大自然有哪些 bug？
如果說大自然是一個自然進化數億年的系統程序，那麼都有哪些bug呢？
「什麼，應用程序本身竟然會懷疑係統是不是有bug？」
「是真的，真的懷疑了。」
「好吧，這程序有bug，」
「會不會導致系統崩潰呢？」
「上次崩潰好像是一百多億年前，可能確實需要重做 ！」
大自然的bug能叫bug么，那是未經注釋的功能特徵
我一直覺得有一個很明顯的Bug——宇稱不守恆，弱作用力竟然是左右不對稱的。
天吶！手征對稱性居然會失效！
弱作用力的不對稱毀滅了自然界無數本該對稱的存在。
Pauli 把這個讓整個學術界都震驚的發現描述為「上帝是左撇子」。
在1957年以前，科學家普遍認為物理定律是左右對稱的，或者說稱之為宇稱守恆的。宇宙的基本規律對於左和右沒有任何偏向性的觀點被普遍接受。整個宇宙中總共有萬有引力、電磁力、強相互作用力、弱相互作用力四種基本的力，其中萬有引力、電磁力、強相互作用力三種基本力都是嚴格的宇稱守恆的。起初，弱相互作用力也被理所當然地視為宇稱守恆的。
然而1956年兩位華人物理學家李政道、楊振寧通過分析過去一些「異常」的實驗結果發現，弱相互作用可能是宇稱不守恆的，也就是說弱相互作用具有手征偏向性，並提議用一個實驗檢驗它。
李政道、楊振寧先生髮現的弱相互作用的宇稱不守恆就是對左與右的最嚴格，也很可能是唯一有效的區分。由於，其餘三種基本作用都是嚴格對稱的，只有弱相互作用以及由其產生的一些現象（比如左手型分子的優勢地位）具有手征偏向性。通過觀察弱相互作用產生的中微子是觀察宇稱不守恆性的簡單而有效的方式。因為所有的中微子都必須經過弱相互作用才能產生，都是左手型的，如物理學家奧托·弗里施的話來說，中微子的飛行就像是從一支有著左旋膛線的來複槍中射出的子彈的旋轉。
1957年，另一位華人科學家吳健雄完成了這個實驗，確實地證明了宇稱不守恆。這是人類第一次發現大自然基本定律的手征對稱性破缺，這在當時引起了巨大的轟動。關於這一實驗的消息在數日內傳遍了整個物理學界。量子力學奠基人之一、諾貝爾獎得主泡利對此結果給出極高評價，稱這個結果表明上帝是名「程度較輕的左撇子」。考慮到宇稱不守恆這個發現的重大意義，就在1957年當年，李政道、楊振寧兩位華人科學家立即被授予了諾貝爾物理學獎。也就是在1957年，「大自然是程度較輕的左撇子」的觀點被科學界普遍接受。
大自然居然對左和右有偏向性！這一定是個大bug！
完全沒有理由啊，完美的左右對稱多美好。
人類從體外到體內都會充滿了對稱的美感。對稱的心臟長在身體中軸線上。所有數量唯一的器官都必須長在中軸線上。肺葉的數量和位置也是對稱放置的。人類左撇子和右利手的數量變得一樣多。
而現在的情況是，
體外還是對稱的。體內則「慘不忍睹」。心臟居然在左邊。肺葉左二右三，連數目都不一樣。胃也是一個形狀和位置都畸形的器官。
我們發現的生命還都只能消化利用左手性氨基酸構成的蛋白質。右手性的完全浪費掉了啊！吃了右手性蛋白質不但補充不了營養說不定還會拉肚子。
許多合成藥品中的藥物都是左右參半的，只有一種有療效，另外一種常常沒用或者有嚴重的副作用。比如，鹽酸布比卡因是一種麻醉藥，它有造成病人心急梗塞的風險。後來發現，這種副作用是非活性的右手性分子產生的，而真正有效的左手性分子並沒有這種副作用。
作為生命體遺傳物質的DNA螺旋結構居然全部是右螺旋的。DNA左螺旋的生命們，請告訴我你們在哪裡。
有一種一顆耗子屎壞了一鍋粥的感覺。
我只能默默期待著，「所有的不對稱對蘊藏於更廣大的對稱中。」
左手是不對稱的，但是當我們把右手也考慮進來後，我們就得到了更高尺度的對稱。
希望反物質（或者暗物質？）恰好構成了50%的宇宙，且在那裡「上帝是右利手」，這樣我們的「上帝」/大自然還是完美的左右對稱。我默默地YY著。
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根據評論區的反饋再補充一點與題目無關的東西吧。
首先要強調的是這真的不是處女座強迫性，這是很嚴肅的問題好嘛...
