《黑客帝國》里，在認可 Zion 並非虛擬世界的前提下，如何解釋 Neo 可以在現實世界中對抗電子烏賊？
問題源自於以下問題中的討論
http://www.zhihu.com/question/19644847?__nids__=4338176,4338102,4336183#249978-cmt
因為原問題中的討論太過蕪雜，重新開一個問題。
問題的背景原則是：承認Zion並非純粹的虛擬世界，如果認為Zion是虛擬世界，Matrix2的話，那麼請無視此問題。
不知道你們為什麼糾結neo能看到史密斯和幹掉機械章魚，我這裡統一回答:
neo的能力被定義為超出母體領域直達機械城控制中心源代碼的the one，而第三部史密斯和第二部結尾幹掉的烏賊，甭管聽不聽機械城的，他都歸屬機械勢力產物的造物主，所以the one可以看清整個相關機械勢力的一切面貌，先知說neo的能力不局限於母體，而可以延展到機械城源代碼里，烏賊的行動受控於機械城，而neo能影響機械城源代碼發出的信號，，所以烏賊被擊落了啊，，，你問我為什麼neo在現實生活中怎麼可能干擾機械勢力，我答:你也可以啊，你把路由器用手死死捂住看看能不能干擾wifi，，，，，你問我那為什麼neo不回zion直接幹掉來犯的烏賊大軍啊，我答:你手能擋住三里屯所有的wifi嗎?
他看不到崔妮蒂，看不到他自己的飛船(瞎了用手摸來摸去扶著走你告訴我能看見?)，看不到太陽，看不到遮蔽天空的烏雲，看不到石頭，為什麼?因為這是跟母體沒有半毛錢關係啊，這些物質的造物主不是機械勢力啊，是自然啊，所以neo看不到非機械城外的世界啊，崔妮蒂雖然從母體救出來的，但她是真實世界的大活人啊，如果動畫片機械城前世今生的世界觀沒錯的話，那麼zion就是真是世界啊，如果zion和它存在的世界是虛擬的，那麼崔妮蒂和neo駕駛的飛船不會墜落，崔妮蒂不會死，因為neo可以控制啊，為什麼不能呢，因為他們的生死和機械源代碼沒有半毛錢關係啊，neo只能通過他the one的身份來改變機械勢力源代碼相關的事物，崔妮蒂作為大活人，自然界的生死neo改變不了。
1、ZION是真實的。不要脫離作品本身去解讀作品。
2、NEO的THE ONE身份是由母體授予的。在計算機語言中，這個叫「許可權」。
3、普通用戶許可權無法刪除的東西，管理員許可權就可以刪除，這是很基礎的計算機知識。許可權高一級壓死人。
4、NEO的THE ONE許可權的作用，在電影里講得很清楚了，NEO最後和母體的談話，也是答應完成自己作為THE ONE的使命。作為交換，母體放棄對ZION的進攻。
5、NEO既然有THE ONE許可權，且母體仍然承認他的許可權，權高一級壓死人，此許可權遠遠高於機械烏賊（以及機械烏賊的指揮者，如果有的話），那麼NEO在ZION指向機械烏賊，後者必然會被「刪除」。哪怕是真實世界。也就是說，在母體虛擬世界裡，是NEO運用許可權「刪除」了衛兵、保安程序等等，而在現實的ZION世界裡，是NEO要求刪除機械烏賊，而後者服從了這一命令，自我刪除。
6、永遠不要忘記，母體承認NEO有這一許可權，NEO才有這樣的能力。母體仍然承認NEO的許可權，目的是讓NEO能夠回歸併完成他的使命（見第4條）。簡單解釋就是：NEO說，這些機械烏賊得死，不然我怎麼回母體完成使命？母體說，沒錯，你來，所有你指向的機械烏賊，我都讓他死，不會妨礙你的回歸。
7、NEO無法復活ZION里的人類，因為那裡的人類是真實的，不歸母體管。NEO說，我是THE ONE，我要動用許可權，復活（UNDEL）這個人，母體：哎？
ZION必須是真實世界！
Matrix無法完美模擬現實世界，所以作為實驗標本錫安必須是現實世界才能得到有效數據，從而使Matrix的模擬更趨於完美。
用虛擬的現實世界（ZION）收集的數據去升級虛擬的現實世界（MATRIX）沒有意義。
所以機器帝國建立一個完全可控的現實實驗場是唯一合理的做法。
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理解電影的幾個關鍵點
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虛擬世界並不是鐵板一塊。
Matrix里並不是一個設計師統領一切，每個程序有他們各自的意義（purpose），電影里強調了不止一遍。設計師是負責設計和維護母體的程序——邏輯化的，眼裡只有方程和公式。而祭祀是為了平衡設計師而存在的程序——情緒化的。各種程序之間的目的並不統一。比如法國人就建立了自己的小王國還一直懸賞祭祀。他們都是程序，和那個火車人送走的夫婦程序沒什麼區別，只是目的（purpose）不同而已。
祭祀的劇本。
設計師希望繼續以前幾男幾女的老式升級方式，但祭祀有另一套劇本。她通過影響NEO等人的一系列的關鍵性選擇（choice）來把控事情按照自己的劇本發展。——因為有過6次Matrix大升級，所以祭祀知道事情的關鍵節點。效果很明顯，比如NEO在設計師那裡沒有像前6代THE ONE一樣選擇重建ZION而是選擇去救Trinity。比如Smith的復活和失控，也許祭祀在餅乾里寫過什麼程序給NEO吃了——像法國人泡妞那樣，讓Smith可以獲得部分THE ONE的特性——第一部里定位NEO的身體也是通過給NEO吃一段代碼的方式（紅藥丸）。比如NEO後期能破譯現實世界的信號（不是代碼）併入侵。包括後來的故意讓Smith複製感染——為什麼Smith沒有感染設計師呢？說明就算整個Matrix被Smith感染，設計師和祭祀這種許可權的程序也是安全的。
