清朝皇帝屬於八旗旗中的哪一個？或者說，根本就不屬於任何一個旗？愛新覺羅氏是不是每一個旗里都有這個姓氏？

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從最早的設定來說，八旗的旗主在本質上都不凸顯具體的旗籍。如正紅旗的旗主，本質上並不具體的隸屬於正紅旗某參領的某佐領，因為他是整個旗的主人。

不過隨著入關之後旗主制度基本崩盤，原先的旗主制度被分割為小旗主制度，所以清代八旗的旗主（都是宗室）也都有了自己的旗籍，這裡的旗籍指的是具體的旗籍。

與之相對，皇帝自己家仍然是個個例，因為入關後，皇帝是上三旗的旗主，同時擁有三個旗，所以他本質上不專屬於上三旗的任何一個旗。不過據說在統計戶口的時候，皇帝一家慣例記作「頭旗內頭參領下頭佐領人」，恰好清代頭旗為鑲黃旗，所以在某個角度來說，皇帝的戶口是鑲黃旗滿洲第一參領第一佐領，不過他其實並不隸屬於那個佐領的牛錄額真。

然後再說宗室的問題。清代皇室脫離大宗（所謂分府）之後，便獲得自己的旗分。入關前的皇子獲封，一般跟血緣有關，比如說莽古爾泰在正藍旗，其弟德格類分旗的時候就也進入正藍旗。這個期間內，八旗都有皇族。入關之後，從順治帝以下的皇帝都把自己的皇子分封進下五旗，其目的主要是蠶食下五旗原旗主的佐領，直接影響就是，入關之後分出來的皇族，旗籍都在下五旗。

如雍正帝在當貝勒、雍王爺的時候，旗籍在鑲白旗，繼位後回到上三旗。如啟功的祖上是弘晝，其分到了正藍旗，故而啟功自己是正藍旗的宗室。又如宣統帝的父親載灃一門，實際上是在鑲白旗。

八旗內都有宗室和覺羅，他們都姓愛新覺羅，所以可以認為愛新覺羅每個旗內都有。

皇帝是八旗共主，親自統領上三旗而已，包括太子（儲君）都沒有旗籍。

滿洲八旗最開始就是努爾哈赤分封給他的子侄，順治之後歷代皇帝又不停分封皇子到下五旗，以此來削弱王公勢力。從頭到尾八旗都是愛新覺羅的玩具，當然每個旗都有這個姓氏了。