骼化、形態學上的膨脹與腐蝕、成像後的數據格式轉化」，這些都可以在python裡面做，ITK還有python借口，可以處理三維圖像，當然也可以處理二維。

未來是python的。

Matlab的庫全很多，python更偏重底層，處理速度要快一些。但是就我做圖像處理的經驗Matlab就是試演算法的，要做實裝還是得用c編寫。

update at 2016/05/18

至少目前為止，在學術圈不太可能

Matlab和python我都用過，從我個人的經歷來看，我用python主要是處理大量數據，而讀研時的方向是醫學圖像處理，基本都用Matlab進行圖像處理和分析，不用python

Matlab相對於python，至少有四個好處:

1、Matlab用來處理圖像時間更長，開發者也多，身邊的人都在用，有這樣的使用氛圍。而python是通用的，哪裡都能插一手，網路、圖像、計算等等都行，當然也有Python Imaging Library這樣的東西，但功能太簡單了

2、圖像處理所需要的別的軟體，像itksnap一類的，採用的數據格式nii都有專門的Matlab軟體包能進行格式轉化，而python我沒聽說可以這麼做

3、Matlab醫學圖像處理的軟體包更多，資源豐富，在看別人的論文的時候，找到的代碼包也都是用Matlab寫出來的，這種情況下其實很難換用python

4、Matlab繪圖方便，而且debug功能也很好，能在workspace里看變數

Matlab支持的語言很多，支持C／C＋＋，也支持python，甚至能調用vba和sql（有人說python也行，這個可能是我python研究得不夠吧，我很少用python除了數據以外別的功能）。具體的使用例子，像CT／MRI一類的圖像以及光聲成像設備產生的細胞和血管成像，這些圖像的處理涉及二值化、邊緣檢測、濾波、骨骼化、形態學上的膨脹與腐蝕、成像後的數據格式轉化，血管的trace都是能用幾句Matlab代碼就能實現的，但我沒用python實現過

有人覺得如果python能完美替代Matlab，也和我說說怎麼用python對下面這種圖像進行skeletonization唄

不能，很多庫python都沒有。而且2014b的matlab已經支持python

matlab的確非常好用，不過感覺python配上專門的package也非常強大，甚至勝過matlab在相應的地方。比如目前做的一個project用vmtk就非常好用，matlab就略遜一籌。另外CT reconstruction用C++和python也很普遍。不過一般配matlab一起用的。