所以祭祀的劇本就是→使Matrix徹底失控→機械大帝無法解決→唯一能解決Smith的只有NEO→NEO唯一想要的就是和平→機器與人類達成和平協議。
所以代表理性的設計師最後不滿的對祭祀說：你玩了個危險的遊戲。
不同顏色的代碼。
Matrix里的代碼是二進位字元——綠色的。ZION里的是模擬信號——金色的。
Smith感染現實世界的人。
這裡來點推理和假設吧，改造人全身布滿了介面，特別是後腦的介面，你看看他們用的插入栓有多長？都快能從眼眶裡冒出來了，所以這裡可以假設改造人的大腦已經大部分數字化了，一旦接入Matrix則意識上傳到伺服器，熱拔插頭則導致意識不能同步回大腦所以人體會死亡（也許控制基本生物功能的區域也是數字化的）。所以Smith做的就是把貝恩本來的意識格掉並把自己的意識寫入到對方的大腦里。
NEO現實中的能力。
我認為合理的解釋是所有改造人都有接收模擬信號的功能。而NEO得到了密匙可以破解併入侵現實世界。
Smith。
第一部里Smith就不滿足於只存在於Matrix里，所以他想通過Morpheus的密碼入侵ZION。——祭祀正是利用了這一點。
NEO。
NEO在第一部里只是能和Smith打平手。但是他怎麼忽然就把Smith給反殺了呢？因為他死了一次，NEO作為設計師欽定的THE ONE需要通過死亡來覺醒。
關於ZION虛擬說。
如果ZION是虛擬的，故事裡的一切就都沒有意義了——沒有根了。沒有了虛擬和現實的根本矛盾對立就什麼意義都沒有了。如果ZION是虛擬的，那真正的現實世界又是什麼樣的呢？還有嬰兒種植廣場了嗎？還有機器大帝了嗎？還有燒焦的天空嗎？或許現實里機器和人其樂融融呢？或許現實就是ZION什麼的只是大學裡的一節心理學或者社會學課程給學生模擬體驗的？盜夢空間？一層一層的沒有盡頭？
NEO與Smith的最終決戰。
NEO一開始以為他需要打敗Smith才能結束一切，所以即使連一個Smith都打不過的情況下依然搖搖晃晃的站起來（Smith問了一連串why，明知贏不了為什麼還這麼頑固），但是最後祭祀的話從Smith嘴裡說出來的時候——「Everything has beginning has an end」——NEO領悟了，他終於湊齊了祭祀劇本的拼圖。於是他淡然的讓Smith感染了他，由於他是通過機器大帝的介面鏈接的Matrix，所以機器大帝獲得了Smith的代碼並將之刪除。
所以最後並不需要什麼決戰，只要NEO從機械大帝的介面進入Matrix祭祀的計劃就成功了。——這也是為什麼NEO執意要開走一艘船去機器城。
最後結尾躺在最終戰場中間的是祭祀的身體。Smith說出祭祀的話的時候已經隱約察覺到哪裡不對了，因為他感染祭祀之後預見的畫面是他打敗了NEO，所以他說出了祭祀讓他說出的話之後感覺到了莫名的恐懼——「別靠近我，這是個圈套！」恐懼之下他使用了他以為能結束一切的終極技能——感染NEO，沒想到NEO身後竟是機械大帝。
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祭祀才是救世主 哈哈哈
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12.13更新：
爆炸啦，今天突然漲了十幾個贊，已經20個贊啦。
答主很開心，所以決定晚上再看一遍確認下再更關於法國人勢力和一些其他細節，順便更點截圖。
沉沒影了，轉這來吧。
尼歐是機械勢力為了完成「周期性重啟母體」這個任務而造出來忽悠人類的救世主。那麼為了保證尼歐可以打入人類內部，那麼尼歐本體肯定是人類，在見到「設計師」之前也不會知道真相。為了維護這個過程不被打擾，那麼尼歐見到「設計師」以前不能死。所以機械勢力肯定要賦予尼歐最高許可權，這也是為了進一步讓人類相信救世主理論。
因此，現實世界的烏賊也是要服從這個指令的。只要攻擊目標是尼歐或者被其鎖定就自毀。正如很多人都看到的，尼歐只能在被致盲後看見機械勢力的東西，除了與機械勢力互動外無任何超能力，崔妮蒂死的時候他也無法用超能力救活愛人。
從另一個層面講，正因為錫安是真實的才可以成為母體系統的「垃圾站」。整個母體系統是不穩定的，每過一段時間就會有相當數量的人類不接受母體而導致系統崩潰。因此才需要把這些人類放逐到系統外。
如果錫安是虛擬的，那麼只能證明機器人的系統完全解決了這個問題，那麼它們為什麼還要搞這種低效的事情呢？「讓黑貓出現兩次」不就行了？史密斯被干翻後，母體一下子就可以復原。那麼同系統的錫安還需要派章魚？
之後，官方動畫也佐證了錫安是真實的。我覺得這個原因要從Neo和Smith之間的聯繫來找。
