什麼叫陰陽五行，太極八卦，這些都有根據嗎？中醫里的藥物歸性又是如何確定的啊，難道僅僅就是經驗嗎？

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題主這問題好大......恰好現階段易學學習中對這些都有大致的框架結構認識，不請自來，不準確的地方還請各位指正。
首先，中華民族是一個歷史悠久，有著璀璨文化的優秀民族。在不斷的思考與實踐中，中國古代的先賢們對世界的認識有了一套完整的思維體系，這就是易學。易學內容廣博，無所不包：天文地理，自然現象；人事代謝，社會變遷；算術醫學，音律武術......它是古代祖先對宇宙的基本看法，是對世界規律的一種探究，並發展成一種體系運用於自然社會的方方面面。

太極陰陽：這套體系的基本觀點是「陰陽」。說陰陽的時候要先說清楚「太極」。「太極」是宇宙的本源，是世間萬事萬物萬有的「祖先」，是最先的存在，是「有」。而古人認為有生於無，所以根據周敦頤的《太極圖說》，「無極而太極」。宇宙本是一個「無」，然後生出了「有」，即太極。題主必定看過太極圖。整個圓就是一個太極，而太極由「兩儀」組成，兩儀即陰、陽。陰陽是是事物的兩個方面，兩者共同構成「一」。古人通過太極圖向我們揭示了一些基本的宇宙規律：1.萬事萬物一分為二，都有陰陽兩種東西構成。人分男女、量有長短、衡有輕重。就如太極圖中一個太極圓分為一黑一白。2.陰陽兩者互為你我，缺一不可。圖中陰陽相輔相成，缺少任何一方都無法構成一個完整的圓。沒有丑，人們也就不知道什麼是美。3.陰陽比重均等。圖中黑白面積相等。有多少的黑就有多少的白。4.陰陽相互轉化。陰陽圖中兩條小魚首尾相接，相互追逐。壞到極點有好事，好到極致有壞事，否極泰來就是這個道理。5.陰中有陽，陽中有陰。圖中黑里有白點，白中有黑點。朋友之間肯定有敵人，敵人陣營必定有朋友。陰陽是古人對世間萬物的規律總結，一陰一陽謂之道也。
八卦：說完太極陰陽我們說八卦。在易學的體系中，用「―」代表陽，稱作陽爻；用「--」代表陰，稱作陰爻。上文說到兩儀陰陽，兩儀生四象。在陽爻上再加一個陽爻組成的新符號叫老陽，以此類推，陽爻上加陰爻為少陽；陰爻上加陽爻為少陰；陰爻上加陰爻為老陰。老陽、少陽、少陰、老陰即所謂的四象。古人發現單單用陰陽兩爻來表現世間萬物還不夠，因而從兩儀中生出了四象。後來發現四象仍不足以細緻又廣泛地囊括萬事萬物，於是再在四象的基礎上加陰陽兩爻，構成八卦，即：乾 ?，兌 ?，離 ?，震 ?，巽 ?，坎 ?，艮 ?，坤 ?。大自然的八種事物與之分別對應，即天，澤，火，雷，風，水，山，地。這並不是說八卦只單指這八種事物，而是這八種事物是八卦在現實中一個具體表現。在八卦的基礎上兩兩重合，八八六十四，即構成六十四卦。六十四卦就包含了世間的一切事物，並揭示了其中變化發展的規律。
五行：五行產生的時間和八卦一樣不可考。有些易學家把五行與八卦割裂開來，認為兩者毫無交集。但也有易學家將兩者結合起來看待。五行具體指木、火、土、金、水。但並不是單指這五種事物，而是以這五種事物來象徵世界中物質的五種形態。這五種形態具有相生相剋的關係，見圖。

五行順位相生，隔位相剋。其中一行都與剩餘的四行有所關聯。以木為例：木可生火，木可克土，同時水能生木，金能克木。五行所包之物非常廣博，對應木、火、土、金、水的有五方：東、南、中、西、北；五季：春、夏、季夏、秋、東；五味：酸、苦、甘、辛、咸；五臟：肝、心、脾、肺、腎等等。中醫就是應用五行間生克制化的原理來治病。以心火病為例，由上圖和五行五臟對應關係可以得出：得心火病除了直接治療心臟之外，還可以調肝藏血以木養心，木生火；可以疏鬆脾土以瀉心火，火生土；或者滋潤腎水制止火亢，水克火；亦或者清肅肺金以防火熱，火克金。因此中醫根據五行理論辯證施治，對症下藥。所以有時會發現中醫不是頭痛醫頭，腳痛醫腳。而是把人體看作一個整體結構，一個部位出現問題肯定是因為其它部位有問題，而這個部位有問題也會影響到其它部位，所以中醫是要綜合協調，平衡各方，以此來恢復身體之前健康平衡的狀態。而何物屬於何五行，是出於長期的觀察實踐。
總結：太極、陰陽、八卦、五行都是中國傳統易學的概念，是易學的元素，而易學是中國古人發明的一種看待事物、解釋事物、揭示變化發展規律的思維體系。今人常謂之「不科學」，但我想在這裡說：給一個事物下結論之前需要先了解它。要想知道梨子甜不甜吃一口就知道。而那些梨子都沒嘗過的人就妄下斷言說梨子不好吃的顯然不夠理性客觀。而當你嘗過並說不好吃時我們再來繼續探討是梨子真的不好吃，還是你吃的那個梨子已經壞掉，還是用錯了方法吃。不管怎麼說，這套系統在中國存在了幾千年，幾千年間數以百千計的聰明人研究它應用它，那它肯定有它存在的理由。回答比較粗糙，許多細節的地方講得不夠清楚，知識所限，還望專家大神斧正並補充。
以上。

我談談自己的看法吧。
陰陽是一對哲學概念。陰者，靜也，暗也，柔也；陽者，動也，明也，剛也。這是先賢探求世界本質時提出的一對概念，具有辯證性，所謂「形而上者謂之道」。陰陽關係，大體可分流行與對待，當然每條下面什麼孤陰不生，陰陽消長，不用贅述。
五行源自尚書。《尚書·洪範》：「五行，一曰水，二曰火，三曰木，四曰金，五曰土。水曰潤下，火曰炎上，木曰曲直，金曰從革，土爰稼穡。」
木性生髮、條達，火性炎熱、向上，土性長養、化育，金性清凈、收殺，水性寒冷、向下。個人覺得五行的性質是關鍵，五行不是具象，而是抽象，正因定義有這些性質，所以才發生生克的關係。題主所說藥物歸性的問題，也是考察藥物對人體的作用之後才定的，也算是經驗。不過中國傳統文化中直感與經驗是很重要的，所謂證道，就是經驗驗證了道，這和西方邏輯思維不斷推理的路是不同的。
八卦相傳為伏羲所畫，起源眾說紛紜。徵象只是一種代表，卦倒不能說義（性質）在象上，不過義也很重要。不要將卦完全限定在某事某物，適時可以取象。
最後，建議題主多看一些相關的書，多感受傳統文化中的那種思維方式，接受之後，自然會豁然開朗。

陰陽最主要的是平衡。以社會為例。官為陽，民為陰。若陽收斂，平和執法，而陰擴張，百姓得以抒發心志，則社會和諧。官若流於暴力，人民受壓迫，則陰陽反逆，到達一個臨界值就會崩壞。