如何在LaTeX寫作中管理參考文獻?

12-27

怎樣簡便高效的在latex腳本中插入欲引文獻？有哪些常用/好用/為天文口優化了的輔助工具？大神們在這方面的work flow一般是怎樣的？

題主表示，歡迎各行各業的大神來分享經驗；題主作為天文小學生，作為尤其歡迎天文口的大神分享涉及天文口的特殊技巧~

2016-04-09 JabRef 文獻管理軟體簡要說明（見附錄第8條）
2016-03-02 補充百度學術、必應學術引用提取（見附錄第7條）

怎樣簡便高效的在latex腳本中插入欲引文獻？有哪些常用/好用/為天文口優化了的輔助工具？大神們在這方面的work flow一般是怎樣的？

從工作流入手吧，其間會提到輔助工具，參考文獻直接通過 bib 文件引入。

一、工具和工作流

基礎準備（可能用到的工具）

【文獻引用工具】Sublime Text 編輯器，以及安裝插件 LaTeXTools（或者LaTeXing，由於兩個插件都裝了，不清楚是哪個插件提供了文獻插入的觸發功能）（快速插入文獻用）
【中、英文文獻】Google 學術可用（快速查找文獻的 bibtex 引用格式）
【中文文獻】Zotero Zotero | Home，將 CNKI 搜索結果的文獻導出為 BibTeX 引用格式
【快速文獻檢索】Chrome 有個檢索 Google 學術文獻的擴展，Google Scholar Button，可以快速查找文獻，特別是下載文獻 PDF 比較方便。

文獻準備（新建一個 mybibtex.bib 文件）

【英文文獻】Google 學術檢索文獻 &>&> Cite（引用） &>&> BibTeX &>&> 複製粘貼到 mybibtex.bib 文件中。這篇裡面有講過有哪些好的 LaTeX 編輯器？ - 知乎用戶的回答。
【中文文獻】能用上面的方法儘可能採用上面的，比較簡單。如果用 CNKI，操作如下（以 firefox 為例）：(確保安裝 Zotero 的 firefox 擴展 &>&>) CNKI 檢索文獻 &>&> 點擊一下 url 輸入框末尾的文件夾圖標 &>&> 選中要導出的文獻 &>&> 導出為 BibTeX 引用格式 &>&> 複製粘貼導出的 BibTeX 文獻到 mybibtex.bib 文件。

在文章中引用文獻（快速引用）

確保安裝了 Sublime Text 以及 LaTeXTools 插件
latex 文檔後面加
ibliography{mybibtex}
（常規的，文獻準備之前就可以引入，一邊編輯，一邊引用文獻，這裡主要為了講解）
引用文獻，輸入 cite 時會有一個觸發，彈出 bib 文件中已有的文獻，輸入關鍵詞然後回車即可引用。備註：觸發得到的文獻是從 bib 文件得到，還是從 aux 文件得到，暫時沒研究過，如果沒有彈出文獻框，可以先編譯了生成了 aux 文件再試。

編譯（如果 bib 文件有變動的話，需要重新編譯）
xelatex *.tex bibtex *.aux xelatex *.tex xelatex *.tex

二、附錄

Google 學術文獻引用
Google Scholar Button 文獻快速檢索（這個下載 PDF 最方便了）
CNKI 文獻引用，這裡有提 QQ空間
文獻引用
Sublime Text 及插件安裝，不細講

Sublime Text Sublime Text: The text editor you"ll fall in love with。
安裝插件首先要安裝 Package Control，Installation。
LaTeXTools，可以下載了本地安裝 SublimeText/LaTeXTools · GitHub。
Sublime Text 其他插件，Package Control。
插件安裝方式分在線和本地安裝，前端學習日誌-Sublime Text 2安裝插件方法詳解。

文獻管理軟體 Mendeley Free reference manager and PDF organizer，它可以導入 bib 文獻格式，並且提供了 Word 的文獻插入插件，覺得 LaTeX 麻煩了的時候，也可以換用 Word，並繼續利用已有的 bib 文件，在 Word 插入文獻也很快。這裡有提到 QQ空間。

（Mendeley的幾個特點：界面不算丑、提供word插件、提供多種格式導入、可以雲端存儲、提供文獻插入樣式）
必應學術（必應學術 - 學無止境，術有乾坤）、百度學術（百度學術 - 保持學習的態度）。google 學術文獻應該比較齊全，但是，要提取引用，不一定能用上 Google 的服務，最近發現，百度和必應學術也都可以提取文獻。

