乳腺癌基因檢測準確嗎?安吉麗娜朱莉的醫生說她有 87% 的患癌幾率是怎麼算出來的?
我想第一個問題,問乳腺癌的基因檢測是否準確,大概是想知道,真的就能通過基因來預測癌症嗎?
只要檢查的機構合格,基因檢測技術肯定是可以信賴的。BRCA1基因和乳腺癌、卵巢癌的高相關性,是上世紀90年代的一大發現。
乳腺癌是遺傳+環境多因素致病的惡性腫瘤,但是BRCA1和BRCA2基因,是和乳腺癌高相關的,尤其是和家族遺傳性的乳腺癌高相關。
BRCA1是一種抑癌基因,和原癌基因一樣,每個人都有,編碼在17號染色體。原癌基因和抑癌基因,通俗點講就是,原癌基因讓細胞不停的分裂,抑癌基因阻止細胞分裂,兩者達到平衡。當原癌基因突變,造成細胞不受調控的瘋長,或者抑癌基因突變失活,不能抑制細胞分裂的時候,就得癌了。
前面說了,乳腺癌是遺傳+環境多因素致病的,所以,BRCA1基因突變和乳腺癌是不能劃等號的。BRCA1突變=乳腺癌,就意味著得了乳腺癌的人都有BRCA1突變,BRCA1突變的人都得乳腺癌,事實上顯然不是那麼回事兒。
即使是家族遺傳性的乳腺癌,也大部分不存在BRCA1的突變;反過來,BRCA1突變的人,則大部分都會得癌。
那麼就有了第二個問題,這個87%是怎麼來的?
先說說什麼是發病率,發病率就是某段時期內,某地區內得了這種毛病的人佔全體人口的比例。比方說某年某市有300個新發病的乳腺癌,該市這一年的平均人口數是30000人,那麼這個市乳腺癌的發病率就是1%。
那麼BRCA1突變患者乳腺癌的發病率呢,就是找到BRCA1突變的人,然後看看這些人里有多少得了乳腺癌。這其實就是用樣本代替總體的統計方法。一般認為這個發病率在50%-85%。有一篇1994年發表在《柳葉刀》上的文獻,研究了33個乳腺癌遺傳的家族,得到BRCA1突變患者,到70歲乳腺癌的累積發病率為87%:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/7907678
至於發現BRCA1突變的下一步處理,一般有三種:加強監測、預防性用藥和預防性手術。預防性用藥有一些相關的副作用。預防性手術,獲益和風險評估現在還沒定論,畢竟突變不等於得癌,這還是沒有得病而做手術,其實就是對以後得癌的顧慮和手術的顧慮之間的權衡。不過對於35-40歲以上,已經無哺乳要求的女性,可能還是有所幫助的,手術後,乳腺癌患病率明顯下降,文獻報道下降90%。特別是加做乳房重建手術,對於女性切除乳房後的心理影響也得到很大緩解。
最後說一句,安吉麗娜朱莉的做法,我個人表示敬佩。作為一個公眾人物,敢於公開個人隱私,以喚起廣大民眾對健康的關注,真的很酷!