因為宇稱不守恆會帶來很多違反"自然「的事。
宇稱（P）不守恆的意思是空間反演不變性失效。也可以說物理定律的手征對稱性破缺。
不僅如此，T（時間Time）對稱也必須是不守恆的了，於是時間反演不變性失效。也就是說時間的正負也不再是對稱的。
「時間的反演不變性失效」的後果是什麼應該不需要解釋了吧。請告訴我我們學過什麼物理定律是自帶時間剪頭的？這後果還不嚴重么？
物理定律從沒有時間符號變得有時間符號了，大自然不只有了「左」「右」之別，還因此有了「過去」和「未來」之分。
為什麼說因此？因為這一切都是宇稱不守恆這個坑貨導致的。
CPT對稱性（Charge/Parity/Time 電荷共軛/空間反演/時間反演)是嚴格守恆的，發現P對稱破缺後，CP對稱也接著被確認破缺，因此T對稱也就必須破缺。
為了維持這個世界的平衡，有一個CPT對稱引出來的「鏡像宇宙」理論。（看吧，真的不是某部分人的強迫症，對稱是不需要理由/自然而然的，不對稱才需要理由去解釋。）
CPT對稱現在可以說是學術界的「底線」了，連這個都完了，那物理真的就完了... 不過幸好的是，CPT對稱被數學家和理論物理學家證明過了。
為了守護完美的對稱，「鏡像宇宙」應運而生。
【所以默默期待默默YY的人絕對不止我一個啊！】
引申CPT對稱可得我們宇宙的一個「鏡像」——所有物體的位置都被一虛擬平面所反射（對應宇稱反向），所有動量反向（時間反轉）及所有物質都被反物質所取代（對應電荷反轉）——在跟我們一樣的物理定律下會如何演進。CPT變換把我們的宇宙變成它的「鏡像」，反之亦然。CPT對稱被認為是所有物理定律的基礎性質。
為了保住這一項對稱，CPT中任何兩個對稱所組成的對稱（例如CP）被破壞時，對應地餘下的一個對稱（例如T）也一定會被破壞；實際上，就數學而言，兩者是一樣的。因此T對稱破壞很多時候會被稱為CP破壞。
引自維基百科：http://zh.wikipedia.org/wiki/CPT%E5%B0%8D%E7%A8%B1
鏡像宇宙和評論區里屢次出現的平行宇宙不是一種東西。平行宇宙理論一般不用在這裡。
平行宇宙這個詞一般指的是一種量子力學詮釋，平行宇宙理論是為了解釋量子力學的概率而出現的。這對平行宇宙的限制非常少。
而鏡像宇宙必須是我們宇宙的CPT對稱版。（電荷共軛、空間反演/手征對稱、時間反演 三者同時出現）
最後再次強調，對稱是不需要原因的，不對稱才需要理由去解釋。
非要解釋的話舉個容易理解的例子吧。
空間平移不變性（也叫，空間平移對稱性）：這個對稱性的成立真的不需要理由。
但是，蘋果居然會從樹上豎直落下？！ 空間各向同性居然被破壞了！（如果空間平移對稱性在蘋果所在的地方還是成立的話，那麼蘋果不可能向任何一個方向運動！否則空間各向同性被破壞。）這麼完美的對稱都破缺了！於是牛頓咆哮了，這裡必須有原因啊！然後他發現是引力這個坑貨改變了空間的對稱性。再然後，我們把這個改變了空間平移對稱性的東西叫做」引力場「。
最後拿真正的物理來結尾吧。
一種對稱性必然對應一個守恆量。【1918 年德國數學家艾米·諾特（A·E·Noether）提出了這個著名的諾特定理（Noether theorem）】
CPT對稱守恆，但CP對稱竟然破缺，或許一些人很難體會到這種「酸楚」。沒關係，我再說一些直觀的大家就明白...
