為什麼鳴人和佐助合力無法打敗宇智波斑，但卻可以封印大筒木輝夜姬？

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這個問題我感到非常迷惑

從漫畫來講，題主的說法並不準確。
鳴佐對斑的戰鬥，從673話《我們合力》中佐助到場開始，打到678話《我的意志是……》斑被黑絕殺死，戰鬥中止，戰鬥的主力就是佐助和鳴人，打了5話，其他人並沒有太多參與。
而鳴佐對輝夜的戰鬥，從679話《初始之物》輝夜使用時空忍術開始，打到689話《我最喜歡了》輝夜被封印為止，打了10話之久。如果鳴佐和斑打上10話，斑會不會被鳴佐封印了呢？這還不好說。
而且中間帶土有參與進來。

這一下要不是帶土進來擋一下，鳴佐很難應付下來的。
事實上，就說一開始輝夜把佐助扔進了異空間，要不是有帶土幫忙，很可能就變成鳴人和輝夜一對一，鳴人被輝夜打敗了。從這兩點（戰鬥時間、對戰人數）上來看，岸本想要表現的就是輝夜比斑更強，更難對付。
當然，正如題主所述，這一點在表現上並不是很成功，原因是輝夜這個人在之前劇情中毫無表現，而斑則有吊打五影、力敵初代、血戰凱皇的眾多戰績。
再加上輝夜基本連台詞都沒有，感情表現得也不多，斑卻刻畫得有血有肉，小時的戰爭經歷，成年的兄弟之情，後期的老謀深算，操縱長門、帶土，控制霧隱，隱忍幾十年，並且性格上經常顯得豪放而有氣魄。
可以這麼說，斑作為BOSS是站在全劇的最頂峰，著墨頗多，與劇情完美相符，而輝夜則只是一個空降的BOSS，商業化產物，讀者對斑印象更深刻也很正常了。

因為佐鳴幾乎沒有可能打敗完全體的宇智波斑。

再強都有弱點，本身六道仙人就給他們專門封印輝夜的力量。

所以讓斑打敗主角，黑絕再下手不是更好？

因為後來鳴佐二人去找game六道仙人開外掛充值了

六道斑是打不過佐助跟鳴人聯合的，隕石群被破，無限月度被防禦，體術打不過佐助跟鳴人，鳴人用影分身就能抗衡輪墓，本體速度快不過天手力，被佐助一刀斬腰。如果沒有小櫻跟卡卡西的話，鳴人跟佐助是封印不了輝夜的。

因為輝夜智商比較感人

因為……岸本樂意，誰管的到

因為輝夜不像斑那樣會很多忍術阿

可以打敗斑