====================================================================看到@牟小岔的回答,這其實是對於遺傳疾病的推算。而乳腺癌,即使是家族遺傳性的乳腺癌,也不能算作嚴格意義上的遺傳疾病,因為它有環境因素影響。具體的,以後如果有時間再詳細解釋。
茱莉進行的這項檢測,BRCA1 突變,和乳腺癌的關係是非常清楚的,檢測也非常容易。只是在美國目前受專利保護,所以測起來很貴。她所攜帶的 BRCA1 突變簡單地說是破壞了 BRCA1 基因修復 DNA 雙鏈損傷的能力。帶有這種突變的人患乳腺癌的概率大大升高,平均約為普通人的五倍(普通女性約為12%,BRCA1/2突變女性約為60%。 BRCA1 BRCA2: Cancer Risk Genetic Testing)。
這些概率都是所謂的 Life time risk,也就是說一個人在有生之年被診斷出這種疾病的概率。計算方法我覺得一般人也沒有必要知道。實在一定要了解,這裡有詳細的解釋,還有 Excel 的計算模板:Lifetime risk of cancer : Cancer Research UK
還要說的是,乳腺癌目前所知真正影響很大的基因突變不多,BRCA1/2 是特例,在人群中的比例並不高。如果不是有這裡(http://cancer.stanford.edu/information/geneticsAndCancer/types/herbocs.html)提到的幾個因素之一:
1,50歲之前被診斷出乳腺癌
2,家族有雙側患乳腺癌或子宮癌病史
3,家族有男性患乳腺癌的歷史(沒錯,男人也會得乳腺癌)
4,德系猶太人血統 (Ashkenazi Jews)
那麼一般來說患遺傳性乳腺癌的概率不大。茱莉之所以會做這個檢測是因為她媽媽在五十歲之前就被診斷出乳腺癌,檢測的結果證明她確實也有 BRCA1 突變,患癌概率遠高於常人。
對於非遺傳性的乳腺癌,我個人認為現在做基因檢驗的意義不大(當然,常規年檢還是很重要)。主要是現在研究進展緩慢,我們對乳腺癌中發生的基因突變了解太少。這個問題我和其他知友也有過討論。詳見:哪些病具有比較明顯的遺傳特性,但大多數人都不知? 我的觀點依然未變:很多疾病,如乳腺癌的發展過程有 Genetic 的成分在,也就是說 DNA 發生了相應的改變。這些改變並不一定是從父母遺傳 (inherited) 的,但這些 DNA 突變一樣增加疾病風險,及早檢測對預防/診斷/治療有益。只可惜目前我們對大部分突變了解太少,就算檢測出來了一堆突變,也不知道是什麼意思。但我相信將來研究進步了,做基因檢測將會成為診斷的常規步驟並發揮重要作用。
其他資料:
Wiki: BRCA1
各種癌症的患病風險: Lifetime Risk of Developing or Dying From Cancer
A1. 檢測基因突變的技術上已相當成熟,因此jolie在國外花了3000美元得到的檢測結果基本上沒什麼值得懷疑的。
A2. 患病的概率,是根據以往的臨床科研/流行病學報道,大致上就是檢測了許多人的BRCA1/2基因序列,然後統計這些人的患病概率。詳見:http://www.cancer.gov/cancertopics/factsheet/Risk/BRCA
PS:Jolie算是給基因檢測做了大廣告,據說咱中國的醫院已應廣大女性的熱線電話開始推出這一服務。檢測基因的突變技術上沒有問題,手續上是有疑問的,畢竟算是臨床檢測的事。另外,患病概率的推算是需要依據咱中國人的流行病學數據的,即使和jolie一樣的BRCA1基因突變,概率或許是不一樣的。
補充一點吧。
通過測序來判斷乳腺癌發病機率的準確率,對於不同的人群來說是不一樣的。像 Julie 這樣的,因為有確知的重要變異,準確率是很高的。也就是說,算出的患癌幾率越高,越準確。但幾率低了,可能不準。
隨著樣本的數量高速增加,這個只能越來越准。像 Memorial Sloan-Kettering Cancer Center,一年就測序了上萬人,絕大多數都是乳腺癌患者。
另外,乳腺癌的預測開始熱起來,也是因為有預防的選擇:乳腺切除術。
這個也是現在醫院投資的熱點:病人的錢要掙,健康人的錢也要掙。