電影里一直通過種種手段來強調Smith和Neo之間的聯繫。Neo一進入Matrix，Smith很快就殺到，而Smith每次出現，Neo都有感應。Orcale也對Neo說過：他就是你，你們是一樣東西的兩面（大意如此）。Neo代表了作為一個人，希望推翻Matrix的意念，而Smith則是代表了作為一個程序，希望毀滅Matrix的意念。他們共同依存，互相學習。比如第一集Neo就學習過Smith躲子彈，而Smith在第一集的最後，也通過Neo擺脫了Matrix的控制。
到第二集裡面，可以明確的看到Neo和Smith已經成了一對雙胞胎，甚至在飛船上，昏迷中的Neo和Smith感染的那位都是頭對頭躺在一起的。Neo代表了人類，而Smith代表了機器，Neo代表了善和愛，而Smith代表了惡和恨。在Neo拒絕Architect進入The Sourse升級系統之後，Matrix實際已經陷入了內憂外患，外部是Neo領導的Zion，內部則是不斷擴張，獲得越來越高系統許可權的Smith。
Neo對於自己在現實世界裡的能力也是一步步覺醒的。我覺得在Smith之前，Matrix並沒有研發出感染正常人類意識的技術。等到Smith發現了通過感染接入Martrix的人類可以進入Zion之後，Neo也得到了相應的無線接入Matrix的能力。利用這種能力Neo在Zion所在的現實世界中也獲得了感知Smith和利用Smith的部分功能的力量。而Smith在系統中已經獲得了越來越高的許可權，甚至已經得到了操縱電子烏賊的許可權。這就是為啥在第二集的結尾，Neo忽然獲得了殺死電子烏賊的能力。可以想像，因為這種無線連接Neo還運用不純熟，而且無線的安全性或許低於他們一直使用的有線連接，才會讓法國人偵測到了Neo的代碼（你說法國人怎麼有Neo的代碼？還記得莫妮卡貝魯奇和基諾里維斯的激情一吻么？），把他困在了火車站。
在第三集里，Neo雙目失明，但是仍然可以感知機器的形狀，這個也是通過上述無線接入系統和在系統中獲得高許可權來得到的能力。Smith在系統中越來越強大，所以Neo也相應的得到了更強大的力量。但是他無法感知人類和生物，這也從另一個角度證明Zion並非虛擬。
Zion的確是真實世界，但是可悲的是整個地球乃至整個宇宙都是虛擬的，Matrix也是虛擬世界，但是是在整個虛擬世界中創造的虛擬世界，只是站在Matrix角度來看Zion是虛擬世界。而Neo是ROOT者，他root了整個宇宙。
NEO並非人類，而是機器人世界製造（或改造）的產品。鑒於機器人所掌握的技術，NEO這樣一個」產品「與人類極端相似，甚至擁有人類所擁有的一切情感也不足為奇——事實上機器人自反叛人類壓迫的那一刻開始就證明了其人性，直至MATRIX的時代，機器人已經可以被看作是統治地球的新的智慧種族/文明形式，可以想像，機器人已經擁有了完全的人性，所以我們大可不必在」人性「這一點上糾纏。
NEO之所以能夠徒手釋放EMP擊退烏賊，肯定源於他身上植入的某種裝置——鑒於當時植入人機介面已經很普遍，所以」人類「並沒有發覺NEO身上的植入物有什麼不正常。至於他能夠在眼睛毀掉之後以另一種方式來「看到」這個世界，也並非是ZION是虛擬世界的證明——他看到的金黃色成像效果與MATRIX中的綠色數字流還是有很大區別的——與他能徒手搞定烏賊一樣，這也要歸功於他提內植入的某種成像設備，在生物成像系統，即雙眼被毀之後，啟動了這套成像系統作為備份，令他能夠看到整個「機械世界」——至於他看到的世界為什麼是那樣的，為什麼能夠看到機械世界而看不見人類，其實那就是一種成像方式，類似於「掠食者」的熱成像圖象，能夠看到有體溫的生物，要看樹啊水啊石頭啊這些，需要切換光譜頻率才行，而NEO的這套成像系統是單頻譜的——事實上，機器人為NEO安裝這套成像系統的初衷並非是作為視覺的備份，而是希望他能夠將這套系統與人類視覺交替使用，用來分辨「視覺上隱形」的機器人，以及混入人類中的機器人，以完成他「ZION人類保護區守衛者「的任務，令整個系統運轉得更完美順暢，即使機器人管理者不插手，也不會出現大的問題。
為了完善這套理論的世界觀，我再多講一些：
機器人擊敗人類之後，顯然可以將人類文明徹底從地球上抹掉，但是他們沒那麼做，因為當時他們已經擺脫冷酷的機器思維，擁有了人性。機器人作為一種智慧文明，社會形態肯定也是相當複雜的。以造物主（建築師）為首的機器人，出於對人類文明的敬意，他們希望在不威脅到機器人社會的情況下，儘力保存人類文明，於是他們建造了MATRIX。MATRIX出了問題，有些人類醒來後建立ZION反抗機器人統治，機器人方面肯定有一些鷹派希望通過武裝力量把ZION這個問題解決掉，而由於造物主的從中斡旋，保留了ZION這個」額外「的」自然保護區「——顯然，造物主和鷹派人士互相達成了一些妥協：ZION一旦行動得太過火，鷹派有權派出武裝力量去平叛，但ZION不會滅亡，每次都會有火種被留存下來。當然，如果ZION老是惹麻煩，也不是個辦法，於是造物主創造了NEO這樣一個更」中間「的角色——NEO的任務就是盡量讓ZION別惹太大麻煩，令人類保留自己文明的火種以及自由意志的同時，意識到盡量長時間與機器人世界保持和平相處才是最佳選擇——這一改進經歷了7代NEO才得以實現。
實際上，對於機器人來說，MATRIX就像是個歷史博物館，造物主就是館長，AGENT就是保安；而ZION更接近於一個」人類自然保護區「，NEO則是管理員兼保安，他需要一邊安撫人類，成為人類的精神領袖，一邊抵抗機器人的攻擊，令ZION不至於徹底滅亡，以及巡查機器人中對ZION不滿的壞分子的滲透。答案一般來說是越簡單越好
