如何將DNA進行絕對定量？

如題所說，目前絕對定量比較好的方法為定量PCR或者核算蛋白標定儀。前者試驗操作的要求很高，很容易出現拷貝污染；後者獲取的DNA濃度，但可能包括雜質或腐殖質類物質的干擾。總之，目前DNA絕對定量是非常難的，成本和要求都比相對定量苛刻很多。而且若是想知道一個樣品中原核生物和真核生物的絕對量多少也不實際，引物設計等一系列的因素導致即使定量PCR方法也不能做到絕對的定量。那麼，我們永遠都找不到一種能對DNA進行絕對定量的方法嗎，或者我們還需要多久才能克服這些困難？

首先想確定一下樓主說的DNA絕對定量指的是？

定量PCR，是分析某個樣本中特定序列的數量。比如cDNA中某個片段的拷貝數。

核算蛋白標定儀，如果這個指的是Biophotometer，測A260,A230,A280的話測的是DNA濃度，也就是說不管什麼片段，不管什麼長度，測出來的是總的DNA含量。

如果說第二個，我現在想不到更好的方法，市場上有精度更高的NanoDrop儀器，也就是精度更高，原理是同樣的，基於DNA在260nm和280nm波長吸收的峰值比來算的，至於樓主說的雜質，更多的是從DNA提純的技術來解決的。你測的濃度準不準，在於你提純做的怎麼樣。

如果說的是第一個，那麼目前技術已經有了，也就是Nanostring。測得的是樣本中特定序列的拷貝數。注意是直接的測量而不是像定量PCR那樣通過Ct值來推算。
（聲明：以下答案來源均來自NanoString Technologies, Inc. 如果有版權問題請聯繫我刪答案，本人和NanoString Technologies, Inc.沒有任何利益關係。）

這個技術和基因晶元的概念類似，是通過晶元上的一個捕捉探針(capture probe)來捕捉你想測量的序列，（捕捉是通過鹼基互補配對）。捕捉以後，會加入一個標記探針(reporter probe)，這個標記探針也會互補結合你的目標序列。結合以後的效果如下圖：

如上圖所示，Reporter Probe後面連了一個條形碼(Barcode)目前這個條形碼是六位，每個位置上有四種熒游標記物的選擇，為了保證儀器能夠更好的識別這個條形碼，這個公司目前的廣告是說一次可以同時測800個序列的拷貝數，實際還有更大的擴展空間。

那麼都結合上了以後接下來怎麼辦呢，因為DNA帶負電，加上一個電場以後，因為捕捉探針是連在晶元上的，這些序列就會朝正極躺好，然後掃描一下，機器自己讀一下有多少條形碼就知道樣本里實際的拷貝數有多少了。

就像這樣：

最後補一張Nature Biotechnology封面的實際效果圖：

這個技術的好處是有多少拷貝數是一個一個數出來的，不是通過擴增的信號推算的。不會引入誤差。