如何有效的看文獻~?

在寫一篇論文時,總是要看很多論文,但是如果不好好的總結,很快就會忘記,尤其是外文文獻,有什麼好的方式,軟體等


謝david zhang邀,雖然並不認識你就是了n(*≧▽≦*)n

文獻的閱讀方法根據目的大致可以分為兩類,第一類即是為了了解這一領域的進展而去粗略地讀,第二類即是想對文獻所描述的工作有詳細的了解而去細緻地讀。

其實很多時候我們談到『讀文獻』這個概念只是包含了前者的略讀,就我自己而言做的最多的也是略讀的工作,因此我打算在這裡講一下略讀文獻的一些小trick。

=====偽化生的分割線=======================

以我最近讀的這一篇文獻為例

https://sci-hub.io/http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ja508799p

先看看文獻的標題:Nucleophilic Substitution Catalyzed by a Supramolecular Cavity

Proceeds with Retention of Absolute Stereochemistry

中文大意:超分子空穴催化的保留原來立體構型的親核取代反應

化學狗看到這裡,這篇文章的主要工作就大概的瞭然於胸了,作者應該是做了個MOF(mental organic framework)然後在裡面的空穴里做了個親核取代,居然保持了原來的立體構型,簡直excited!於是這個時候心中就有了一堆問題:

  1. 這些親核取代的底物是什麼玩意?
  2. 為什麼能夠保持原來的立體構型?(一般的親核取代會構型翻轉)
  3. 那個MOF怎麼做的?

於是略讀文獻第一步:讀摘要

ABSTRACT: While the reactive pocket of many enzymes

has been shown to modify reactions of substrates by

changing their chemical properties, examples of reactions

whose stereochemical course is completely reversed are

exceedingly rare. We report herein a class of water-soluble

host assemblies that is capable of catalyzing the

substitution reaction at a secondary benzylic carbon center

to give products with overall stereochemical retention, while

reaction of the same substrates in bulk solution gives

products with stereochemical inversion. Such ability of a

biomimetic synthetic host assembly to reverse the

stereochemical outcome of a nucleophilic substitution

reaction is unprecedented in the field of supramolecular

host?guest catalysis.

講真,除了交代一下反應的底物是含有苄基的手性物質之外,這個abstract沒有講任何有效信息。

於是略讀文獻第二步:讀圖表

誒呦,貌似解決了另外一個問題對不對,催化劑是一個有手性的正四面體MOF,自組裝的方式是配位反應,配體和金屬原子在圖上一目了然啊!給出這張圖基本上就能做出這個籠子啦!

底物是苄基醇的亞胺酯,文章中涉及的反應好像就是溶劑解反應。到這裡的話作者的工作就知道個大概啦!

那麼,實驗的結果是怎麼樣的呢?肯定還有圖對不對?

作者比較了傳統的催化劑5和本文中提到的MOF的催化效果,可以看出產率跟ee(對映體過量值)都很高,說明反應的選擇性跟催化效率都是非常吼得。

誒,好像出現了一組奇怪的組對不對?那個第六組是怎麼回事啊?

其實就是當籠子的空穴被填了之後還是否有這樣的催化活性,這一組的結果說明了催化的選擇性有賴於那個籠子的空穴。

通過之後的圖表都可以看出,文章中做的反應都是苄基碳上基團的親核取代。這時我們好像還有問題沒有解決,那就是這個反應為什麼就能保持立體構型?

作者還是非常良心的以一張圖回答了這個疑問。

(⊙o⊙)哦,正電的中間體被萘環的富電子體系吸引了,於是就以這樣的形態固定在四面體內部,離去基團和親核試劑的進攻都受到了籠子本身位阻效應的影響,於是產物難以實現構型翻轉,因此就保持了原來的構型。

讀到這裡,整篇文章的脈絡就十分清楚了,作者首先搭建了一個手性的四面體MOF,然後用它包合了很多底物,在這些底物的苄基碳或鄰近基團上做了親核取代反應,發現了產物能保持原來的構型,這個excited的反應機理就是因為底物和籠子的π-cation相互作用和空間位阻協同導致了保留構型。

