如何理解EVA的13話中赤木律子最後的一段話？

12-26

【劇透注意】
先貼上原文（eva-fans字幕組）
「媽媽死前那一晚曾對我說過，MAGI其實是她的3個自己。身為科學家的自己，身為母親的自己，和身為女人的自己，這相互爭執的三個人格就是MAGI，她是故意留下人類所擁有的矛盾吧，其實我把程序微妙的改寫了，我自己不太可能做母親，因此不了解身為母親的媽媽，但是我尊敬身為科學家的她，卻憎恨身為女人的她。Casper里輸入的是身為女人的模式，到最後她也維持了自己是女人的這件事，真不愧是我媽的作風。」
1、「其實我把程序微妙的改寫了」，這裡改寫指的是什麼？我本認為是最後EOE的自爆程序的伏筆，但是EOE中律子卻說「我剛剛瞞著你改寫了magi的程序」，說明是在EOE中改寫的自爆，所以這裡就不太明白了。
2、「到最後她也維持了自己是女人的這件事」，這裡網上有人理解為是CASPER幫助了律子勝過了使徒，不知各位有什麼看法。

謝邀。
這個問題有些難以回答。
第13話原文是「死ぬ前の晩、母さんが言ってたわ。MAGIは三人の自分なんだって。科學者としての自分、母としての自分、女としての自分。その3人がせめぎあってるのが、MAGIなのよ。人の持つジレンマをわざと殘したのね。実は微妙にプログラムを変えてあるのよ。私は母親にはなれそうにないから、母としての母さんはわからないわ。だけど、科學者としてのあの人は尊敬もしていた。でもね、女としては憎んでさえいたの。最後まで女でいることを守つたのね。ホント、母さんらしいわ。」
加粗的兩句即問題提到的事。
日語是一種非常曖昧的語言。首先是「実は微妙にプログラムを変えてあるのよ。」這句話其實本身並沒有主語，所以直譯的話應該是「實際上程序有微妙的改變」，並不能說明這是誰做的（萬一MAGI自己改了呢2333）
評論中 @rkjima @蛋喜對我對第二句的翻譯提出異議，故先刪掉啦~
而在官方的FILMBOOK中，第二句話翻譯成了這樣：

「最後還是以女人的身份來保護我」
最後直子跳樓前的情景是指什麼呢？因愛生恨掐死綾波麗嗎？那段律子是看不見的吧。