怎樣高效地管理自己閱讀過的文獻資料？

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看過的文獻，放在電腦里，回過頭再來找的時候就很麻煩，請問正在做研究的大牛，你們是怎樣管理自己的文獻庫的。

由於工作需要，我們同事每天都需要檢索、管理、閱讀大量的文獻（以下的討論就不局限於醫學類文獻了，我覺得不管什麼學科，管理文獻的基本思路是一致，但是仍以醫學類文獻舉例）。在開始介紹主體內容之前，先明確一下用戶基本的文獻管理「現狀」或者說需求：

我覺得對於許多人來說，產生文獻管理需求的時候都是手裡已經有大量的文獻儲備了（多數以PDF格式居多）。在收集、積累文獻一開始，沒有意識到管理文獻的需求，也就說沒有頂層設計，文獻存儲不科學、雜亂無章，檢索困難，利用困難。
許多現有的文獻管理工具（軟體）都有外部文獻（或者文摘）導入模塊，但是大多數只能做到導入和分類存儲，不能很好的提取文獻（特別是PDF文獻）元數據。也就是說，文獻即使導入了，在軟體內也很難實現高效的檢索。這是目前此類軟體共有的軟肋（這個問題牽涉的技術很多：有的軟體廠商選擇直接與學術出版商合作，拉取出版商的資料庫後台補全文獻的元數據；也有的廠商試圖通過文摘資料庫，例如生物醫學領域的Pubmed、Biosis、Web of Science、Embase等等，補全文獻信息（最常見！）；也有的技術實力比較強的，直接識別、抽取文獻全文中的數據，也就是標題、作者、單位、關鍵詞、基金、參考文獻等等信息）
文獻管理的目的是為了高效的利用。我見過一些小夥伴即使沒有使用文獻管理軟體，文獻的本地存儲也做得「井井有條」——為啥子要打引號呢？因為我覺得他們實際是在追求形式上的滿足感：文件夾套文件夾，一層又一層，數量夠多時，花在思考「該把這篇文獻扔在哪呢？」比閱讀文獻的時間還長。而且，對於涉及話題較多，維度多，信息量大的文獻咋辦？你很難把它限定在某一個子類下邊——一維的、線性的文件夾式存儲會直接限制一篇文獻能給你帶來的價值，因為你在分類的時候就已經下意識的把它切割、打磨，以便塞到你的分類體系中了。如何儘可能完全地榨取一篇文獻的價值才是文獻管理的最終目的。

（我發現這麼寫下去沒完沒了了~以後再補充吧。下邊直奔主題，只談談我使用過的文獻管理軟體，當然也是偏醫學類的）

Readcube。力薦！界面優美、功能較全，最重要的是，基礎版本是免費的。他們的開發活動很活躍，基本每隔幾個月看一下他們的最新版本都會有驚喜。感興趣的話，下載下來自己研究一下，你會發現他們背後真的花了很多心思。他們不僅在文獻管理上做的很不錯，也在和出版商的合作上有許多創新（主要在文獻支付方式、交互閱讀方面）
Mendeley。之前和readcube一樣，是個初創項目，2013年抱到了Elsevier的大腿（當時被罵成open access運動的叛徒），基本的功能是都有的，可以嘗試，但是我覺得沒什麼亮點。
Endnote、Reference Manager、Refworks。Endnote大家都知道的，功能最全，最老牌，背靠湯森路透這棵大樹，乘涼很容易啊。這三者都是收費的，而且價格「都對得起出身」~
Zotero。我沒有嘗試過，只是簡略的看過，貌似主要是瀏覽器插件式的管理方式，對於在線發現、收集文獻應該很方便。參照評論區 @魚生臣和 @chao meng 的意見，後來發現Zotero是有Stand alone的版本的，可以安裝在本地使用。

以上的軟體貌似都有一個問題：對中文文獻支持很差（除了土豪Endnote做的稍微好一點兒）。當然，如果你基本不讀中文文獻，無妨。

國內的醫學文獻王、Notefirst、Noteexpress等等。推薦第一個！基本版免費，各種功能幾乎可以用應有盡有來形容，開發也很活躍（其產品經理是個大美女，哈哈~）。雖然叫醫學文獻王，但是用這個軟體管理其他學科的文獻也是可行的。另外，國產的還有CNKI的E-learning，也可以嘗試嘗試，這個軟體似乎在知識管理方面著力較多。

如果你真的想花時間仔細對比一下各個軟體之間的區別的話，Wikipedia的這篇文章是很好的開始：Comparison of reference management software