8. JabRef（JabRef reference manager）。之前有用過，同樣支持 bibtex，界面相對而言要樸素一些，英文環境下遇到過中文亂碼（能夠解決）。它有一個特點是可以導出 Word 支持的 XML 文獻格式。Mendeley目前不支持點擊引用跳轉到對應的文末的參考文獻處，用 Word 自帶的文獻引用方式就可以。

一、安裝正確的LaTeX的版本
最好裝官網下載的MiKTeX + Texmaker，體積小巧，定製靈活。如果你裝了來源不明的修改版，那下面的說明可能對你無效。

二、養成用JabRef管理文獻的好習慣
JabRef（官網可能被牆了，請自行搜索下載）是一個小巧的開源文獻管理軟體，用來管理BibTeX格式的文獻條目信息。JabRef功能非常強大，界面也很人性化，用它與LaTeX配合工作可以省去很多力氣。我們在網上下載文獻時要順便導出BibTeX格式的引用。（相信我，所有科學文獻網站都支持BibTeX導出！）BibTeX引用實際就是一段文本，比如下面的文獻網址：
http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/summary?doi=10.1.1.71.1980
在頁面右側就會看到這樣的一段BibTeX的代碼：

@INPROCEEDINGS{Ester96adensity-based, author = {Martin Ester and Hans-peter Kriegel and J?rg S and Xiaowei Xu}, title = {A density-based algorithm for discovering clusters in large spatial databases with noise}, booktitle = {}, year = {1996}, pages = {226--231}, publisher = {AAAI Press} }

其中INPROCEEDINGS表示這是一篇會議文章，如果是ARTICLE表示期刊文章，用得最多的就是這兩種；Ester96adensity-based是BibKey，用來唯一標識這個條目，你可以修改它，只要與你本地的條目不重就可以了；其它信息一看就懂，不羅嗦了。有些文獻檢索網站導出的是一個*.bib文件，此時用記事本之類的文本編輯器打開這個文件，就可以看到同樣的內容了。

三、如何將bib條目添加到JabRef中
在JabRef里新建一個database，其實也就是擁有多個文獻BibTeX條目的bib文件，並保存到你本地專門的一個文獻目錄中。一般來講為了方便本地查詢，一個研究領域建一個資料庫並放在專用的文件夾中是比較合理的。然後在JabRef的這個新database里新建一個Entry（按Ctrl+N，然後點任何類型都可以），再把文獻網站導出的BibTeX的代碼粘貼到新條目下方的「BibTeX source」里去，如下圖所示：

再點保存。注意，此時一定要把source里的相關信息整理規範（上圖所示為經過整理後的信息），最後讓JabRef 自動生成新條目的BibKey（Ctrl+G）就好了。

四、規範化條目信息
至於什麼叫「規範」各人理解不同，但毋庸置疑的是整理bib項越認真，後面改文章時越省事。我個人整理好的一個條目列表如下圖所示：

說明一下，這個列表中的Timestamp列是我下載此文獻的時間，Comment列是對該文獻的「一詞簡介」，Note列是文獻的來源（期刊名或會議名）。JabRef原先的Booktitle列和Journal列因為太占寬度，我把它們關閉了。這些列的設置可以在軟體的參數設置中調整（Options -&> Preference -&> Entry table columns）。上面Comment和Note的信息是我手動編輯的，費點事但可以極大的提高以後查閱文獻的速度。可能剛開始的時候整理會比較麻煩，多試一試，很快就熟能生巧了。

另外，要注意有些作者的人名含有帶注音的母音字母，如果不改成LaTeX的代碼的話，就會在LaTeX編譯中形成亂碼。比如B?hm要改成B"{o}hm。還有，不要出現任何中文字元，否則會導致你的tex文件編譯出錯。

五、與文獻的pdf文件關聯
在用JabRef重新生成每個文獻的BibTeXKey的基礎上，將每個文獻對應的pdf文件都重命名為BibTeXKey的名稱，然後把這些pdf都放到與bib資料庫相同的目錄下，就會得到這樣的文件列表：

