傳統生物專業的碩士生,怎麼通過自學轉行到生物信息學領域?
現在在一家建材公司做與生物毫不相干的文員工作,和一群大專生一起,在知乎可以算是個loser了。但是心中對生物科學的熱情之火依然沒有被現實的殘酷完全熄滅,現在對生物信息有一定的興趣,而且我的數學基礎也不差,很想通過自學的方式最後能夠從事生信相關的工作,在這個過程中我應該補些什麼,最好能夠有成功轉行生信的同志分享一下經驗。
我原本是學物理和生物無關,機緣巧合才進入了基因組學的門檻,發現這實在是一個激動人心的領域!知識的新陳代謝速度實在是快,現有的書本知識根本上跟不上這個變化的,一開始雖只有高中的生物知識,但根本沒影響!所以,你希望進入的生信領域(或者說基因組科學領域),現在的專業背景是束縛不到你的,最重要的還是自身意識,關鍵的地方有4個,一是:決心(看得出題主有決心和熱情);二是,找一個能夠交流的平台/社區,與真正在基因組領域中的人多多交流,學習別人的經驗;三是:找一個合適的平台(公司)直接投身進這個領域;四是,緊跟前沿,原因就是「這個領域的知識書本是跟不上的」。
然後才是談論技術學習的問題。學習進入生物信息領域的技術要求還是不高的,你有數學功底,那最合適不過了,我的建議有2個:(1)精通一門編程技術(在生信領域,我推薦Python);(2)精通統計學,各種統計檢驗的方法是必須懂的,基因組領域的很多問題都和尋找顯著性差異相關(如差異表達的基因,差異甲基化區域,如何判斷基因組的變異等等),然後必須懂一些演算法/機器學習相關de ,特別是貝葉斯類型的,logistic回歸,GMM,SVM,EM演算法,這幾個是目前使用頻率最高的。OK,入門的話,回答就暫時先這樣了。
最後,我給個真正有用的建議:決心和實戰最重要!多和有實戰經驗的人交流,懂得編程之後就可以進入了,其他的邊干邊學。最後一句:要干就干能讓自己激動不已的事業,good luck !
我的情況跟你類似,碩士專業是「生物化學與分子生物學」。但由於個人興趣愛好,我很早之前就學會了使用Linux和Perl,並在實驗室里做了一些簡單的生物信息工作,比如局部比對,全局比對,系統發育重建之類的任務。然而,真正使我提高的是碩士畢業後去了BGI工作,在那裡,通過老員工的指導以及自己承擔完整的項目,我學到了很多東西。所以我覺得學習並提高生物信息學水平的捷徑就是在一群高手帶領下做一兩個完整的項目。
學編程啊
要轉行到生物信息學還是要靠做項目,在實踐中提高自己的能力。建議題主要麼去讀個博士,要麼去找個研究助理干,有活干就有學習的目標了,經驗也會慢慢積累起來。本人生物信息學博士。
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