空間平移對稱性對應動量守恆。
時間演化對稱性對應能量守恆。
空間旋轉對稱性對應角動量守恆。
以及等等等。
一一對應地，在量子力學裡，
空間坐標x和動量p是一組對易量，滿足不確定性原理，位置和動量不能同時確定。
時間坐標t和能量E是一組對易量，滿足不確定性原理，時間和能量不能同時確定。
角度坐標theta和角動量J是一組對易量，滿足不確定性原理，角度和角動量不能同時確定。
以及等等等。
看到這一切多美麗了么？還忍心看見對稱性隨便破缺？你能忍你喝的水突然凍成冰又突然燙傷嘴么（能量不守恆的話）？
這宇宙總有一些不能憑空出現，也不能憑空消失的東西。每一個不能憑空出現也不能憑空消失的東西（守恆量）都為這個宇宙帶來了一個對稱性。
考慮到大家應該都明白能量守恆的意義。我想現在應該沒人說」宇宙不需要對稱性「，也沒人說」不對稱才自然「了吧。
又回到那句話，對稱是不需要原因的，不對稱才需要理由去解釋。
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1.《右手，左手：大腦、身體、原子和文化中不對稱性的起源》，本科時偶然讀到的一本書。作者詳細地介紹了關於這方面的資料和思考。
當時也隨手看了看簡單的文獻，暫時未發現與作者觀點違背的地方。但是，將這裡的觀點視為一種有一定證據的假說更合適。
2.左旋DNA非常罕見是存在的。正因為對稱性的破卻，才導致右旋DNA是絕對主導。注意，重要的是，左/右旋DNA的失衡，而不是左旋DNA稀有的存在性。只要左右旋DNA嚴重失衡就足以說對稱性破卻了。
沒有bug。
因為沒有需求文檔，而且也不知道甲方是誰，乙方當初的老闆兼唯一的程序員寫代碼花了六天，第七天本該測試，結果人家歇了，就這麼直接上線運行了好幾千年。
現在乙方就剩幾百萬客服，專門給用戶解釋「這些不是bug，當初甲方需求就這麼定的」，還有法務部門四處警告科學家「不許反編譯我們的代碼！」
油畫《乙方CEO和高管們共進晚餐》
乙方現任客服總監兼法務總監：
樹木榮枯，星河燦爛，宇稱不守恆，波粒二象性。
因果不逆，質能可換，重力扭空間，光速不能超。
——宇宙就這麼運行著，與你無關，與我無關。
縱然人類的行為可以影響自然，也都是遵循著物理規律，所以不是bug。
真正的bug，是智慧，使得這些規律可以被發現、被討論，被理解。
之所以進化出高等智慧生物，是因為宇宙太孤獨，它渴望被理解。
======以上是本來的回答，建立在宇宙的範圍上======
後來發現問題的討論的範疇在於地球和身邊的自然，可能要換一種說法，不過意思是一樣的
一、要先定義一下bug.
從軟體的角度想，bug就是軟體運行中與預期行為不同的行為。比如我這一段程序的意思是要低通濾波，但出來的結果成了高通濾波，這就是一個bug。或者我程序設計要跑1萬張圖片，結果跑了1000張就卡死了，這也是bug。所以要定義大自然的bug，必須首先想明白什麼是大自然「預期」的行為。
大部分回答人類是bug的知友，都是在講人類已經不受控制破壞自然，造成了自然生態的不平衡不穩定，所以是bug。這樣說法已經假定，自然的預期行為，該是平衡的穩定的和諧的以及「適宜人類生存發展的」。而這樣的假定，不過是人類主觀給自然強加的「感情」。大家常說，人類破壞環境遭到地球報復，山崩海嘯造成人類死亡。這也是常見的例子。
二、為什麼人類不是自然的bug？
因為地球和自然的「預期」的行為真的是這樣么？是誰定義了地球該怎樣、不該怎樣呢？地球沒有宿命，今天沒有被人類毀掉，億萬年後也可能被外來天體撞毀，也有可能圍繞太陽直到太陽變成紅巨星被吞噬。地球和自然根本不care！
真正care的，其實是人類。因為人類是想要種族繁衍生生不息，這是人類對自己預期的行為。從這個角度講，人類是人類自己的bug。
所以說，只要人類還在符合物理規律做事，無論做什麼都不是bug，因為地球和自然也不過是按照物理規律在運行，而運行的結果，不過是這一切因果概率的疊加。人類有一天用核彈把地球炸成兩半，也依然不是bug——這都應該是預期中的運行結果。