然後在JabRef中右鍵點擊一個條目，點Attach File，選擇對應的pdf文件，這樣條目就和pdf文件關聯起來了。關聯了以後，在條目左邊的序號後面會點亮pdf的圖標，雙擊這個圖標就可以直接打開文獻閱讀，非常方便。

注意，整個文獻文件夾是可以移植的，複製到另一台裝有JabRef的機器上，雙擊bib文件就可以打開，所有的pdf關聯都不會有問題。

六、在LaTeX中添加參考文獻目錄
盡量把你的tex文件放到和這個文獻目錄距離不遠的文件夾下，這個距離不遠指得是方便通過相對路徑索引到bib文件。然後在你已經創建好的tex文件中「documentclass」一行的下面添加如下代碼：

usepackage[numbers]{natbib} citestyle{IEEEtran} ibliographystyle{IEEEtranN}

這裡是用IEEE Trans的樣式做了一個示例，當然你可以有自定義的樣式，一般要符合雜誌社或會議的官方要求。在文檔最後需要插入參考文獻塊的地方（不能放在end{document}之後）加上一行：

ibliography{相對路徑/bib文件名}

這裡要千萬注意，只要文件名，不要帶上擴展名「.bib」。在相對路徑中，../表示上一級目錄，例如bib文件的目錄為documents/reference/pdf/abc.bib，tex文件在documents/latex/paper/my.tex里，那從tex文件訪問bib文件的方式為：

ibliography{../../reference/pdf/abc}

前兩個點是索引到documents/latex/，後兩個點是索引到documents/。

七、在LaTeX中插入引用
So easy！在JabRef里右擊條目，點Copy cite{...}，得到標準的LaTeX引用語法，例如：

cite{Kriegel2009}

把它粘貼到你的tex文檔里要引用的位置。編譯tex文件時先用BibTeX編譯一遍，再用PDFLaTeX編譯兩遍（如果還不行，請重複執行「BibTeX編譯-&>PDFLaTeX編譯」），漂亮的引用文獻就生成了：

八、僅在文獻目錄中顯示需要的信息
如果你使用了IEEETran樣式（或其它樣式）的文獻引用和目錄，那可能會在文獻的目錄中列出各文獻的網址及其它信息，包括手動編譯的comment和note等，但這些信息是我們不希望在文獻目錄中出現的。處理方法也很簡單，進入「MikTeX安裝目錄ibtexstase」目錄，用文本編輯器打開IEEETran.bst文件，查找「FUNCTION {format.url}」，會看到下面的代碼：

FUNCTION {format.url} { url empty$ { "" } { this.to.prev.status this.status.std cap.yes "status.cap := name.url.prefix " " * "url{" * url * "}" * punct.no "this.status.punct := punct.period "prev.status.punct := space.normal "this.status.space := space.normal "prev.status.space := quote.no "this.status.quote := } if$ }

把它改成這樣：

FUNCTION {format.url} { url empty$ { "" } { "" } if$ }

還有FUNCTION {format.note}以及FUNCTION {format.comment}等等，這些你不希望顯示的信息都做同樣的處理。之後重新編譯你的tex文件。

全過程就是這樣，應該沒有漏掉什麼。弄不出來的私信我。

texlive emacs zotero（加上插件better bibtex）爽的飛起，體驗比word+endnote好了十萬八千里

直接用bibtex就可以。
LaTeX編輯工具的話，一般Windows下使用TeXworks ，OS X下使用TeXShop 都是可以的。
導出bibtex也可以使用Endnote等，但過程比較複雜，一般直接從文獻的網站導出bibtex就可以了。
文獻管理軟體推薦Windows下的Zotero (Zotero | Home)，OS X下Bookends (Downloads)

Step 1
新建一個文件citation.bib，然後參考文獻引用bibtex：

把生成的文本貼入.bib文件

那麼得到的citation.bib如下所示

@INPROCEEDINGS{4658486, author={Chai Beng Seow and Gani, R. and Jeoti, V.}, booktitle={Intelligent and Advanced Systems, 2007. ICIAS 2007. International Conference on}, title={Wavelet-DCT based image coder for video coding applications}, year={2007}, month={Nov}, pages={748-752}, keywords={data compression;discrete cosine transforms;discrete wavelet transforms;video codecs;video coding;DCT block;MATLAB;SIMULINK model;discontinuous tone image;discrete cosine transform;discrete wavelet transform;interframe compression;intraframe compression;still-image compression;video coding;video source;wavelet-DCT based image coder;Diffusion tensor imaging;Discrete cosine transforms;Discrete wavelet transforms;Fast Fourier transforms;Image coding;Intelligent systems;Mathematical model;Signal processing algorithms;Video coding;Video compression;DCT;Wavelet-DCT;compression;difference image;threshloding}, doi={10.1109/ICIAS.2007.4658486},}

