轉基因作物是否會破壞生態平衡？
非專業人士，問題可能不嚴謹，請見諒。
轉基因作物會不會因為其強大的生存能力而破壞掉所在地區生態平衡？
這與常說的物種入侵是不是有本質上的區別？
如果有，能不能得到解決？
PS 換用另外一個詞解釋：GM作物污染
有可能。
事實上轉基因生物可能通過遺傳物質交換造成基因污染，自身擴散出去的可能性不大。因為轉基因作物和其他作物一樣是為了人類的農業體系培育出來的，在野生環境下生存力很低。造成生物入侵的可能性不大。
但是轉基因生物的遺傳物質可能通過花粉等方式和其附近的野生親戚雜交，從而把自己的遺傳物質擴散到野生環境中去，形成基因污染。這時候野生親戚的後代有可能獲得強大的生存能力而破壞生態平衡，形成類似物種入侵的現象。
「轉基因」這個概念太寬泛了，沒有任何理論禁止轉基因作物可以有這樣的能力；但除非刻意為之，大部分轉基因作物肯定沒有這麼強的生存繁殖能力。作物抗病蟲害只是一個優勢，其對光、水、肥的依賴跟野草仍然有極大的差距。再說，基因也是「轉」來的，不是憑空製造出來的，不至於出現什麼逆天的能力。
作為一種農作物，首要考慮的是供給人食、用，必然有大量的資源用於人類需要的結構上，這就決定了其在自然界的競爭中處於極大劣勢。上萬年的農業史就是一面努力提高植物的可利用部分、一面努力的減小作物的生存劣勢。和雜交、輻射等育種方式相比，轉基因是一個不錯的手段，但是至少目前來看距離把這個劣勢縮減為0還有相當大的距離。這個風險是值得防範的，就像開車要防範交通事故的風險一樣。
雖然不是做轉基因的，但是怒答。
為防止反轉人士看到這種問題後引起精神緊張、全身痙攣、幻覺、譫妄、怕光怕聲怕水怕風等癥狀 ，先表態：
核物理的發展不會滅絕全人類，但是亂用核武器的政治家可能導致末日。
轉基因技術不會破壞生態平衡，但是亂用轉基因技術可能破壞生態平衡。
首先，轉基因作物如與起源的野生種同在一個區域內時，該作物中的轉基因會轉移的野生種中。如果一種野生植物被一種轉基因或能抗拒病蟲害的其它基因提高適合度的話，這種植物就可能變成極壞的害草，或者破壞自然植物群落的生態平衡。
但是，「生態平衡被破壞」這種詞語經常被媒體曝光，生態系統是一個動態平衡的過程不假，但「破壞」這兩個字就帶有人類的感情色彩而非客觀評價了。
破壞生態平衡，廣義上是指生態平衡的改變，生態平衡是指在一定時間內生態系統中的生物和環境之間、生物各個種群之間，通過能量流動、物質循環和信息傳遞，使它們相互之間達到高度適應、協調和統一的狀態。然而這種平衡是長期的地理環境及生物物種競爭的最終結果，不是上帝規定的！所以生態系統平衡因為地理環境、生物物種的變化而變化是完全正常的，自然的。而人類，從伐木墾田起一直在進行著對生態平衡的改變，即改造世界。
狹義上講破壞生態系統是指，生態系統的改變，不利於人類活動，違背人類利益。從這個角度出發，人類的所有活動都「可能」破壞生態平衡，關鍵看度：祖先狩獵以果腹使人類文明發展至今，而過度狩獵可以滅絕全世界數量最多的鳥。(北美旅鴿_百度百科)
所以，綜上所述，廣義的破壞生態平衡從河姆渡人開始(河姆渡人_百度百科)就一直在做了；狹義的破壞生態平衡，則是"度「的問題。
因而題主的問題：轉基因作物是否會破壞生態平衡？
答案是：轉基因作物有能力破壞生態，可能會破壞生態平衡，但到底是否會取決於實際情況及掌控技術的人。
任何密集種植都會導致破壞地區生態平衡，甚至會導致出現生態災難。而且，密集種植的作物相當脆弱，一個病毒都有可能導致大面積的死亡。
答案是會的，肯定會的
但是這不是我們要反對的原因
因為生態平衡的概念本來就是錯的
生態系統從來就不是平衡的
如果生態系統是平衡的，就不會有進化，不會有人類，不會有今天的社會
如果量化的計算，轉基因物種給生態帶來的改變遠比物種入侵小
人類都組織不了物種入侵，那為什麼要著眼在轉基因帶來的改變呢？
事實上人類一直在改變著生態環境
從物種的角度來說，我們吃的大部分水果，蔬菜，甚至肉類都不是原產於中國
每引進一種新的物種都會帶來生態的改變
那麼你吃番茄，土豆，玉米的時候有認為這是在破壞生態么？
農耕範圍的擴大，技術的提高，化肥，農藥的使用無一不是在改變生態
可是使用這些東西之前我們考慮過對生態的影響么？
當然是有可能的。
應該說這大概是轉基因技術大部分意義上唯一的風險所在。但是這種風險與一般意義上的物種入侵不同，因為就目前而言，轉基因作物主要著眼於對產量的提高和對人工環境的適應性。也就是說，你看那些轉基因植物在田裡拽得不行，拉到野地里估計就歇菜了。
真正的風險在於基因污染。人工的將不同科、不同目甚至不同綱的基因引入到植株中，一旦通過自然雜交的方式傳播到其他親緣族種，引起的後果可能會是災難性的。
比如說將抗病抗蟲抗藥基因轉入到禾本作物中，一旦其與狗尾草之類的植株雜交，得到的將是抗病抗蟲抗藥的狗尾草；如果這種狗尾草長得滿地都是。。。
對於自然界來說，「轉基因」和普通基因沒有任何區別，優勝劣汰適者生存。至少目前來講，人類也沒有創造出什麼新基因，「轉」字已經說明了基因來源：從原有物種中轉來的。所以題主顧慮的問題要麼就不會發生，要麼就早就發生了……
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