總之，大的原則是：如果你意識到以後要在「閱讀文獻的道路上一去不復返」，莫不如一開始就對自己需要涉獵的文獻進行頂層設計，不要等硬碟里亂成一鍋粥了再開始：

檢索（訂閱）、收集、整理、閱讀、標註、再利用等等——這個應該是管理使用文獻的完整流程，從這幾個角度去考慮如何設計自己的文獻體系。

檢索階段，要做到熟悉自己領域常用資料庫的檢索技巧、數據結構。說的這麼複雜，實際就是對資料庫文獻的元數據、組織形式做到心裡有數（例如，文摘資料庫一般都會提供標題、作者、期刊、摘要等信息）。實際文獻管理軟體在管理格式化的文摘（Abstract）方面是強項。直接向軟體導入檢索結果列表是最為高效的方式！真的需要看全文的話，再去獲取全文。
收集。承接第一條，從大型文摘資料庫獲取文獻是管理起來最為順手的方式：不管是通過RSS訂閱還是主動檢索，都可以嘗試——這個也可以算是主動、格式化地探究你感興趣的話題的方式了。
整理。對於收集到的文摘（文獻），勤於整理，絕不積壓：有價值的保留，無價值的直接捨棄，對保留的文獻建立主題屬性、文章屬性等等的標籤雲（Readcube支持此功能）。當然，如果你做到了收集的文摘基本都是來源於資料庫的，那麼這步就可以省略了：再傻的軟體也支持對格式明晰的文摘進行檢索，隨用隨查就行。
閱讀、標註、再利用就不多說了。（Readcube甚至可以對你在PDF內創建的批註進行檢索）

收集文獻不要貪大求全，染上囤積癖。對於自己的領域，要清楚核心期刊、核心作者（thought leader)、核心機構，有針對性、有選擇性的去收集高質量的文獻（這個話題會牽涉文獻計量學或科學計量學的內容，有興趣的可以了解一些基本概念，對於收集文獻、儲備領域知識、辨別前沿進展的效率是有提升的）

1. 網盤同步所有書籍和文獻，方便多設備閱讀，預防設備丟失。
2. 文獻用Mendeley管理，善用批註、筆記、文獻庫全文檢索等功能。
3. 搜集文獻時，我一般按照topic一次收集若干篇，下載每一篇時檢查作者個人網站/發表會議或刊物的網站，選擇最新版，如果有supporting material如代碼等，一併下載；掃描版的老文獻先做OCR再入庫，方便檢索；ps等非標準格式一併轉換為pdf再入庫。
4. 先說這麼多，有什麼想到再補充。。

補張Mendeley的截圖

最近才開始用的，簡直神器。之前都是pdf改名為論文title，扔網盤，然後想起要隨便翻點什麼話題的文章時，用Everything搜文件名，不過不支持搜文件內容。。

你去搜搜readcube這軟體，看看是不是你想要的？學術文獻管理PDF文件

不邀自來。

個人的理解，文獻閱讀分三個階段。

第一個階段是學習基礎知識的階段，就是你拿到一個新課題，首先要解決一些基本概念的問題，這個階段建議以讀中文博士論文為主，具體的方法同第二階段。

第二階段主要是分類和細節記錄。

分類的條目包括：要不要引用、可以引用到文章的哪部分、有沒有讀過和簡單的幾句話評價等。所以你需要一個分類完善的文獻管理軟體，我推薦Noteexpress。除了逼格略低於Endnote之外，NE有幾大優點：

1. 中文，操作容易上手；
2. 大部分學校購買有正版（請自己到NE官網查詢）；
3. 分類項目多於endnote，如下圖紅色部分均可以用於分類：

另外，可以加標籤，也可以設置多級目錄，也都是分類辦法。

而且你看到了，有影響因子，也可以加簡單評論。

當然，你要是說Endnote才是國際主流，我無話可說。

細節記錄方面，建議用docear，可以提取pdf中的注釋，具體用法請自行百度。

第三個階段是輔助論文撰寫。其實主要就是插參考文獻。當然，有些人會說Endnote對英文雜誌的引文格式支持更好。解決方案是學會自己調整參考文獻輸出格式，如果你有能力讀到研究生，這個應該不難。

歡迎大家關注我的微信公眾號（sci_coffee_break）或個人網站「讀思」（http://read-think.com），和我做進一步的交流。這裡不僅有更多關於科研的書籍的評論，還有關於科技論文寫作的內容。

可以去網易雲課堂聽中科大羅昭鋒老師的《文獻管理與信息分析》。文獻管理與信息分析（中科大2013秋網路班）

說說自己的看法
（1）文獻不再多，而在精，把重要的文獻徹底看懂；文獻歸類就做成文件夾放到電腦里就行了，真正把文獻看懂了，看進去了，很容易找到文獻的，你一頭霧水，說明很多文獻看得太潦草了；
（2）並沒必要利用什麼軟體什麼的保存呀什麼的，因為即使一個phd，他的真正研究方向是很窄，每個方向的核心文獻不過10篇。真正把這些核心文獻看懂了，文獻就在印在腦子裡似的，提到文章中哪個人，都可以很快想到他做的東西，發的paper
（3）實際寫sci 過程中發現，軟體提供的參考文獻雖然便捷，卻經常跟雜誌要求的不一致，最終下來還是自己敲進去；
（3）這是自己的切身體驗，與其將時間花在文獻歸類上，不如扎紮實實把需要的文獻看懂；

