如何看待韓春雨:「在我們實驗室,這個成功率在90%以上...」,而現在世界各大實驗室幾乎都不能重複?
這位「網紅科學家」,來浙大後被人發現了另外一面!
來源於很久之前的網路,韓春雨在浙大演講時講的「在我們實驗室,這個成功率在90%以上,十盤兒有一盤兒污染也就算了,因為我們那兒有霧霾」,按照韓的意思,除了被霧霾污染之外,其他的實驗成功率是不是100%?而現在全世界重複率成功率那麼低(假設國內的一例是真實的,另外兩例測序結果還沒出,暫時不算)?雖然這報告已掛在網上很久了,6月3日的,有沒有可能現場摘錄及部分沈晨傑整理出錯,沒有經過韓的指正?當天浙大去參加過現場的老師同學們能否確認一下?或者有錄音?是不是韓春雨不是在報告會上說的?
真的有錄音有錄音!在這裡:韓春雨浙大講座全程錄音獨家發布
要從他們的微信公眾號下載。我暫時搞不定。如果哪位有的話,可以仔細驗證一下,再來告訴我一聲,謝謝![update: 已經下載到錄音和錄像,還沒來得及聽,看]所以我很好奇:1、是不是有什麼高超的技巧?2、是不是有專利技術絕對不能泄露給外國人?3、是不是歐美各大分子實驗室,「」80%的細胞都是支原體污染還有20%的技術都不過關「【韓春雨語】」,所以導致實驗無法重複?因為現在的歐美不存在霧霾的問題。4、另外,在Nature採訪時堅決不做民族英雄的自稱已經重複出來的某研究員是在上海,匿名的那兩個我國實驗室,號稱也能重複部分結果,還在等待測序的結果的,他們的實驗成功重複是否也是一定要在霧霾相對嚴重的地區?補充一個信息,也代表我本人的看法:
與科學小丑較量決不退讓,鄒承魯院士與30年前的兩起學術腐敗事件
我國近十年來,在物理/材料/生物/化學等領域發了不少頂級文章,但是沒有多少是世界範圍內有很多想跟進研究的,韓副主席這次的可能造成的影響估計非常惡劣。比如我現在看韓國人的文章,曲線特別漂亮,我總會覺得是假的,直到最近有了一個韓國的同事,發現他們測數據確實非常非常認真細緻,而且完成一個博士學位要3+5=8年,加上兵役,挺不容易的..... 所以一人造假,大家背鍋
我想說兩句,上面有人拿蛋白質結晶舉例子,偶然得到了結晶。這個研究是有用的,因為它的研究目的就是得到蛋白質的高級結構而不是研究結晶的方法學。韓教授這就是方法學研究,如果重複不出來沒有意義。前面答主說的都是用成熟的方法,偶然得到了某結果,這個研究目的是那個結果。而韓春雨如果只是偶然得到那個結果換個實驗室就不能重複的話,他這種方法就沒有任何意義。他現在應當分析原因,得到通用高效的方法。或者,他是故意隱瞞了實驗細節,希望先申請專利獲得知識產權後再公布。
看到水鴣鴣的回答補充兩句
系裡面有個老師在二維分子晶體上做出來了成果,但不知所以然。審稿人就這個一直抓住不放,老師的壓力也很大。
沒有法子,只能不斷地做實驗,但通宵達旦也始終不能重複出原來的結果。偶然的機會,老師念起了最初做實驗時隨手用的一瓶放了兩年的溶劑,把瓶子里僅剩下的薄薄一層拿去測,發現了是裡面部分變質才產出的fancy效果,最後發了cover。
如果真的捨得花功夫下去研究,雖然這條路很不容易,但比什麼都不做就把一切都說成玄學要好得多。講故事吧:以前科大有個實驗室燒出了一種材料,性能優越各種法力加持,發了牛逼論文。老外按照他們的方法死活重複不出來,要求來他們實驗室看看。看就看,有什麼可怕的,他們實驗室當著老外的面燒出一爐這個材料。老外閉嘴,回家感嘆自己技不如人。老外不知道的是,只有那一個爐子可以燒出這個材料,別的都不行,他們實驗室自己都不知道為什麼。那個爐子被禁止干別的只能做這個實驗用。不知道現在研究出來為什麼了沒有。以前中科院流傳過一個故事。在很久很久以前,蛋白質的結構解析還是需要依靠X射線晶體衍射的計算。研究蛋白質結構最麻煩的一點就是結晶。很多蛋白質沒法研究就是因為結晶不出來。但是某天這個實驗室把一個巨難結晶的蛋白給做出來了,結晶又大又美麗。但是想重複這個實驗的時候瞎了,怎麼也重複不出來。後來偶然間發現只有用一瓶緩衝液做溶劑才可以結晶別的都不行,死活就是不結晶。大家猜測這瓶裡面估計混進了什麼微量污染可以幫助結晶。就是說也有小概率是這個實驗在他的實驗室確實可以做出來。要是開放讓大家看看就不會有現在的爭論了。反正你的東西在別人那也做不出來,怕什麼呢。