最後,略讀文獻的最後一步,讀結論

In conclusion, solvolytic displacement reactions that normally

undergo inversion of stereochemistry in bulk hydroxylic solvent

have their stereochemistry reversed when the substitution takes

place within the cavity of K12Ga4L6 nanovessels. To interpret

these results, we propose not only that the cavity of the host

assembly can stabilize the developing positively charged

intermediateinthetransitionstatethroughcation?πinteraction,

butalsothatthenaphthalenewalls ofthecomplexblocktheback

side of the carbocation and thereby control the stereochemical

outcome of its substitution to give products with high levels of

overall retention. To our knowledge, this observation is

unprecedented in the field of catalysis by supramolecular host

complexes.

大致和我的猜想是一樣的,所以剛才已經通過了略讀,搞清楚了這篇文章的主要工作,說明之前的理解是正確的。

因此,讀這篇文獻的例子告訴我們,略讀一篇文獻的方法其實就那幾個步驟:

  1. 讀標題,確定文章的大致內容,提出關於文章內容自己想知道的問題。
  2. 讀摘要,確定作者在這方面的主要工作,試圖解答自己的問題。
  3. 讀圖表,詳細了解作者在文章中做了些什麼,結果怎麼樣,這是解決自己之前提出問題的重要環節,文章的很多問題都可以在這一步得到解決。
  4. 讀結論,確認自己是否真的理解了作者的工作和這項工作的意義,通常在最後作者會展望一下這篇文章或者這個領域的未來方向,這對自己的科研也是非常有意義的。

所以讀文獻並不是一項特別難的工作,最主要的就是要多讀,熟能生巧。當然啦,作為一個每周讀兩篇組會上做個pre的弱雞三無本科生,這只是我的一點點讀文獻的經驗,僅供參考哦~n(*≧▽≦*)n

關於作者在樓上答案裡面提到的那個問題我給出我自己的一點建議:

第一,讀完文獻之後可以使用文獻管理軟體的功能做進一步的拓展

第二,也可以利用PPT來做文獻閱讀的筆記

第三,計劃好自己要看些什麼,比如像我最近就只讀一個課題組某一方面的文獻。

希望能夠解決你的問題?(^?^●)?


看書也好,看文章也好,一般還是有一個步驟的。

  • 最開始是先看大致框架,對於文章來說就是看摘要

  • 然後是看主要內容,對文章來說就是這篇文章的圖和表
  • 到這個地方就要做一個判斷,還要不要讀下去

判斷的依據當然是看你的需求了,需求的話又會根據當前研究進程情況有區別。所以碰到一篇文章,看完摘要和圖片以後,可以先存起來(文件夾管理,evernote管理,文獻管理軟體管理都行,隨你,我是用evernote的),如果是圍繞一個主題進行閱讀的話(比如關於間充質幹細胞成骨分化的信號通路研究)除了看現有的綜述以外,自己也可以用excel表格對於碰到的文獻做一個歸類,一般我的excel表會有這些數據項:文章題目,鏈接,明星分子(某個經典的信號通路),牽扯因素(比如某個沒什麼人聽過的小分子小蛋白),結果性質(正向調控還是負向調控),對於自己的用途(為什麼要存下來),其他可以自己看著加。

實際上

實驗萬事屋有一篇推送可以看看

http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA3ODU1NjUyNw==mid=2652323637idx=1sn=3191676dd1eaf5f54d43effd9ca31a33scene=0#wechat_redirect

最近右推薦了一個叫做ferret的chrome插件,推薦試試

http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA3ODU1NjUyNw==mid=2652323777idx=1sn=e34ea4bce008c79b117be5fc82cbc3cascene=0#wechat_redirect

另外

使用第二語言的時候IQ會降個10多點,所以確實是會覺得更難看懂。


謝邀

忘記看過的paper是很正常的,而且不需要去記住別人文章里的具體細節,記住文章講了一個什麼故事或者你從文章里學到了什麼知識點就OK,具體細節需要寫Introduction的時候再回去找。