Step 2
新建示例sample.tex文檔

documentclass[11pt, oneside]{article} usepackage{geometry} geometry{letterpaper} usepackage{amssymb}


	itle{Brief Article}

author{The Author}
egin{document}

maketitle

%section{}

%subsection{}

Wavelet-DCT based image coder for video coding applicationscite{4658486}.

% "4658486" is the keyword of the reference for citation
ibliographystyle{IEEEtran}

ibliography{citation}

end{document}

Step 3
把sample.tex和citation.bib放在同一個文件夾下，並且設置編譯器的編譯規則（如OS X的TexShop調整到pdflatexmk模式），即可得到結果

推薦免費好用雲同步的文獻管理軟體Mendeley，裡面有生成bib文件的功能，可以很方便地插入latex。

一輩子只要維護好一個bib文件就行了

對於一個剛剛入門的科研狗，學會管理參考文獻越早越好。

我一般採用的方式為zotero+jabref+texlive+vim/texmaker

一般來說，我們會看很多的英文文獻，那麼在文獻的管理方面就會凸顯各種麻煩，不知道怎麼管理。首先說一下我的管理參考文獻的軟體zotero，個人使用的原因：

第一是它可以從網站上自動幫我獲取我需要的文章，並且配合插件之後，可以完成下載、命名、分類等一系列工作。

第二，對於我電腦裡面有的參考文獻，也可以拖入到軟體裡面，完成上傳伺服器，命名、分類等工作。

第三，因為有時候用ubuntu，有時候用windows，跨平台的zotero就滿足了我的需求。同時，zotero支持小組內共同維護一個參考文獻庫。

第四，配合插件，自動按照雜誌需要的格式輸出bib文件。其他優點還有很多，重要的是開源開源開源！有能力的話可以自己搗鼓。

如圖所示，右側的信息就是zotero自動尋找並且生成的，即便是有些文獻很冷門，也可以選用手動輸入的方式。

這是一個開源的文獻管理軟體，本來是firefox瀏覽器的一個插件，也有獨立版的，這個在zotero官網可以下載到。我一般都使用獨立版，建議在操作模式下選擇英文界面。

中文文獻的管理就不要用zotero了，可以嘗試其他的比如noteexpress，不過對於題主來說，剛需應該是英文文獻。

軟體的具體使用可以參考網友寫的使用說明，不過相對於高智商的人才，這個難度應該很小。這裡有相當多的插件供你選擇使用，讓zotero更強大，我這裡只介紹兩個比較重要的插件：

zotfile：可以再下載文獻，抓取信息後，按照想要的格式重命名pdf文章，我的是按照雜誌、年份、文章題目命名的，也可以自己設置改成其他的。

zotero-better-bibtex：幫助更好的輸出需要的或者不需要的bib的項目

如圖所示，我在輸出參考文獻的時候取消掉了timestamp，abstract等key。

zotero軟體有一個伺服器儲存空間儲存大小（好像初始是100M）的問題，可以付費擴展，如果有經費的話也可以直接擴展到G以上。如果不願意花錢擴展，也可以通過WebDAV藉助堅果雲，將文獻儲存到堅果雲，學習教程在這。

通過一段時間的文獻的閱讀和整理，你自己就會有一個小型的文獻庫。

假定文章的讀者已經有一點Latex的基礎，如果對latex不是很了解，可以參考一些教材或者網路資源。一般英文雜誌社都會提供論文模板以及參考文獻的bst文件，比如APS系列，IOP系列，區別在這篇文章里可以查閱到，下載地址在雜誌社官網均有。我們如果想在latex了引用參考文獻，我們需要給參考文獻做bibitem，而對於大量的參考文獻我們一般是輸出一個bib文件後用bibtex編譯生成bibitem。我們使用zotero對我們看過的文獻進行整理，當我們想要使用參考文獻時，使用zotero輸出bib文件。