蒙 @王小二 提及,也來談一下自己的看法,祈方家指教。在細胞內引入外源核酸以抑制目的基因表達的方法,主要分為反義核酸(antisense oligonucleotides, ASO)和反義RNA干擾(RNA interference RNAi)兩種。ASO和RNAi都是作用於mRNA水平,干擾其表達或介導其降解。其作用效果稱為knock down (kd)。
其實這個領域命名有些混亂,DNA和RNA都是核酸,但ASO一般都指反義DNA;而用到干擾這個詞的時候,一般都指反義RNA。 @Lophorina 可能是主攻ASO,表述得不大確切。我主要在做細菌內表達antisense RNA的工作,對ASO也不大了解。
回到韓春雨的問題上,其主要論點是NgAgo可以在切割基因組DNA,從而導致基因失活,一般稱為knock out (ko)。要驗證這一點,最重要的是用PCR和測序的方法驗證基因組DNA水平上的改變,下游mRNA及蛋白表達水平的下降只能作為輔證。而 @Lophorina 提到的ssDNA引入後導致表達水平下降,同時測序錯誤又提示了目標區域DNA鹼基的缺失,基本是不可能的。一是因為切割的是幾十個bp,而不是幾個;二是因為他做了很多個位點,不可能所有的測序錯誤都「準確的」出現在他想要的位點上;三是如 @王小二 所說的,ssDNA必須要針對正義鏈才能導致基因的KD。正因為如此,韓春雨才沒有選擇這樣解釋,而是提出了更有說服力的霧霾學說。實踐是檢驗真理的唯一標準,到韓春雨老師那就變成了時間是檢驗真理的唯一標準。
我今天也是嗶了狗了…… @Lophorina
明明只是出於好意科普一下ASO並不只是DNA,你偏要來撕,我也不客氣了!今天上午在車站無聊瀏覽知乎,看到了 @Lophorina 的這個答案:韓用的20bp的guide DNA,不就是干擾實驗中常用的反義核酸嘛(ASO),這玩意本身轉入細胞就可以抑制基因的表達,僅僅在mRNA或者在蛋白水平檢測的話,會發現類似於KO的表達下降甚至完全檢測不出等的現象
所以我覺得韓可能就是做了一個干擾實驗,碰巧桑格測序污染了,測出的結果少了幾個bp如果真是把knockdown當成了knockout.............
在回復裡面,看到答主和一個叫 @老貓 的知的爭論:
出於對科學認真負責的態度,我隨手用百度百科貼了一發: 我去,下午一看,我勒個去,居然把我掛上了! 言辭中頗有九分優越感啊,還給我貼了一篇論文鏈接?同學,我只是不在學校,上不了google,不然我至少會用維基百科的,我用百度百科是因為沒得選擇,而且其本身的說法也並沒有太大問題,剛好可以補完你的說法之不足。好吧,到此我還不想和你撕逼,畢竟都是做科學的,應該叫討論:
我想著那我們就來善意地、友好地交流一番吧。喲呵,到了晚上,這位又充滿優越感地跳出來說我之處他的錯誤也不能證明我是對的,請問這叫什麼邏輯?我的小宇宙沸騰了……
對於不能好好討論的人,我是素來先禮後兵,一旦用兵就不留情面的。那我索性就把你的問題用手術刀撥開,讓大伙兒都看看,到底誰對誰錯。Lophorina(作者) 回復 老貓
ASO是dna...........
這是你回復老貓的原話,別刪!