Neo不是PC，而是iphone/andriod，是永遠在線的。
我去看錯了，無視我，你們都沒看懂啊，怎麼可能是最高票數的答案！
哈哈哈
這事兒怎麼說呢
首先人類是的確被機械軍團控制了，誰讓人類把太陽給徹底的遮住了，這徹底的傷了機器人的心！（動畫有介紹），一不做二不休！來做生物電池，這是無可厚非的！
機器人就想給人類造個電腦，讓人在裡面玩，睡了好好提供能量
可尼瑪動不動就有人醒，醒來就被槍斃了，這不是浪費資源么，危險係數也太大了
搞一個殺毒軟體，在電腦里槍斃這些人！建造師這麼說的
於是就真的有了這個殺毒軟體。
可尼瑪一在電腦里槍斃這些人，現實中這些人也掛了
怎麼辦呢？
用過殺毒軟體吧？出現病毒的時候有兩個選項，一個是殺毒，一個是放進隔離區
哎呦我去！
統統先放到隔離區！設計師是這麼說的
隔離區長成什麼樣呢？你們猜猜哪個是最好的選擇？
高度模擬的現實世界！反正設計師是這麼選的
這麼一搞，覺醒的人就在隔離區裡面樂呵呵的
本來機器人就可以和人類一起過上幸福的生活了！
可是有一天！！
"報告大王，有個叫Neo的新病毒把殺毒軟體給吃了，現在打隔離區的小章魚跟玩一樣，但自己也還沒搞清楚狀況，另外女朋友剛掛了，十分的惆悵」
「什麼？！」
設計師想了想，剛重裝的電腦，又來？？？不行！
得想個辦法
你們猜最好的辦法是什麼？
心理戰！沒錯！反正設計師是這麼選的，他真的是這麼選的，還奏效了！！！
"Neo,你不是剛打敗了小章魚么？"
"是啊"
"你知道為什麼么？"
"為什麼？"
"因為你還是一個程序，只不過從隔離區跑出來的！！！哈哈哈哈哈哈哈哈哈！！！！哈哈哈哈哈哈哈哈！你要不要參觀下怎麼操作的？來葛革的小白屋裡，葛革show給你看！哈哈哈哈哈哈！！！"
面對這樣的羞辱，Neo非常想去死，設計師的陰謀詭計竟然成功了！！！！！！
絕望的好同志Neo說:"玩陰的我玩不過你，你厲害，我去死行吧?就一個條件---你別把隔離區給刪了，裡面還好多同志呢「
」好的！「設計師非常高興地答應了這個條件，心裏面在想」刪你妹啊，老紙才裝好的電腦。「
Neo就屎了
懂了么？
如果非要改，那就是設計師很猥瑣，故意欺騙Neo大大，明明人家都發現了真實世界的說，讓章魚自己去屎，放煙霧彈
你們都在想些什麼呢。就因為NEO腦子後面插個線，你們就以為NEO他們是通過網線接到母體的？
你們難到不記得他們是在飛船上嗎？這從第一集就說了，飛船是通過發送信號的方式黑進母體的。也就是從頭到底都是無線接入母體。
所以後期NEO脫離飛船接入設備直接接入母體很奇怪嗎？他身體上本身就有很多電子設備。他並不是100%的純種人類。
--《黑客帝國》的主題
zion世界是真實的，機器城也是真實的，但matrix是虛擬的，純軟體模擬的，影片就是在這三個世界裡來回切換。實際上是兩個世界，一個物理世界，一個虛擬世界，但zion和機器城是完全對立，不溝通的，是個兩軍對壘的不合作的兩個物理世界。
neo是什麼？neo是「道成肉身」，他具有人類的生物學特質，也具有機器城+matrix給灌輸的超能力，這種能力超出了虛擬世界，甚至可與機器城系統互動，包括非目視的可視化系統、移動通信能力、遙控能力，比如能看到金色的機器城，smith感染的生物人類，可以接駁機器城的系統，可以控制電子章魚活動等，但這些感知能力和控制能力是有限的。（不能理解這點的人請想想neo腦後的插座）
neo是機器城+matrix設計出來的特殊人類，他的設計目標（人生目標）是模擬人類情感和思維方式，從人類身上學習到人類社會特性、文化特性，再將這種學習成果用於升級機器城的控制系統。Architect和oracle是機器城的核心控制系統程序和自學習程序，用於引導這種升級。別看Architect自稱控制一切，設計一切，實際上它也有很多不懂，也需要neo帶回新信息，完善自己的設計。坦白地說，Architect的目標很明確，就是採集新數據，優化系統，但自由意志不強，它代表了機器城的主體思維，就是控制一切，自我升級，完善控制。oracle是一個人類情感和思維方式的模擬器，在經歷過多次升級後，她慢慢變得有自由意識了，她想嘗試更多的操作可能，並將這種可能性表現在neo身上。她多次和neo交流，不僅是給neo講道理，啟發neo，本人也是neo身上的人類意識的主要設計者和創造者。
neo是一個機器城的核心代碼升級方式（或程序），他是以人類生物體形式存在，但其意識是由人類模擬意識+機器城控制思想組成。本意是要返回系統，重新升級系統的，這種升級方式已經衍生了6代，neo是第6代升級程序，他的目標是將系統升級到v7.0。
但是neo出了問題，他學習到了太多人類的生活方式，思想文化，喜歡上人類的這套了，或者說也是oracle暗示和慫恿他這麼做，他不想以消滅zion的方式來升級系統，他覺得這樣的升級沒有意義，或者對於他來說沒有意義，他不想再當一個升級程序，而是想追求一個更高的目標，建立人類與機器城的和平。他不想zion被第6次毀掉，系統再new一個升級版的neo，重建zion。他不想當機器控制下的所謂「人類保護者」，享受所謂的「榮光」，他不接受這種宿命，而這正是人類的自由意志，自由意志是反規律運行的。