至於筆記,在讀的過程中高亮自己覺得有用的信息就好了,以後再看 (哪怕忘了這篇文章講了什麼)翻到自己高亮出來的句子也會很快就想起來了。

文章從高引用開始看 (google學術里幫你排好了),從綜述開始看,如果覺得需要再去看綜述裡面引用的文章。一個研究方向大概會有那麼30篇-50篇很經典的引用率很高的文章,這些文章細細看 因為可能涵蓋了你所需要的基礎知識面,其他的看abstract和intro就好了,因為實驗部分完全是實驗室獨立的,兩個不同的實驗室用同一個方法可能得出不一樣的數據,所以我搭建好了自己的實驗裝置以後就不再看MM了。

最後我用endnote管理文獻,推薦使用!


題主,你問的不是=很詳細啊,我只好先直接把我在知乎上對另一個問題的回答摘過來。你可以先看看。

作者:劉知溪

鏈接:英文文獻閱讀時,如何做筆記? - 劉知溪的回答

來源:知乎

著作權歸作者所有。商業轉載請聯繫作者獲得授權,非商業轉載請註明出處。

個人的理解,文獻閱讀分三個階段。

第一個階段是學習基礎知識的階段,就是你拿到一個新課題,首先要解決一些基本概念的問題,這個階段建議以讀中文博士論文為主,具體的方法同第二階段。

第二階段主要是分類和細節記錄。

分類的條目包括:要不要引用、可以引用到文章的哪部分、有沒有讀過和簡單的幾句話評價等。所以你需要一個分類完善的文獻管理軟體,我推薦Noteexpress。除了逼格略低於Endnote之外,NE有幾大優點:

1. 中文,操作容易上手;

2. 大部分學校購買有正版(請自己到NE官網查詢);

3. 分類項目多於endnote,如下圖紅色部分均可以用於分類:

amp;https://pic3.zhimg.com/956ba4ff069dc2b50f04122ea7270bb2_b.png&" dw="1273" dh="54" w="1273" data-original="&https://pic3.zhimg.com/956ba4ff069dc2b50f04122ea7270bb2_r.png" data-editable="true" data-title="zhimg.com 的頁面">https://pic3.zhimg.com/956ba4ff069dc2b50f04122ea7270bb2_r.png&"amp;>

另外,可以加標籤,也可以設置多級目錄,也都是分類辦法。

而且你看到了,有影響因子,也可以加簡單評論。

當然,你要是說Endnote才是國際主流,我無話可說。

細節記錄方面,建議用docear,可以提取pdf中的注釋,具體用法請自行百度。

第三個階段是輔助論文撰寫。其實主要就是插參考文獻。當然,有些人會說Endnote對英文雜誌的引文格式支持更好。解決方案是學會自己調整參考文獻輸出格式,如果你有能力讀到研究生,這個應該不難。

歡迎大家關注我的微信公眾號(sci_coffee_break)或個人網站「讀思」(http://read-think.com),和我做進一步的交流。這裡不僅有更多關於科研的書籍的評論,還有關於科技論文寫作的內容。