對於大部分的所謂的致病基因變異,其實醫學現在沒有什麼有效的辦法,檢測半天,只是徒增煩惱。像 Watson 這樣的人,把自己的基因序列公布時,就把一些關鍵片斷給去除了。因為之前 Craig Venter 興沖沖的宣布公司測出的第一個人類基因組序列其實就是他自己的。然後有人發現,他有一個 APOE4 的變異(意義可見 @趙小達 的回答),然後,也沒哈辦法,只能吃些據說會有用的葯。基因檢測是通過對個體進行基因測序得到個體是否攜帶某種疾病的風險基因或直接得到個體的全基因譜,和家族史關係不大,而風險基因是通過大量統計得出的。比如:apoE基因位於19號染色體,主要有三個亞型,apoE2、apoE3、 apoE4,而apoE4則是已確認的阿爾茨海默症的高風險基因。確認過程是研究者通過大樣本的觀測統計,發現攜帶者(apoE4型)比非攜帶者(apoE2/3型)患阿爾茨海默症的概率要高出3-4倍,那直接測量個體apoE基因的亞型是否為apoE4型,就可以得出其患病的概率。當然,基因和疾病的具體機制可能還尚未完全明確,但已經很有指導意義。
@牟小岔理解的演算法是按照父本、母本··· 的表現型去推測基因,然後再去推算概率,當然效率比較低,可行性也不高。
現代科技的做法是直接對要推算的個體進行全基因測序,再通過基因去計算概率。這樣做的前提是要知道一些疾病與基因的相關性。目前來說,知道這種相關性的疾病還太少。 當這個數據積累到足夠大的時候,就可以發揮很大的威力。想像一下,有一天,當你出生的時候就給你做基因測序,測序完之後就計算出你患各種疾病的一個概率 。你根據這個概率來知道自己的生活方式,避免各種疾病的發生。 還是蠻cool的一件事情。
現在已經有這樣的公司在做這樣的事情,比如華大基因,23ANDME 。
這種預測概率一般來自於一些文章,文章主要的內容是觀察病例和對照的基因型,統計基因型和表型的相關性。如果每一次這樣的相關性觀測(每篇文章)可以叫做一個證據,那麼把證據放一起綜合評估,可以得到更加客觀的結果,有些文章就是這種綜合評估的文章。綜合評估需要一些更加專業的統計學工作,這些工作可以引申為演算法。
這個87%基本上是從這樣的文章得來的。具體文章鏈接請維基百科BRCA1。
另外,BRCA1和2在美國是受專利保護的,其他公司什麼的基本上不能測也不能開發相關估算方法,這些你也能在維基百科裡讀找到。美國境外這個專利基本上就很難落實了。這就是為什麼朱莉做這個要3000刀+。不過,2014年這個專利就到期了。只評論第二個問題:86%是怎麼算出來的。
這是個典型的條件概率問題(貝葉斯問題)。
86%指的是:在以觀測到致病基因的情況下,發病的概率。
用概率形式表示:這個概率就是: P(Cancer | Gene)
給據貝葉斯定律:
P(Cancer | Gene)
= P (Cancer Gene) / P(Gene)
= P(Cancer) × P(Gene | Cancer) / P(Gene)
= 全部人群發病率 × 發病人群中出現該基因的比例 / 該基因在全部人群中出現的比例
寫的基於gail model的 乳腺癌風險評估計算器, 歡迎試用 :)
說個與話題相關的回答吧,基因檢測目前普通人也可以辦到,google聯合創意人老婆辦的23andme,就可以以199-299刀的價格給普通人做測試,2008年獲得了Times時代雜誌年度發明獎項頭名。
基因檢測有靠譜的,有騙錢的。去美國FDA查看獲得批准的檢測項目,都是有臨床證據的,靠譜的。國內大多是基因檢測公司都是不靠譜的噱頭。尤其是患癌症後,靠基因檢測來判斷耐葯的檢測,大部分都是騙錢的,喪盡天良
不必故弄玄虛與故作神秘。朱莉的乳腺切除到底怎麼回事,還沒有什麼詳細確切的信息。不排除又是什麼利益相關力量某種公關關係的運作。 她到底是切除了整個乳房? 還是切除了一部分乳腺? 沒有人確切知道。 按理,即便知道了基因水平上傾向於乳腺癌發病機率高於常人平均水平,正確的醫囑應該是建立防範意識,合理安排觸診,鉬靶,腫瘤指標檢的 頻率。
任何人,包括朱莉,只要切實做到這些注意事項,即便發生乳腺癌,也能做到早發現早治療。大體上,乳腺癌早期能夠發現,不要說保住生命,連保乳都是有足夠統計數據證實是可行的可操作的可保障的。 所以,朱莉乳腺癌事件,在專業人士看來,應該是可笑的,是具有公眾誤導性的。
定期照圖自檢。提早預防乳腺疾病,
看豪斯醫生時,根據家族病史和自己的基因檢驗也是能提前查出自己會得阿茲海默症或是其他疾病滴,相信是有科學根據的檢驗得出的結論。
武漢 理工的吳志鵬弄的利用電磁波檢測乳腺癌,據說很方便。
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