本來neo是沒有這個表現機會的，如果他不願意升級，機器城和matrix可以摧毀他，或drop掉，大不了讓v6.0系統重啟一下，再生成一個新的neo，重來一遍，再完成升級。
可是機器城和matirx也遇到麻煩了，他們的一個用來保護系統安全的重要守護進程也出問題了，這個進程叫agent.smith，它也獲得了自由意志，不聽系統的話了，它的某些能力比neo還大，它可以在matrix中串來串去，並注入到機器城的核心代碼區中，成為機器城+matrix的永久病毒、木馬，它甚至可以替代機器城和matrix的控制代碼，隨意折騰了，最重要的是沒人抓得住它，它成了一個分離的自由的代碼，擁有超級許可權。matrix的本質是代碼，機器城本質也是代碼控制，如果代碼完了，被感染，被控制了，機器城和matrix也都完了，這是機器城和matrix在自我演化後，深度演化後產生的新危機。
控制，自我優化是一種低端代碼的處理方式，而建立有限規則，開放競爭，開放演化是高端生態系統的演化方式，這是機器城所不熟悉的，也是smith所不熟悉的，但是它們都到了這個門檻，都越來越有自主意識，特別是smith，不僅自由了，還有了操縱一切，毀滅一切的權力，只不過它暫時還沒意識到。在目前這個機器城+matrix的系統下，如何平衡各種自由意志，如何共存，成了主要問題。
而機器城的自主意識，意識到了這種非合作競爭的危險，在neo的建議下，它選擇了和neo合作，以傳統的方式清除名為agent.smith的病毒和木馬。neo的清除方式很簡單，他的意識最初來源於機器城和matrix，他有與機器城系統核心指令的介面，只要能連上smith，就可以讓機器城和matrix通過neo介面，執行特權命令刪掉smith，所以neo的目標就是連上smith，合為一體。smith中計了，他本來不理neo就行了，但neo纏著他打，打得他很煩，於是他就感染neo了，與neo合體了，然後就完了，smith被機器城+matrix remove掉，機器城的核心代碼及matrix又恢復了正常，不再有「寄生蟲」跑來跑去了。但是neo幫這個忙是有條件的，他要求機器城與人類實現和平，不再物理消滅zion。
機器城在不情願和無奈的情況下，接受了這個條件，給予了人類有限生存空間，從完全控制人類轉換到有限控制人類。
《黑客帝國》三部曲講的是一種系統在自我演化過程中遇到的問題和處理危機的方式，處理危機的解決方式是升級到更高水平的演化形式。
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至於說機器城保存人類是為了獲得生物電池能源，我一直比較懷疑。
倒是smith說的比較對，人類本質上是消耗資源的，是地球的病毒。即便天空被人類遮蔽了，機器得不到太陽能了，地球上還是有很多能源的，比如風、水、核。。。另外，以人類的技術水平都能遮蔽天空，那更高技術水平的機器更能開放天空了，這對機器來說不是問題，保存人類可能另有深意。
（還有能量守恆的問題，不管機器城以永動機的方式，多麼努力地創建人類牧場，人類創造的那點能量夠可能還不夠自己消耗的，這種能源的產生方式十分可疑。如果養人都可以創造能量，還不如養豬呢，豬可比人簡單多了）
人類自身就是一個高度演化的生態系統，在機器智慧看來，它最缺的是這種演化方式，沒有人類的榜樣，它的發展也就成了謎，一個機器獨霸了地球，有什麼意義呢？
就像你一個人獨佔地球，整個地球就剩你一個人，你想幹嘛就幹嘛，而且你也不吃不喝不拉不啪啪，那你到底想幹嗎？人生的意義是什麼？機生的意義是什麼？
機器沒想明白過這個道理，所以它不想馬上滅了人類。它造了一個matrix虛擬系統，明曰為了維持人類生命存在，獲得生物電池能源，實際上可能是想學習，想觀察，想理解人類。就像滿州民族、蒙古民族，佔了中國之後，並不急著把所有原住民全殺光，他還要留一些，研究一下。不就是有線網升級成WiFi嘛
剛剛看完~ 這麼偉大的作品我這麼多年後才真正第一次看，實在慚愧。
我不贊同上面的大多數說法，「無線接入」、「成像系統」甚至「頻譜」，我覺得對原著來說太「添磚加瓦」了。
我的核心觀點是，電影中的所有世界都是「非真實」的。
Matrix的內涵不僅是指代機器城所構造的1999年的世界，而是包括了ZION、機器城這兩個對立面的2199年世界。
電影裡面多次提到Out of Control，這是在多個語境下面發生的。Out of Control是Kevin Kelly的一部科學哲學著作，約早於黑客帝國拍攝5年寫就，中譯《失控》。傳聞拍《黑客帝國》時，演員被要求必須看《失控》。對於未看過的同好，我簡介裡面提到幾個可能和電影有關的核心觀點（小弟才疏學淺~如有誤讀了請指正啊~~）：
1. 群體智能是一個比個體高階的智能，群體智能有持續進化的行為；
2. 科技本身是一個有機的進化體；
3. 程序加入」選擇「或者說」變數「，會產生進化行為；（KK在90年代初已經接觸到當時最新的智能演算法研究前沿知識，比如蜂群蟻群遺傳演算法，了解到許多相關實驗和成果，《失控》書中有章節講述。）4. 」變數「可以締造人工智慧體，也產生」失控「；
5. 人類和科技共存共生，"共同進化"的思考。