你看不起百度百科,那我貼個維基百科吧:
Antisense therapy
引用:This synthesized nucleic acid is termed an "anti-sense" oligonucleotide(ASO) because its base sequence is complementary to the gene"s messenger RNA (mRNA), which is called the "sense" sequence.再提供一個介紹原理的網站:
Antisense Oligonucleotides引用:Antisense oligonucleotides are synthetic polymers:The monomers are chemically-modified deoxynucleotides like those in DNA or ribonucleotides like those in RNA.There are usually only 15–20 of them, hence "oligo".Their sequence (3′ → 5′) is antisense; that is, complementary to the sense sequence of a molecule of mRNA誰對誰錯?我就是用這一條百度百度來打你臉了,怎麼樣!我就問你臉疼不疼!
你又憑什麼就那麼看不起百度百科?能打你臉我現在管它什麼百科,只要是事實,你就得挨著!我上午在校外用手機懶得打字也上不了google,就隨手複製粘貼這一條,但這一條百度百科有大的錯誤嗎?我看至少比你說的ASO是dna正確多了!
dna只是ASO中的一種!
另外:
「我自己就做ko的,小鼠和細胞細胞系都做,不用你來我告訴我怎麼檢測。」是說你已經做出來了嗎?如果是,既然你都做出來了,大家在懷疑韓春雨的時候,你怎麼不拿出證據來實力打臉呢?
「我自己就做ko的,小鼠和細胞細胞系都做,不用你來我告訴我怎麼檢測。」還是說這只是說你的工作涉及到KO?那樣的話,你的發言倒是顯得很外行啊。你明明知道韓春雨的文章數據絕不是因為反義核酸(ssDNA)引起的,你這一番言論又是為何而發?搞笑還是洗地?
退一萬步說,就算我暫時認可你說的原理髮揮了作用。你有沒有想過你的說法還有一個致命的問題,韓文章中用的ssDNA有多個靶點,有的靶向正義鏈,有的靶向反義鏈。正義鏈轉轉錄出mRNA,靶向正義鏈的ssDNA可以引發RNAseH介導RNA-DNA duplex中的RNA講解,而靶向反義鏈的呢?你告訴我靶向反義鏈的ssDNA怎麼按照這個劇本發揮作用?路過說一句,反正我認識的人以及他們所認識的人,都完全重複不出韓的結果。污染?技術不過關?講道理,世界一流癌症研究所的博士後會犯這樣低級的錯誤?我們可是千錘百鍊出來的謝謝!
然而我們這幫華人博後不方便出來打臉啊,就算有完整的證據鏈,我們這些拿著J1簽證的,好多以後還要回國混。這事目測已經不是單純的學術事件了,憑著一篇如此unsolid文章,居然能又拿經費又建中心,誰敢保證背後沒有政治因素?要是哪個不明真相的華人博後跳出來打臉,誰敢保證他以後回國還能混?
我對面實驗室一哥們5月30日就重複完全套實驗發現這是個大坑不能繼續踩了,但他又不敢冒泡。上周末我們在聊天吐槽時,有人建議讓他老闆(外國人)出面打臉,他自己匿名,還建議他補充最後一個打臉實驗,就是不知道後事如何了。其實,博後都好忙,吃力不討好的事情,懶得搞,又沒錢拿。偶比較好奇實驗以前都寫報告,現在不能都錄下來么
大家都是搞科研的,重複性很重要特別是方法學。反正就是:泳池裡面水幹了,就知道誰在裸泳。大家等著就行。
我覺得老韓十有八九被底下的研究生給坑了,自己水平也不怎麼樣。並不是我看不起河北科技大學的研究生,一個許多不怎麼樣的學校,招的研究生水平如何,其實一目了然。水平不高的研究生做實驗的時候,尤其容易出現假陽性的結果。一方面導師指導的不到位,另一方面要畢業又得做出點啥,那或許無心,或許有意,實驗中出現某個期望中的結果,也很有可能壓根沒能力去分析數據,去發現其中的前因後果,趕緊交差。老闆水平又有限,很好,點個大炮仗,就這麼捅出去,以為能自圓其說,其實裡邊漏洞百出。
