在胚胎髮育早期可檢測到ngn3的mRNA和蛋白,但在晚期僅能檢測到其mRNA而檢測不到蛋白這是為什麼?
導致這現象的原因是什麼,怎樣設計實驗驗證。分子生物學進展的課老師留的,無奈不是這個方向的,選錯選修課,一直無法找到相關解答,哪位可以幫忙解釋下。謝謝
居然還有邀請的,謝。
答案樓上都出來啦,繼續拋個磚吧。
碰到這種問題一般就分3步走啦。
1. 想。既然是作業而不是真正的科研,老師課上一定講過一部分了。要解決的問題就是為啥有mRNA而沒有蛋白呢?先考慮這裡面有多少可能性吧。mRNA到蛋白無非就是個翻譯的過程,那麼可能性1就是這部分mRNA沒有被翻譯咯,可能是miRNA調控,可能是某些不知道的機制降解mRNA,等等等等。。。然後繼續考慮,即使成功翻譯了,蛋白質就一定存在嗎?可能也會被降解啊,具體可能涉及摺疊問題,protease相關問題等等等等。。。然後你花了5分鐘想到這些東西,其實已經有好幾個假設了。
2. 查。懶人可以直接做這步。把問題丟給google去,更專業點的話丟pubmed,更業餘點的話丟百度,基本會出現以下場景:
當讓有能力的話是用英文啦。掃一眼,自己5分鐘之前的假設差不多都被驗證了,看到最下面一條說道Ngn3 stability is regulated by ubiquitin proteasome, 那麼蛋白被降解估計是真的。又看到講miRNA的,那麼轉錄後miRNA的調控估計也是有的。
然後再花幾分鐘讀一下abstract,覺得沒用就X了,有用就看看原文,看粗體字就好。比如說那篇 Complex regulation controls Neurogenin3 proteolysis,點進去隨便看看,咦看我發現了什麼:
當然了還有miRNA的也是一樣啦,英文苦手還有中文是吧:
miRNA的調控也在這了。
3. 證。想過了,查完了,該設計實驗驗證啦。懶人也是不需要這一步的,為啥?因為第二步的文獻里都有實驗論證呀,你要是不願意自己想就直接拉到人家的material and method,把人家的實驗看懂了再寫下來就是了。當然了自己想會更加有樂趣和收穫,比如說我們要驗證A的表達受B的影響,怎麼辦呢?最簡單的,把B提高了看看A怎麼變,把B弄沒了看看A又怎麼變。就比如miRNA,增大miRNA表達看看對Ngn3有啥影響,再看看加miRNA inhibitor又有啥影響,balabalabala...
然後呢?然後就完了呀,這只是個作業而已又不是開題報告,實驗隨便設計,試劑隨便用,想要什麼技術有什麼技術。順便我只是拋磚的,你的作業還要你自己寫。。。Ngn3為一轉錄因子,是胰腺發育過程中短暫表達的蛋白,與胰島細胞分化有密切關係,在胰島幹細胞向內分泌細胞定向分化後隨之下調。
——《巢蛋白及神經元素3在胚胎早期發育中的表達與分布》 解剖學雜誌(手機打字就不按標準格式引用了)
因為胰島細胞分化完成後它的這部分功能已完成,所以不需要再翻譯出蛋白,但mRNA通常是能在細胞質中存在一段時間的,很可能這時的mRNA還是在蛋白停止被翻譯之前合成的,故會觀察到題目中的結果。
個人見解,歡迎批評指正。
這種東西隨便搜個paper不就有了,不想看英文的你就上中國知網搜 ngn3表達調控
喏,剛剛隨便一百度就看到了標題,和miR-106b相關
最常見的原因是miRNA的調控。
解決這種問題:1)是否有文獻已經做了相關研究;2)生物信息學的分析ngn3是否有miRNA的結合位點;3)設計實驗篩選並驗證潛在的miRNA。
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