6. 模擬排序程序代碼的」雜交「行為，多次迭代後產生了更優的排序代碼！（作為計算機系學生，看到他說的他親眼目睹的當年的這個實驗，覺得很驚訝~也覺得自己無知。。。）
另外請對控制論（之類？）有了解的可以為我補充或修正，我記得某處有個觀點，大意可能是系統的」穩定「和」無序「兩者相關的，我說不出來~
鑒於電影和《失控》的聯繫，我更傾向於用《失控》來解碼這部電影。我認為，這個世界裡，不應該區分「人類」、「程序」，更加貼切我們應該稱呼他們為「智能體」。
在Matrix的世界裡面，最高的智能是Architect和Oracle，一開始在第一集里，Oracle令我聯繫到計算理論裡面的全知解答器，但電影裡面顯然她不是全知的，到第三集最後，更是暗示Architect和Oracle是在做「實驗」，一個關於智能體/群的進化，和系統的平衡（電影裡面多次提到等式兩端的平衡，這個等式，兩端指的應該是「機器城」和ZION）的實驗。
Architect和Oracle不止一次地進行的這個實驗的意義，全部直指我前文提到的《失控》裡面的觀點！
而機器城和ZION，都是他們的實驗的一部分，這就是Matrix。第二集的最後Architect告訴Neo，他是第六個Neo，也就是兩位「天神」的第六次實驗。實驗的對象是」機器城「代表的智能，和」ZION「里的人類這個群體代表的智能。第三集的結局，表明了這次實驗裡面，Matrix世界（記住不是只指1999年世界，還包括了2199）實現了之前未出現的」進化「，雙方達成」和平「，也就是Matrix這個系統實現了內部的相對」穩定「！（第三集最後對於和平的說法，表達了對於這個系統能持續多久的」平衡「有待驗證）
而Smith（作為一段機器城產生的程序）、Neo（作為所有」人類「的特例），兩者都是Architect和Oracle往實驗裡面，分別對」機器「方和」人類「方加入的「人工」干預，一段」變數「。
Oracle對ZION的」幫助「，給予Neo的「選擇」，對Smith的」感染「，均是在對Matrix世界加入干預。而Oracle和Architect這兩個在Matrix裡面的出現，只是兩個「天神」級別的智能體在裡面的化身而已（總要有個形象代表對吧？）。
因此我理解這部電影裡面的所謂「虛擬」世界觀，有兩個層次。
第一層，2199年，即機器城和ZION並存的世界。
第二層，1999年，即機器城創造的「缸中之腦」的世界。
Architect對這兩層虛擬世界的設計，為的是實驗如同《失控》所提的」共同進化「，人類和科技的共生和發展。最初的設計，是讓機器為人類提供」缸中之腦「世界，機器依賴人類提供能源，從而實現共生。但」完美「的系統更容易不穩定和」失控「，從而總會發生」變異「的代碼（比如法國人，不能回收的小女孩，和Neo互相作用後的Smith等都是），以及產生人類的」抵抗軍「，沒有實現Architect實驗的預期結果。前五次的實驗裡面，為了得到一個」平衡「的人類和科技」共同進化「的系統，Oracle的干預就是給予實驗對象」選擇「（就像遺傳演算法實驗裡面用到隨機數」選擇「）但均以ZION的毀滅告終（但之後每每又重鑄ZION重新進行實驗）。第六次裡面，Architect的實驗系統作為整體得到了進化，機器需要Neo來消滅其內的」病毒「Smith，雙方（暫時）結束戰爭，實現了系統整體的平衡，人和機器共存。
至於指向」智能個體「的進化的細節，不難舉例，包括」代碼升級「，更強大的Agent等等。
最後Architect和Oracle提出這個穩定能持續多久的疑問，也可以說是為後續埋下伏筆。。。吧。。。
有些細節想不起了，但我覺得我的理解能說通大部分細節和隱喻。=P 比如在ZION裡面Neo擁有的「力量」，Architect對於Matrix、前5個Neo、毀滅ZION重做的解釋，等等。有錯請指正啊~~~
當然我一開始說」非真實「也未免不嚴謹了。像我所說，一整個都是實驗，那何處定義」真實「呢？。這個。。。。。。
先看《失控》後看這電影，或者有點先入為主，大家討論討論啊~~~我覺得Neo在第二部中穿過那扇門後與Source建立了聯繫，獲得了The One的能力（許可權？代碼？），從而能與烏賊較量。
在現實（Zion）中，Neo或許可以通過無線裝置與Matrix、Source聯接，從而行使他作為The One的能力。
如果zion是真實世界。那麼史密斯是如何接入血肉之軀的船員身上，人類大腦如果接受ai得意識的話。架構師應該弄大量的人類身體讓ai接入血肉之軀。來採集更多的試驗數據。而不是讓往人腦輸入模擬信號創造矩陣。
矩陣本身的存在基於一個最大的前提，就是物質層面的基礎依然無法跨越。否則直接把人的意識弄到計算機內存里去跑就可以了。這樣節省大量手續和資源。有自我意識的ai能跑人類就不行？說明在脫離肉身電子設備里人類無法存在，只好保留身體插管維持。說需要發電的大可以歇歇了。架構師肯德基老頭明確表示了，人類死光機械文明也能承受。人體電池頂多就是一個能源提供渠道罷了。並不是唯一的和不可或缺的。黑客帝國世界顯然是個能源匱乏的世界。而養殖這麼多人類建造矩陣的目的更多的是提供物種多樣性罷了。