搞科研,做研發,這樣的事例真不少見。在塔的二層,被劍釘在牆上的女魔法師死了,她可能是人類歷史上唯一真正的魔法師。而在這之前約十小時,短暫的魔法時代也結束了。魔法時代開始於公元1453年5月3日16時,那時高維碎塊首次接觸地球;結束於1453年5月28日21時,這時碎塊完全離開地球;歷時二十五天五小時。之後,這個世界又回到了正常的軌道上。
——《三體-死神永生》劉慈欣
p.s. 科幻小說純屬虛構,請勿將小說中的事件、角色、身份和現實生活相聯繫。謝謝。這句話應該做成海報貼到全國各所高中作為揭露偽化生不靠譜本質的鐵證。
你的實驗室風水好
1.可能存在這種情況,但是理論上來說,發表的文章必須保證其他人可以按照文章上說明的步驟重複出來,如果刻意隱藏重要的技巧,屬於學術不端,如果無意間忽視了特別的技巧沒有表現在文章中,屬於韓的失誤,責任也應當由韓承擔。當然如果是第二種,他的責任可能沒那麼大。而且事後韓也有向社會補充說明的義務,然而他並沒有那麼做。
2.這種情況也是有可能的,有的情況下確實有人在文章中一部分關鍵的地方,一般是把某些試劑的製備過程申請專利,然後公布其他部分,這樣他可以賣那種試劑賺錢,但是科學研究是要自證其真的,在這種情況下如果有人需要文章發布者提供所需試劑進行驗證,發布者是有義務提供的(當然如果跟發布者不熟的話,可能需要花點錢買)如果其他人用發布者提供的試劑進行實驗能夠重複,大家也會承認他的工作。當然,已經寫在文章中的成果,就等同於向社會公開任由他人使用並且不從中獲取經濟利益,當然,其他人在引用著部分工作的時候也必須在文章的引用部分進行說明,指明出處。如果你希望籍此獲利,那可以全部申請專利么,科研圈的規矩,求名不求利,求利不求名。至於你說的不能透露給外國人的,那一般是涉及到重大國家利益,這種研究根本不會公開,都是簽署了保密協議的,透露了很有可能要吃槍子的。別說發文章,連專利都不會有(因為專利也是要公開的,只不過別人使用要經過專利所有人同意,一般是要花錢的)。你根本就看不到。而且韓的工作好起來也沒有重要到那種程度。
3.呵呵韓春雨的實驗室真NB,人家四級實驗室那種保護程度是你無法想像的,如果說他們的樣品都不夠乾淨,你看看韓春雨那破實驗室,這槽我不知道從何吐起比較好。4.你倒是公布個單位,姓名,順便再公布下實驗過程和數據唄。不過講真我不覺得中國的實驗室能比外國的強,最多一個水平罷了,人家那麼多實驗室沒做出來呢。別說我馬後炮,當時這新聞出來的時候我就說八成有貓膩,現在tmd居然冥冥之中印證了我的猜測,不怕被打臉,坐等韓公出來道歉
自己聲稱不算啊。再怎麼不濟,自己實驗室得重複的出,讓內行看看就閉嘴了。
其他科研機構應該集資給韓春雨讓他在他自己的實驗室重複一下這個實驗,其他人觀摩。一次不行就兩次。按說,成功率在90%以上的話,連續兩次失敗的可能性極其微小。
生活大爆炸第7季第6集中,謝耳朵成功發明了一道史無前例的數學公式,藉此公式有望人工合成一種新型穩定超重元素。在謝耳朵的論文發表之後,隨即傳來了中國研究所發現超重元素的消息。正當謝耳朵四處得瑟之際,卻發現自己看錯了參數的單位,將平方厘米看成平方米。這在物理學界無疑是失之毫釐差以千里的錯誤。那麼中國團隊怎麼做到的?當第10集播出後,答案終於揭曉了:中國團隊偽造了實驗數據。謝耳朵的好友重複了中國團隊的實驗,發現了數據造假的事實。「在數據文件里加入了模擬信號,他們偽造了結果」。
居然有人拿百度百科來反駁我,實在是醉了
ASO是DNA,我自己的課題就在用,沒必要忽悠你們。給你們個鏈接,感興趣的自己去看吧
Cellular localization of long non-coding RNAs affects silencing by RNAi more than by antisense oligonucleotides
以下是原答案
說點兒略偏題的
韓用的20bp的guide DNA,不就是干擾實驗中常用的反義核酸嘛(ASO),這玩意本身轉入細胞就可以抑制基因的表達,僅僅在mRNA或者在蛋白水平檢測的話,會發現類似於KO的表達下降甚至完全檢測不出等的現象
所以我覺得韓可能就是做了一個干擾實驗,碰巧桑格測序污染了,測出的結果少了幾個bp
如果真是把knockdown當成了knockout.............推薦閱讀:
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