為什麼日語中常把漢字發音清化？

例如日本的本，由ぼん變成ほん，平安的平由べい變為へい？

這是個好問題！

首先題主要知道，普通話中「波」的聲母寫成國際音標是/p/，是不送氣清音；而「坡」的聲母寫成國際音標是/p?/，是送氣清音。兩個聲母的區別不在於清濁，它們都是清音，區別在於送氣與否。

要解答題主的問題，需要追溯到中古漢語。與普通話爆破音送氣不送氣二分的局面不同，中古漢語的爆破音是三分的：除了不送氣清音/p/和送氣清音/p?/，還有一個濁音。這個濁音是否送氣，各家觀點不同，不妨認為它不送氣，即/b/。這裡面的/p/和/p?/原封不動地流傳到了普通話中，而濁音/b/消失了。原先屬於聲母/b/的字，根據聲調不同派入了/p/或/p?/中：平聲字變成/p?/，仄聲字變成/p/。

題主說的「本」字，中古就是/p/聲母，普通話依然是/p/聲母；而「平」字中古是/b/聲母，因為是平聲字，普通話就變成了/p?/聲母。

日語中漢字的讀音是分階段傳入的。在隋唐以前傳入的讀音稱為「吳音」，隋唐時期傳入的讀音稱為「漢音」，此後的傳入就不成系統了。日語中的輔音是分清濁，但不分是否送氣的。吳音中的爆破音保留了清濁，即/b/仍為/b/，/p/和/p?/都變成了/p/（我在此不寫送氣符號，但實際發音是送不送氣均可的，日語不作區分）；而漢音中的爆破音一律變成了清音/p/。

仍以「本」「平」兩字為例。「本」字的吳音、漢音都是ほん；「平」字的吳音是びょう（保留了濁音），漢音是へい（變成了清音）。

這裡題主又會有疑問：上面不是說清音是/p/嗎？怎麼變成了/h/呢？這是日語後來的演變，は行假名的輔音整體由/p/變成了/h/，所以才又造出了ぱ行假名來表示/p/。

吳音、漢音兩套讀音，都不完整地流傳了下來。現代日語中，有些字只讀吳音，有些字只讀漢音；有些字有兩讀（這就是日語多音字很多的一個原因），有的按意思區分，有的按字在詞中的位置區分，有的隨機區分。如果考察從中古漢語到現代日語的演變，那就是，只有一部分中古聲母為濁音的字，在現在日語的一部分詞語中讀濁音。

還是看「本」「平」兩個字。「本」字現代日語只有ほん一個讀音，你見到的「三本」（さんぼん）、「一本」（いっぽん）之類的都是日語自身的連濁造成的，並不是說「本」字本來就有多種讀法。而「平」字通常讀漢音へい（偶爾也會有連濁現象），只有在個別詞，如「平等」（びょうどう）中才讀吳音びょう。

回到題主的問題。題主感覺到的日語讀音的「清化」，有兩種可能：一是這個字中古是不送氣清音聲母，普通話亦然，日語自然讀清音；二是這個字中古是濁音聲母，因為是仄聲字普通話變成了不送氣清音聲母，而日語讀的是漢音，所以是清音。

實際上我在學習中古漢語之前，就注意到了相反的現象，即日語有些漢字的讀音會「濁化」，例如「同」字讀どう。現在我就懂了，這是因為「同」字中古是濁音聲母，因為是平聲字普通話變成了送氣清音聲母，而日語讀的是吳音，所以是濁音。

如果題主想知道中古漢語聲母傳入日語的全貌，可以看這個視頻教程：