機械文明很明顯是有瓶頸的。它只能在已有的理論體系里細化而無法做出真正的創新。也就是所謂的隨機性。黑客1裡面墨菲斯部分提到了一點這個內容。而矩陣最大的目的就是讓機械ai有更強的創造性。結尾的印度小女孩就是進化後的新型ai。她創造出了矩陣里前所未有的不符合自然表現的藍色彩虹來紀念尼歐。這導演已經說的很清楚了。
zion的屬性是不是虛擬的。我認為是。證據不僅是章魚自爆，斯密斯對接人腦。還有一個重要的點就是架構師說的話。zion已經滅了六次。整部電影中架構師和先知的對話是最重要的。這等於是矩陣兩個最高管理員的意見。在真實世界裡每次都要往地下先挖幾百公里深建一個供幾萬人住的城市然後再炸掉。再挖再炸反覆六次，這要有多蠢。請注意。黑客帝國世界不是一個資源豐富的世界。折騰這麼多事情耗費掉的資源足夠造好多個月球基地了。如果是再計算機程序里炸六次就耗不了幾度電。這就很好證明了zion是虛的還是實的。
請注意，為什麼機械文明不向太空發展。機器人不需要呼吸空氣無所謂重力，明顯比人類太空更適合他們發展。我覺得這個是機械文明在理論體系上被卡住了。沒辦法走星辰大海之路。這可以從電影里得到佐證。反重力這個戰前就發明了，人腦插管也是，所有電影中的科技都是戰爭前就有理論基礎了。但是人機大戰結束這麼久了，技術卻沒有多少明顯的進步。二十世紀一百年變化多大？所以機器人需要保留人類這個物種，並建立矩陣以此來想辦法獲得人類的創造能力。這也可以解釋為什麼要消滅斯密斯，因為斯密斯把所有程序都變成他自己，這意味著機械文明永遠停止升級進化。尼歐跟機器大帝的交易就是雙贏：消滅斯密斯，還人類自由，給ai創造力，兩個文明各自得到新生。這也是動畫版二次復興里那句話「上帝保佑所有的智慧生命」的意思。首先，大家想想，每次墨菲斯他們進入母體是通過什麼？是一個設備，這個設備在飛船上，但飛船是在空間移動的，並未有線接入母體，也就是說，母體對外提供無線通信介面，使自然人的思想能夠進入母體。
後期，我們發現NEO在攻擊章魚之後，進入了母體，滯留在「地鐵」，這也就是說，他沒有通過飛船的設備進入了母體，可以理解為腦電波或其他方式，但他確實成功的接入了。
我們再看，母體是一個系統，虛擬社會、真實武裝（章魚等）都直接受控與母體，或稱之為母體的一部分。如果想破壞章魚，有3種方式：1、母體下命令廢棄章魚；2、破壞章魚的行動（或與母體的通信）程序；3、物理破壞（人類的常規手段）。
NEO能夠無線接入母體，可能用下列方式進攻章魚：1、起到了某種病毒的作用，在現場捕獲章魚信息，向服務端（母體）發送干擾該章魚的指令；2、向終端（章魚）阻斷章魚與母體的通信；3、直接影響終端（章魚）的系統。
這3條都可能幹掉章魚，第2條有些牽強，因為章魚很可能屬於軍閥模式，即不完全受中央支配，有自主邏輯，僅僅是服務於中央，如果這樣的話，阻斷通信應該沒用。第3條也牽強了些，以現在我們的設計思想，不會給章魚設計接入介面，因為它僅僅是個終端設備，所以直接攻擊也不太可能。 我更傾向於第1種進攻方式。
謝邀。
引用肯·威爾伯的層級理論（注意，這位作者是在黑客帝國的根源中出鏡進行解說的哲學家，而該部紀錄片則是兩兄弟……姐妹邀請一系列人物進行評論。所以，質疑其說服力的可以先去看紀錄片謝謝。再者，實際上Martix中Neo的進化（可能不是恰當的用詞）就很像肯·威爾伯在No border 中描繪的層次性。最後，不要跟我講「科學性」這三個詞，因為大部分時候你們所謂的「科學性」不過是過時又無趣的某些唯物論而已。當然啦，要是真的講究邏輯性和科學性的人，我覺得會同意我以下的說法。）
肯·威爾伯的層級理論是出自其《性，生態，靈性》這本書，該書頗厚，就不詳細說明了。以題主的問題為例回答吧。
在影片關於Zion和Martix的真實性的爭吵之中， 常常有一個不假思索的假設——Zion相對於Martix而言更加的高級（higher）。無論是Zion是否是真實的，我們都下意識的認為，Zion總是優越於Martix的。我們的爭端往往只是局限在Zion是否是真實的，假設說其實不真實的，那麼總有人下意識的說，那麼真實的究竟是什麼？假設說其是真實的，那麼也有人說，那麼Neo為什麼可以在Zion中也使用超能力（暫且如此命名）？
本來本人想用唯心的立場去解釋，因為實際上那樣好解釋很多，也通順很多。當然，這也需要受眾有一定的哲學素養，對思維中的各種習慣性的預設作過批評性的思維。
不過，即便採用題主的前提，也並非不能夠解釋。關鍵的地方在於，我們一開始所做的假設就是錯誤的——Zion比Martix更優越。
肯·威爾伯的層級理論中，有這麼一個觀點：
假設A與B是兩個事物，A的存在是B的充分條件，而B的毀滅並不會影響A，那麼，我們就說，A是相對於B而言，更為基本的。同樣的，也是在層級中較低的。
舉例來說，人人都知道原子和分子以及他們的關係。原子構成了分子，而分子的存在與否，不會影響原子的存在與否，那麼我們說，原子是相對於分子而言，更為基本的。當然，也是更不重要的。這裡的重要的意思是，分子所能實現，所能具備的功能更多。比如H20,水的存在只有在分子層面的構成才能看到，而在原子層面，恐怕永遠找不到水。當然，我們可以說，原子本身就具備了變成水的可能性。這毫無疑問，不過倘若再追究下去，就是唯心論的範疇。因為你必然要繼續追問道，那麼這些可能性又是哪裡來的？亞原子嗎？夸克嗎？所以就此打住，僅僅只停留在這個層面上進行解釋。