再說一句我覺得什麼才叫bug：
bug的應該是超越這個系統之外的東西。比如人類獲得了超越物理規律的能力，讓地球停止了自自轉；或者搞出了永動機，或者搞出了可以逆轉因果的時間機器。
因為我認為宇宙本身，是物質的，它再燦爛再複雜也是物質的。而智慧是超越這個系統的存在，所以我覺得智慧是bug。
但這是一個好的bug。當智慧出現的時候，它可以理解這些物質和現象，它讓死寂的宇宙可以被觀察被感知，這是多麼美的一件事啊。
我現在正坐在窗邊打字，看夕陽下山後的餘暉。有沒有人類，餘暉都在那裡，可是，我一個小小的智慧生命由此體會出的美感，卻是整個物質宇宙永不能企及的事情。
最大的BUG就是自身的病毒進化成了人類
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蟑螂是這個世界上最不應該存在的生物，沒有之一，長那麼丑也算了居然還會飛，會飛也算了，居然還打不死，明明都踩扁了，居然過一會還能活，肚子被踩破了，裡面居然排除幾百隻白色的小蟑螂。把蟑螂的頭切掉，居然還能活，還能交配，還能繁殖後代，最後是因為沒嘴吃東西餓死的。在極度輻射之下，居然死不了！這種逆天的存在，大自然為什麼會讓蟑螂存在？
這個世界最不可理解的就是它竟然是可以理解的。——愛因斯坦
最大的bug就是你們這些代碼居然都會質疑程序了。這就是個bug。
很多啊
其實我更想知道大自然有沒有隨機數...
大自然中充滿Bug，一天一夜說不完，在你說完之前新Bug就已然產生了。
舉例就是能量代謝。
人相對於細菌，可能只是一個草稿。
三羧酸循環就是具體事例，人的糖代謝是一份子葡萄糖（理論）產生38分子的ATP（相當於38份的能量），但是實際產生的要少掉1/4的ATP。
看似比其他的要經濟，但是人類的糖代謝途徑有極大缺點，①依賴氧氣，②只能是從葡萄糖中取得，③過程繁瑣，需要多種酶的調控，④歷時較長。
依賴氧氣就意味著整個人體對缺氧的承受力是很低的，5分鐘缺氧就腦死亡了。
只能從葡萄糖獲取能量，意味著人的能量來源少了，纖維素首先就對人體來說沒有營養作用，其次，為了配合只能代謝葡萄糖的細胞，就必須通過很多途徑吧一些其他非糖物質或其他種類的糖先轉換成葡萄糖。
過程繁瑣，越繁瑣的工序就越容易出亂子，有一個酶缺失這個人就要出問題，有一部代謝紊亂這個人也不行。粗暴的說：需要十步的過程出問題的幾率就相對於需要一步的過程增加了很多倍。
歷時較長，別看一份子葡萄糖產生38分子的ATP，但是架不住需要時間長。有些細菌，甚至癌細胞，可以至進行產生兩個ATP的乳酸代謝，但是效率奇高。
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雖然進化論仍存在諸多毛病，但是依然以此為大背景。
沒有乙方？笑話。
大自然其實既是甲方又是乙方，甲方是個洋洋務務的程序員，乙方是個挑剔滿滿的客戶。
甲方跑出一條低級程序，組合成各種各樣的高級程序，工作倒是很勤奮，做了一堆各式各樣奇奇怪怪的程序，但是乙方這個不行那個不行，不符合的就丟掉。
甲方就是概率，乙方就是環境。
環境的解除Bug的作用其實是很笨拙的，淘汰。
今天乙方好這口，就淘汰掉自己不喜歡的，改天口味又變了，之前淘汰掉的那個其實是喜歡的，但是早就不可復還了。======================================================================
都是 Feature 啊哈哈哈哈。
同性戀。
（我知道這麼回答容易招黑，我說同性戀現象是bug有兩個意思：1.它在直觀上直接與主流的遺傳與演化的學界範式相抵觸；2.這麼大一個扎眼的bug居然學界至今還沒給出一個令人信服的解釋。當然，對這個bug的修復不是消除它，而是儘早解釋清楚它的原因。）
自然這麼完美，區區人類竟敢妄圖找大自然的BUG。
所謂Bug，大概是不能按照人的邏輯或者預想去進行的事情。比如編一套程序，中間某部分沒有按照人的設定去實現，程序猿就說出bug了。在bug的世界觀里，人大概是最大的。
