朱棣定都北京後，為什麼還要保留南京的六部等機構？

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如果是準備等北京淪陷了退守南京，那有必要保留這麼齊全的人員機構嗎？假如北京被韃靼攻破，皇帝帶著一眾官員退守南京，南京什麼都有，那是直接啟用新的人員機構，還是讓北京來的官員接管南京六部等機構呢？怎麼處理兩套官員的關係呢？
留著南京當備胎，就不怕叛賊借這個備胎上位嗎？
為了安置朱允文時的機構官員嗎？

遷都北京，實現了政治中心與軍事中心之重合，卻造成了與經濟中心之分離。保留南京作為陪都，有利於維持政府對東南財賦之地的控制。也就是說，兩京制度的存在，可以使政治軍事經濟中心相脫離的缺陷得到一定程度的彌補。所以丘濬說「用東南之財賦，統西北之戎馬，無敵於天下」。以上便是兩京並立最根本之原因，而且中國兩京制度由來已久，西周東漢隋唐北宋元均如此，因此也沒什麼好奇怪的。最後，個人一點小建議，希望諸位在回答歷史問題時收起那些可笑的小機靈，多讀書多思考少些調侃。

簡單檢索了一下《明實錄》，補充點和問題相關的知識吧。朱棣篡位後，並沒有立即下詔遷都北京，南京仍是明帝國名義上的首都。
永樂六年八月：「己卯禮部議奏巡狩合行事宜。一詔告天下諸司及各處鎮守總兵官知會。一禮部仍行各處，凡有重事並四夷來朝，俱達行在所，仍具本啟聞。其餘事務俱達京師啟聞施行。事有疑礙者，在京合該衙門具奏……」《明太宗實錄卷五十八》
上面這段文中的行在所指的就是北京，而京師指的是南京。凡是有重要的事情需要及時讓皇帝知道，或者四夷朝貢的就到行在所去，其他普通事務在南京處理就可以了。
到了永樂十八年十一月：「上謂行在兵部尚書方賓曰：明年改行在所為京師，凡京衛合行事宜，其令各官議擬以聞……」《明太宗實錄卷一百一十八》
所以永樂十八年的時候，以北京為京師，南京為陪都。
接著洪熙元年：「命諸司在北京者，悉加行在二字，復建北京行部及行後軍都督府。上時決意復都南京……」《明仁宗實錄卷八》
於是在明仁宗的時候北京又變成了行在，南京再一次變成首都，並派皇太子到南京籌備遷都事宜。結果改南京為京師後沒過兩個月明仁宗就駕崩了，遷都南京一事擱淺，但是以北京為行在的稱法一直延續了宣德一朝。
到了正統六年十一月：「改給兩京文武衙門印。先是，北京諸衙門皆冠以行在字。至是以宮殿成始去之，而於南京諸衙門增南京二字。遂悉改其印。」《明英宗實錄卷八十五》
至此，北京成為明帝國實實在在的首都，南京降格為陪都。

剛好最近在看熊召政先生的《張居正》一書，在第二回中有相關的描述，節選出來供題主參考。（不知道手機端如何給重要文字加粗，故以【】標出）

自從燕王朱棣篡了侄兒建文帝的皇位，把個皇城遷到北京，這大明開國皇帝朱元璋欽定的首都南京，便成了留都。【但因為明太祖的皇陵在南京,龍脈之所出的安徽鳳陽也離南京不遠,朱家後代的皇帝，出於對祖宗的尊敬,至少在名分上，還是保留了南京的特殊政治地位。】除了內閣之外，一應的政府機構，如宗人府、五軍都督府、六部、都察院、通政司、大理寺、詹事府、翰林院、國子監、太常寺、鴻臚寺、六科、行人司、欽天監、太醫院、五城兵馬司等等，凡北京有的，南京也都保留了一套。北京所在府為順天府，南京所在府為應天府。不過，北京政府管的是實事兒，而南京的政府，除了像兵部守備、總督糧儲的戶部右侍郎、管理後湖黃冊的戶科給事中這樣為數不多的要職之外，大部分官位，都形同虛設。【由於實際的政治權力掌握在北京政府手中，南京的政府官員，大都是仕途失意之人，或者是為了照顧級別，安排來南京當一個「養鳥尚書」或者「蒔花御史」。】儘管兩府級別一樣，但是，同樣品級的官員，由北京調往南京就是一種貶謫，由南京調往北京則被視為可喜可賀的升遷。因此，一大批受到排擠或者沒有靠山的官員都聚集在南京，盡情享受留都官員的那一份閒情逸緻。

異地備份，在今天也是安防工作的重要策略

那些老不死的怎麼辦，殺了，不行不好交代，辭了，那些人有些都是我爹雇來的不合適，帶去北京，整天給我添堵怎麼辦再說朝中也安排不下了，留南京全都進政協養老吧

明朝黨爭政治更迭那麼厲害
留著南京四套班子給北京下野的官員養老吧。
而且南京六部對南方的管理也有協調作用。

如同當今人大政協作用吧，統戰，養老

李自成端了北京以後，南京的南明還撐了一年。

1、中國有維持祖制的傳統，朱元章定都南京，這個按傳統是不能改的。
2、安撫反對人士。
3、他個人的自我安慰。

這就是朱棣的聰明之處，作為一種拉攏手段.讓那些安排不下的高官在南京六部安排工作，保持"政治待遇不變"。也可以利用他們的龐大勢力鎮壓對他不滿的殘餘勢力。讓這些人和反朱棣勢力火併，朱棣則在北京坐收漁利。從朱棣遷堵都北京後收縮北方邊境衛所，來拱衛北京來看，朱棣對反對他的勢力還是保持了清醒的警惕的。

兩京制才是大一統王朝正常的現象

至於叛賊問題，我想說，諸王體制降天子一等，也是有一套的官吏系統，所以不存在叛賊問題。南京作為另一個都城，主要是對明朝的天子守國門的補充。你再如何不退只是一旦國門被打開，天子還需要重建政權，有南京一切方便多了，所以我感覺南京是為了戰備制度存在的，一是作為安置一些人的地方，

因為北京開始只是行在，就是臨時辦公的地方，，，真正定都北京，是因為土木堡失敗之後，，出於各種原因，才真正成為首都的吧。？

高曉松說，是朱元璋讓的。。。