再舉一個例子來說，人和器官的關係。器官相對於人而言，無疑是部分的。但是人也不可能脫離器官而存在。同樣的，人所具備的功能，在器官層面上，也不可能能夠一一的找到。比如說……語言，概念等等。
拿到題主的問題來說。
Martix和Zion誰在層級上更加的優先？毫無疑問的，是Martix。
因為，Martix即便毀滅了，也不會影響到Zion。而Zion如果毀滅了，Martix也不存在了。
所以，不是如很多人所設想的那樣，Zion高於Martix，恰恰相反，Zion只是Martix的組成部分而已。
根據上面的例子，器官的功能可以在人的層面上實現，所以Zion所能做到的事情也能在Martix中做到。又更高一級層級包含了較低層級的存在，並且湧現出了新的功能（如Neo的超能力），同時也可以作用於較低層面。如人可以對器官動手術。
所以，當解決這個問題之後，我們可以直接推論道：
由於Martix是高於Zion的層級，所以Martix中的功能可以在Zion中影響。
所以，根據影片的結尾Neo的表現，我們可以推論：Neo在Martix中所習得的功能，恰好是在Zion中所能實現的功能。為什麼要用恰好呢？因為較高層級所實現的功能，不一定都在較低層級能夠直接實現，譬如人和器官的關係中的，語言與概念，言說與表達。
當然……接下來還有一個推論：Martix不是虛擬世界。證明從略。完畢。
禁止轉載。
謝謝。
遙控啊，你用個遙控板還能控制電視了，尼歐這麼高許可權還不能遙控個烏賊啊
黑客帝國里的矩陣和笛卡爾的魔鬼論相比，有何異同？ - Vein Xing 的回答 - 知乎
對這個問題，首先zion是另一層虛擬空間這種觀點，很顯然是不成立的。原因如下
（1）這部電影最終取得了人類與機器的和平共處，如果zion是另一層控制那麼這種和平還有什麼意義？ 那樣豈不是作者在無理取鬧嗎？
（2）在第二部「設計師」講過，如果neo不去代碼源，而是去救他的女朋友的話，人類和機器將同歸於盡，當然是因為simith（病毒）他會讓主機癱瘓，主機都癱瘓了那麼與主機連接的人類當然也活不成。這就是neo在這部電影作為救世主而存在的理由，如果zion是另一層虛擬世界，那麼neo的存在還有意義嗎？那豈不是說最後neo自我犧牲也沒有將人類從虛擬世界中拯救出來，不是嗎？如果這樣,那些認為zion是另一層虛擬世界的人，你們不覺的被電影作者耍了嗎? 到最後什麼都沒有改變，人類仍然是機器的奴隸，那樣的話這個故事就是一對廢話，拍了三部，等於沒拍？
我的觀點是：通過這三部，作者想說的是，現代社會中，人類離不開機器，機器也離不開人類，機器與人類是平等的，是和諧共存的，機器是通過為人類服務而實現其價值的，但這並不意味著它們是人類的奴隸，因為人類需要機器，為了讓機器為自己工作人類也會無條件的給機器提供維修和升級，這樣說來恐怕我們也是機器的奴隸。我們能想像沒有機器的世界是多麼可怕的，不能坐飛機，不能看電視，不能上網，不能住在高層建築。。。。。。
這部電影中neo是人類的一分子，同時也是機器的一分子，說他是人類的一分子當然不必解釋，說他是機器的一分子，原因是他是電腦的升級或重裝光碟，所以從某種意義上講他具有雙重身份，他既有人性的一面，也有機器性的一面，這也是在第一部中被叫做thomas anderson的原因，thomas在英文中有「雙生」的意思。他可以在虛擬世界和現實世界中自由進出,很難從邏輯中講清其中的道理，但是我們要承認neo是救世主，既然是救世主，他在現實世界中和母體中有超能力也沒有什麼大驚小怪的。唯一可能的解釋就是neo擁有超強的腦電波，使他可以不用連接母體的情況下，也能感應到母體，再通過母體來控制烏賊，使它癱瘓掉，這也是neo瞎掉後依然可以看到機器和simith的原因，而他看不到他的女朋友是因為人類發出來的電磁波沒有機器發出來的強烈，電磁波不足夠強的話就感應不到。
再回到作者的中心思想上，我在前面已經說了，作者通過電影想表達的不是neo擁有超能力這種對整個電影而言不是很重要的東西，只不過想表達，人類和機器是相互離不開的，人類要擺脫「機器是人類的奴隸」這種狹隘的物質觀念，任何時刻都應心中有博愛，跟自然和平相處，不要把自己當作世界的主宰，要記住破壞大自然的平衡也意味著人類的滅亡，利用科學來征服自然來改善生活的同時也要保護好大自然，感恩大自然！
因此電影沒有詳細解釋neo在現實中擁有超能力的原因是解釋和不解釋根本就不會對電影的結局帶來帶來任何轉折，解釋也好，不解釋也好，neo都必須通過自我犧牲來換取人類與機器的和平，我更喜歡他不解釋，這樣更能充分體現出neo是救世主的的地位，就像耶穌一樣，他可以被殺死了還可以復活，常人做不到的事情他就可以做到，誰也不能用科學來解釋清楚的。
我真佩服某些人的想像力，黑客帝國竟然是一場連環夢？母體就是夢裡做夢！！？？？
因此這三部電影等於一堆廢話！！？？？
所以可以得出結論 ：那些想像zion是另一層虛擬世界的人，對這部電影解釋了半天等於什麼也沒有解釋。
兄弟們，再怎麼想像也要考慮一下故事作者的感受吧
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