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教你寫出優秀的文獻綜述

作者:管握堤

鏈接:https://zhuanlan.zhihu.com/p/23243527?refer=bylwzd

來源:知乎

著作權歸作者所有。商業轉載請聯繫作者獲得授權,非商業轉載請註明出處。

讀博有一段時間了,感覺學會寫文獻綜述成了近來最大的收穫,在此寫出來與大家共同討論,請各位「大牛」指點,共同學習進步。

文獻綜述考察的是以下幾個能力:一個是針對問題查找文獻的能力;二是歸納總結分類的能力;三是思考問題,發現問題的能力。

一、查找文獻的能力。這一點聽起來好像很容易,現在網路資源這麼多,尤其是在武大,圖書館上的中外文資料多得不得了,但是要真正查到自己想要的資料可不是那麼容易的事。在做老師給我的題目「中小企業創新發展與國際化策略」的時候,可能一開始我對這個題目的理解不深,只是簡單地將它分成兩個部分,中小企業創新與中小企業國際化。在中國期刊網上搜索關鍵詞「企業創新」「中小企業國際化」,我發現出來的論文都比較次,大多只是一些空話套話,幾乎所有的文章都一樣,沒有什麼可借鑒的價值,由此思考中國的學術研究到底怎麼啦?如果要我們都看這些文章的話,簡直就是在浪費時間,浪費生命。那麼我們要怎麼辦呢?有兩個辦法:首先是在搜出來的文章中找一篇雜誌好一點的,一般來說,好一點的雜誌他的論文會更有價值一些。然後看這篇雜誌後面的參考文獻都有哪些。被作為參考文獻的論文或者是書籍都還是可以的,有一定的學術價值;或者是找出這個領域內比較權威的專家,然後看他的書或者文章。比如說在中小企業國際化方面的權威人士有:林漢川、趙優珍、魯桐等。第二個辦法是在外文文獻中尋求幫助,寫到這裡,又要感慨:怎麼國外的學術總是做得比較規範和有價值呢?昨天看劍橋大學網站的時候,發現劍橋大學的本科生從進來開始就有自己的研究方向,他們在學習的過程中不斷地加深對自己方向的理解。老師們上課也並不講很多,而是每次上課開出一系列的書單,讓學生去圖書館查資料,所以劍橋大學學生大部分的時間都在圖書館度過,而不是在課堂上。正是因為這種培養方式,很多劍橋大學的學生在本科畢業的時候就已經是某個研究領域的專家,能夠達到很高的學術造詣。所以對於我們來說,國內可借鑒的真的不是很多,一定要尋求外文期刊的幫助,但是目前在利用外文資料方面我還摸索得不是很清楚,再學習。

二、是歸納總結分類的能力。那麼多的文獻,到底哪些是對自己有幫助的呢?還有如何將他們歸類?文章可以有很多篇,但是我們要在看了之後再心裡分成幾個方面,大多數的文章都逃不過這幾個方面。比如說中小企業國際化的文章,研究的比較多的就是中小企業國際化的經濟學分析;中小企業國際化的方式、中小企業國際化的程度以及促進中小企業國際化的策略等等。所以我們在看文獻的時候一定要心中有一根主線,你的思維會圍繞這根主線,一定要明白我為什麼要看這篇資料,這樣才不會在看文章的時候摸不著頭腦,才不會越看就感覺越迷茫;相反地,心中有數,那麼看文章會越看越清晰。而且可能在看得過程中你會有新的想法,會想到再去查其他方面的文章。我們在寫一篇論文的文獻綜述時,一定要明白文獻綜述他是為文章服務的,關於中小企業國際化的研究角度那麼多,我們不可能將所有的方面都寫上去,時間篇幅都不允許,而且也沒有必要。看過那麼多文獻之後,你一定要形成自己對你所要寫的文章的整體認識,明白你打算再文章中寫那些方面。我看了中小企業創新和國際化的論文之後發現我還應該去查找一下關於中小企業國際化和創新的相互作用的論文,為什麼要把這兩樣東西放一塊來研究,他們之間肯定存在著某種關係。

最後是思考問題,發現問題的能力。我們不是為了看文獻而看文獻,看文獻是為了了解,目前在這個領域都研究了些什麼,那些方面研究的很成熟了,那些方面還是新興的領域。此外,看文獻的過程中,要有一定的思考問題的能力,能夠發現別人研究的不足之處或者可以改進的地方。那麼這些不足之處就是值得我們去研究的地方。

此外下面的這段話是在別人的論文中看到的,對於我鑒別領域的發展程度和前景有一定的幫助:判斷一個研究領域是否成熟的三個標準:1)該領域已經存在大量的實證研究;2)這些研究已經形成了相當一致且具解釋力的結論;3)這些研究對於該領域重要關係性質的理解已經達成了普遍共識。


你看完1G的文獻

卻連個1M的文章都寫不出來

確實是個憂傷的故事


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