編碼DNA缺失一個鹼基，蛋白質結構一定改變嗎？

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不一定。一般地，內含子算編碼區的。但是外源表達蛋白時，一般都把內含子去掉，都不知道丟了多少鹼基。此外，一些多順反子，比如含有IRES序列，對這種鹼基多一個還是少一個的寬容度還是很強的。

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以高中課內範疇來看，應該是一定的。
（人教版教材也未涉及到內含子相關內容）

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得分情況考慮：
編碼DNA ：
我找到了非編碼DNA（或稱「垃圾DNA」）的解釋：是指不包含製造蛋白質的指令，或是只能製造出無轉譯能力RNA的DNA序列。
那麼編碼DNA應該包括編碼蛋白質的和sRNA的，tRNA等等的都算。題主中寫的有蛋白質信息，那麼這裡的編碼DNA應該就是指，能夠編碼蛋白質的「基因」 吧。
基因還包含編碼區和非編碼區。
現在回答問題：
1. 發生在非編碼區的變異，不會影響蛋白質的結構。缺失一個鹼基這種情況，如果是終止密碼子之後，蛋白質已經翻譯出來了，那更不影響了。如果是起始密碼子之前，影響更大的是蛋白質的產量而不是結構。
2. 發生在基因編碼區，：
1）缺失一個鹼基會導致缺失點之後後的一系列氨基酸翻譯錯誤，結構一般來說會產生很大的變化；
2）如果缺失點位於接近終止密碼子附近，恰巧移碼之後的不遠處又產生的一個新的終止密碼子，那麼結構可以認為是不變的吧，，其實也是有變，不過不影響功能了就是。平常基因工程中經常在蛋白C段加個GFP啊，his啊啥的，功能還算正常

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圖畫得略丑，字略丑……

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