細胞質中含有RNA酶,它是怎麼做到只分解那些需要分解的RNA的?
01-06
有意思的問題。舉一個不恰當的比喻...假如在細胞內有一個城管大隊,他們的任務就是清掃RNA。他們是不是能夠辨認出每個需要降解的RNA?還是對RNA睜一隻眼閉一隻眼?
在細胞內的RNA有一個總體的半衰期。RNA的降解是隨機的,但不同RNA降解的速率不同。比如rRNA,是相當穩定的,因為有核糖體蛋白質的保護。而一些機制,比如細菌的Hfq系統,可以導向特定的mRNA序列並加速其降解。
這時候我打算提到這篇近期的文獻。
這篇文章提到的是 RNA 的化學動力學研究,方法就是對細菌使用用smFISH來精確定位特定 RNA。這個動力學方程組包括了我們感興趣的生成、降解各項,旁邊的示意圖淺顯易懂地表現了方程的涵義。通過實驗來確定各個係數就是這個研究的目的。感興趣可以閱讀原文及 SM。
如果你想了解 RNA half-life 的更多數據,在 bionumbers 查找相關內容就可以找到很多結果。http://www.bionumbers.hms.harvard.edu/search.aspx?log=ytask=searchbytrmorgtrm=RNA+half-life更廣泛地,RNA本身的結構決定它的功能。如果考慮RNA的三維結構,問題就遠沒有這麼簡單了。
文獻入口(pubmed):http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25792329Polyadenylation - Wikipedia人體的mRNA末尾會有一段完全由腺嘌呤組成的片段:——AAAAAAAA。這個片段會逐漸縮短。完全消失就表示這個mRNA要被水解了。
隨機分解似乎沒有什麼影響
主要是酶的專一性。不同的RNA酶識別不同RNA的序列甚至是RNA的高級結構,然後在作用位點上咔嚓一刀,這是最基本的原理。還有RNA自身容易形成莖環結構,能增加自身的穩定性。這種細胞內的調控還是挺精細的,生物真是神奇啊~
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