大自然太牛B，它本來就不是按照人的意志去運行的，沒人敢確定它有什麼bug。
所有的大自然的bug都得是別的物種去適應它，包括人類，也是適應大自然bug之後產生的結果。
如果說大自然有bug，那人類的產生或許就是bug之一。
大自然的bug，在中國大概被總結為「天道」，在西方大概被總結為自然科學、進化論之類的。
哪天大自然不開心了，再來幾個艾滋病這樣的bug，到時候人類都木有了，大自然就會微微一笑：
很多答案都不錯。
我覺得一個顯然的Bug就是，圓周率
這個世界是有BUG的，BUG就是短暫存在卻又瞬間消逝的「完美」。
同時世界又是不允許存在BUG的，因此這類BUG只存在於時間長河中短短的相對瞬間，當某個領域的完美不經意間誕生，程序會辨別出，並頃刻將其破壞或者毀滅。類似事件或許你我都曾見識過：完美的階段感受，完美的愛情片段，完美的生活狀態，外在與品性皆如天使般的少年或少女... 可一旦當他們初露光彩或為眾人所知所仰，一時完美的情境就會被突如其來的境遇破壞。且初始的設定越美好，之後的損壞就越慘重。
破壞程序總是伴著「完美」狀態的啟動而生，當它發生在個人身上，那種感受就像是看著美夢瞬間消散。
以上段落，意在說明我認為程序本身是具備自動發現問題與糾錯功能的。運行中錯誤必然會產生，但糾錯或掩蓋功能卻也是程序中的一環。就像我們總會犯錯一樣，有的錯被改正了，有的錯被藏匿了，但那不代表錯誤從未發生過，也不代表我們有絕對能力杜絕錯誤的發生。而後續彌補其實也只是不得已為之，屬於亡羊補牢的下下策。舉幾個人人皆知的例子：生而完美卻遺失了後半部的某名著，它並非因為殘缺而完美，而是因為偶發的異常完美而被設定破壞。被譽為行書成就最高的某書法作品，在當世就已身負盛名，只可惜亦沒留存多久，真跡就永絕於世，時至今日我們所見的也只是他人摹本。被稱為「萬園之園」、「理想與藝術典範」的某園林，只精緻了短短時間就成為一片廢墟… 類似例子還有許多，因知識面有限就不再舉例，你可以從你的所知中，找出符合這一規則的現象思考。（如果不怪我腦洞大開倒是還可以舉一個反例：幾近完美之作的《蒙娜麗莎》能一直保存至今，與作者在其中藏了許多小彩蛋做了許多小動作有關，有關畫面背景透視的問題，神秘笑容含義的問題，什麼都在唯獨缺失眉毛與睫毛的問題，是否存在年輕版的問題… 將一幅畫設定的這麼複雜，以當時程序的設定實在是解讀無力啊… 達芬奇屬於智商遠超程序規則，甚至可以重塑規則的那類人，他看清了程序的運作機制，讓程序誤判為這是一幅失敗之作，才讓作品在長期相對平順的環境中被完整保存了下來。）
倘若沒有瑕疵，那要這世界怎麼容你。程序在最初的設定中就是以「事事不完美」來定義的，在由諸多不完美組成的當下，完美本身就是世界的傷口。世界的初始設定中有「完整」，卻無「完美」。而「完美」作品/現象在短時期內被境遇毀滅，就是程序在給突破規則界限而生的完美安置一個「完整」的結局。
另外說一點，我不太建議以人類創作程序的思路去理解存在於「大自然中的BUG」，不太能接受一個程序必須有需方供方，甲方乙方的說法。（當然這種觀念的產生和我並不是一個程序員有關，因此很難就此受束於真正的程序員式思路。）如果從世界本身就是一件概念品、實驗品、信手拈來的嘗試性作品的角度去理解，世界這個「程序」本身也不必然就是一件有供需雙方的「商業產品」。也許最初的創造者只是為了滿足自身樂趣而做，他很可能只是因為有此能力，因此才希望借創造世界而實現自我。
同性戀
此BUG隱藏於哺乳動物及其他部分類構造函數中，頻發於繼承了哺乳類大量函數的人類身上。主要表現為人類實例中的性對象變數產生類型限定錯誤，導致性器官插入方法對另一對象的性器官變數名稱出錯，錯誤調用到被調用對象的排泄管道子類的張開方法，並傳遞參數精子，但排泄管道類沒有對該參數有針對代碼，最終導致總函數生殖的返回值為空。你們做愛的目的居然不是為了繁殖！！！！！
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