例如這裡我使用的是Phys.Rev.A的格式進行輸出，當然這個你可以自己選擇，幾乎有所有雜誌的輸出方式這裡面都可以選擇。這裡我推薦使用better bibtex輸出，因為那樣可以去掉一些不需要的項目。

Jabref是一款管理參考文獻的軟體，而且可以方便的和tex編輯器進行交互，當我們需要在文章中添加參考文獻的時候，我們只需要將游標點鐘文章，後再bib中選中所要引用的參考文獻然後點擊jabref右上角的圖標，即可在該位置加入參考文獻。下面我們將兩種交互方式

（1）Jabref+texmaker

我們首先把Jabref和編輯器進行關聯，這裡可以關聯的編輯器有六種，基本涵蓋了主流編輯器，關聯的方式除了vim比較麻煩以外，其他的只是添加程序路徑。

假定我們已經關聯好了Jabref和texmaker。我們首先打開要編輯的文章，後打開參考文獻的bib文件。當我們需要在文章中添加參考文獻的時候，我們只需要將游標點鐘文章，後再bib中選中所要引用的參考文獻然後點擊Jabref右上角的圖標，即可在該位置假如參考文獻。該位置的圖標可以修改為其他的編輯器。

（2）Jabref+vim

可以參考，「JabRef 和 vim 關聯通信是使用 vim server 連通的，這要求這兩個軟體都使用同樣的 vim server 名稱。在 JabRef 一端，選項-&>首選項-&>外部程序-&>Vim的設置-&>Vim 路徑自填，伺服器名處你可以使用默認的 vim 伺服器名 vim，也可以修改成任意名字，比如 xxtexvim；在 vim 一端，編輯 LaTeX 文件時不要使用通常的命令啟動 vim，要加上 vim 伺服器名，比如 vim --servername xxtexvim --remote-silent xxx.tex，這條命令的意思就是使用 vim 連接到伺服器 xxtexvim 修改 xxx.tex 文件，當然如果該伺服器不存在，就創建它。啟動了 JabRef 和 Vim ，如果在編輯 tex 文件的時候想加入某條文獻的引用，只需要在 JabRef 界面上方的工具欄按鈕「推送選中記錄到……」中選擇為 Vim，選中某條文獻後然後再點擊該Vim圖標，在vim軟體中的游標所在位置就會自動加入該文獻的引用。」

當我們加入好了參考文獻之後剩下的就是 pdflatex+bibtex+pdflatex,大功告成！

enjoy！

全平台jabref或者osx下papers吧。文獻搜索自動生成.bib。圖形界面，一鍵生成LaTeX key。可以試一下哈。

沒有什麼特別的軟體無非是
ads+bibtex
在ads里查到文獻,下面有鏈接 bibtex entry for this abstract.
用這個建立自己的引用數據文件就可以了。
反正一個大領域裡，每次工作要引用的文獻差別不大。也就第一次費點事，後面就簡單了。

這裡有一個可能在有些大神看來有些問題，但是一定是最簡單最簡單最簡單的方法！！！

首先，使用Overleaf在線編輯器。免費，還可共享編輯，實時自動保存，非常好。

然後，使用Mendeley管理文獻。這是一個非常好用、強大、又免費的軟體。

最後，重點來了！！！！！

Overleaf可以連接到Mendeley的library。只需在Overleaf登錄Mendeley賬戶，其中的文獻信息都會以bibtex文件格式自動上傳到Overleaf。如圖下。

然後通過citep{}就可以引用了。完全不需要自己編輯.bib文件！也不用像什麼百度經驗寫的各種編譯什麼的！非常方便！！！

.bib 文件外加 cite｛}

推薦refworks+texstudio的組合。
只要用google scholar找到文獻，導入reworks,refworks可自動導出bibtex文件，在texstudio中直接引用就可以了

Mendeley存儲文獻，
對於一個項目，導到jabref里生成bib文件，
插文獻直接用jabref插

我用cite{}, 觸發了一次文獻索引，可是我仍然想在這個地方插入文獻，如何調出文獻索引？

我對所有看過的文獻建立一個bib文件，引用的時候從這裡找。最後在提交論文的時候自己寫一個腳本將所引用的bib內容抽取出來，變成獨立的bib文件即可。

建立自己的bib文獻庫，引用的時候可以根據自己的設置，latex會自動生成bbl文件。