用Word 寫論文就Endnote，用latex寫就用BibDesk. 都很好用

當然必須是Endnote。

這是界面，左側是自己建立的分組，根據自己的需要把文獻分類到不同的文件夾，方便查找。
中間是文獻的詳細信息，可以自己標註重要程度，對最近要看的關鍵文獻進行標註。
最右是某個文獻的預覽窗口，可以放大來看，也可以使用adobe打開閱讀及修改。

這就是在endnote裡面閱讀的樣子。
最後呢，就是方便與word整合，如下圖：

word里可以加入Endnote，在Endnote讀完的文獻，想要進行引用，直接在這個選項卡下選擇Insert Citation，文獻就自動插入了，文章的最後會自動生成References，十分方便。而且也可以從word裡面直接選擇go to endnote，就可以打開軟體。
最後別忘了定期把Endnote保存好，這樣你在endnote裡面的所有文獻都能長期伴隨著您，方便查閱。

notexpress

可以用學術引文管理軟體，如EndNote, Reference Manager, ProCite 等。大多是收費軟體，有的學校實驗室會買給學生用。

免費的我最近在用Zotero，感覺很不錯，而且有瀏覽器插件，可以直接從學術網站上抓引文。注意只有引文，一般論文的PDF沒登陸是下不來的。解決的方法一是手動下載後添加，而是結合其他工具下載。如果有學校賬號和平板電腦（我窮人沒有平板，細節不明），我們師兄推薦有平板電腦的同學將Zotero結合Browzine使用，可以將學校賬號存在Browzine，查到文獻後不僅可以自動登陸看文獻，還可以導出到Zotero。Zotero的好處是雲存儲，你可以在多台設備上同步賬號。缺陷是免費雲存儲空間有限，文獻PDF的存儲路徑最好改為本地的，不然很快就滿了。

我的習慣是導入時選擇包括摘要和關鍵詞，導入後在「Note」之類的欄位下面做簡要筆記，並鏈接或者植入文獻PDF。這些軟體都支持關鍵詞搜索，當然不會搜索到PDF裡面的內容，所以文字格式的摘要、關鍵詞以及我們做的筆記就成為很重要的查詢線索。

另外谷歌學術和Elsvier等各大學術出版集團網站提供多種文獻導出服務，最常見的是RIS格式的，用各種引文管理軟體都能打開。谷歌學術在設置（setting）裡面有個Bibiography manager，可以選擇是否顯示導出鏈接。如果你想重新整理已經有的文獻，可以按文章標題在谷歌學術上搜索，直接點導出鏈接，用引文管理軟體打開完成導入，然後再嵌入搜集的PDF即可。

祝順利~

瀉藥
使用軟體：endnote x7
將不同文獻根據其主題分類，養成修改文件名和分類的習慣就行。改日上圖

為什麼我們往往對於每個日本小片子都在哪個盤哪個文件夾第幾行第幾列，哪一秒脫的bra哪一秒進入的正題都無比了解，卻不了解自己的文獻分布？

因為前者我們有興趣，而你電腦里大部分文獻，都是垃圾。

那就簡單說說我的經歷。對於閱讀我有一種偏執，只要鑽進一個點了就要把相關的一切文獻都閱讀完畢，這最直觀的後果就是家裡三個房間都被改成了書房。於是在這之後我改用電子閱讀。我可以清楚知道哪個盤哪個文件夾第幾行第幾個文檔有我要的資料。

什麼叫高效地查找文獻？

查找文獻不是百度前10頁有關文檔一股腦下載了然後塞某盤裡，完成任務拍屁股走人。

因為你需要用到時回頭來看，發現當時的自己簡直tooyoungtoonaive下載的都是什麼鬼，明明當時一鍵可以刪除的無效內容全部在電腦里爛著。

試試這個辦法吧：
拿你下載第10頁文檔的功夫，把前9頁已下載的文章粗略瀏覽一遍，重複的或你已知內容大刀闊斧地刪。沒什麼好心疼的，反正咱大天朝下載東西免費。

就當作在刪減我們心愛的島國小片子，什麼前戲啊什麼美好鋪墊啊刪刪刪。然後精華部分你要是想省著給以後看，你也大概知道這部分是什麼橋段情節，下次興緻一起，精準定位。

祝po主擼得愉快。

看完就扔，剩下的叫做修養

endnote呀，不僅可以分類儲存文獻，還能在寫文章時自動添加參考文獻到word中。
ps：可去小木蟲下載破解版。

印象雲筆記，有道雲筆記，各種雲筆記

在國內的話，用 CNKI E-Study

不求多，一個小方向里總結出10篇就行了。至於怎麼管理，當讓是自己發表論文，文獻就會在參考文獻了。另外，google scholar 有個save 功能也不錯！

我覺得Endnote不錯。而且寫文章的時候添加參考文獻相當方便！