下載的 PDF 文獻應該如何命名？
科技文獻的標題大多很長，不適合做文件名，那應該如何命名才能一目了然讓自己知道是哪篇文獻呢？
用文獻管理軟體啊。。完全沒有搜索，命名的問題了~
我用的是Papers，聽說Mendeley也不錯不過我不熟悉，期待用過的人來說下。
點開只要有許可權就直接可以下下載到Papers裡面，所有元文件比如題目作者發表日期雜誌頁數都在的，需要引用的時候直接從軟體里拖出來
點開只要有許可權就直接可以下下載到Papers裡面，所有元文件比如題目作者發表日期雜誌頁數都在的，需要引用的時候直接從軟體里拖出來
eg:
Malone and Hannon. Small RNAs as guardians of the genome. Cell (2009) vol. 136 (4) pp. 656-668
不過我不確定這個軟體Windows有沒有，而且全功能版本是付費的。
Mendeley是免費的而且口碑很好，可以試著用下~
下個好的文獻管理軟體吧~~不要想著命名的問題了，這種複雜的事情交給電腦就好了！
果斷使用Noteexpress啊，在校期間一般使用正版都是沒有問題的！因為大部分學校都購買了 Noteexpress 的集團版！而且其實買一個也不貴。
文獻管理軟體自帶的按照不同欄位（年份、作者、標題、期刊名）排序的功能基本上保證可以在較短時間內找到需要的文獻，實在不行的話還有搜索功能。另外，NoteExpress中還有給條目貼標籤的功能，用好這個貼標籤的功能，為自己看過的文獻貼上「主題」、「方法」等標籤，是最自由且最強大的管理。
Noteexpress里有一個批量命名文件的選項，不過我感腳既然已經用上了文獻管理系統，文檔的文件名到底是什麼其實並不重要了啊！
個人沒使用過其他的文獻管理軟體，這種軟體基本上適應了後要換起來就特別麻煩，而且往往要到文獻數量達到一定的量級時才能比較出幾個軟體各有的優勢來。所以正確的使用方法是「要慎重選擇」。。。我的答案是：使用mendeley文獻管理軟體的自動歸檔和自動重命名功能，將文獻重命名為「年份-題目-作者」格式！（格式可以自己組合和增減）
首先要做一個選擇：手動重命名還是自動重命名，我推薦後者.
一方面，如果大量pdf的手動修改很麻煩；另一方面，以後新下載的pdf，也可以自動重命名成預期格式。
工具：文獻管理軟體mendeleyFree reference manager and PDF organizer
步驟：
1. 新建一個文件夾作為監控文件夾（watched folder），需要重命名的pdf和新下載的pdf都扔在這裡面，需要注意科研文獻是標準格式/有頁碼的pdf。
2. 在mendeley中，監控以上設置的文件夾。
3. mendeley中，設置——「file organizer」中，選擇重新組織pdf，然後選擇重命名後的pdf的保存位置和命名格式，我的推薦重命名格式是「年份-題目」
4. 這樣，你下載到「監控文件夾」中的pdf，就會被mendeley重命名到新的文件夾中。當然監控文件夾中的pdf，你可以直接每隔一個月/一個星期清除一下。
另外既然pdf命名規範了，查找起來就方便了，贈送一個小軟體：（下面的文字就是之前的答案）
window下的快速搜索工具：search everything，知乎上的推廣好像比較少
來自@張玉新的介紹：Everything:速度最快的文件名搜索工具（201306更新）
所以，我的解決辦法就是：
1. 所有的pdf文件都下載到一個文件夾中，命名格式就是「發表年份-題目」。
例如「2014-Photoresponsive polymer nanocarriers with multifunctional cargo」，如果題目中有：和/等無法使用的符號，則刪掉該符號即可。
自動重命名就是上面的回答
2. 打開search everything，直接檢索題目（一部分題目信息即可）
檢索效果見最後的圖片。
可以設置F4為調用search everything的快捷鍵。
PS1：2014年7月19日修改，發現之前的回答和問題有些角度不對應。
PS2：2014-11-20，刪減文字
如果是學術文章，Google Scholar已經幫你命好一個簡明、清晰的文件名。具體如下。
比如文章《Phone-level pronunciation scoring and assessment for interactive language learning》，在Google Scholar中搜索到，然後點擊「Import into BibTeX」，如下圖所示：
如果找不到「Import into BibTeX」選項，可以到Google Scholar的Scholar Preferences中設置，在Bibliography Manager一欄中選Show links to import citations into BibTex，再次搜索就可以找到「Import into BibTeX」選項了。
如果找不到「Import into BibTeX」選項，可以到Google Scholar的Scholar Preferences中設置，在Bibliography Manager一欄中選Show links to import citations into BibTex，再次搜索就可以找到「Import into BibTeX」選項了。
Import into BibTeX會返回類似這樣的內容，可以看到包括了各種信息，其中最重要的是索引名，比如這篇文章的索引名就是：「witt2000phone」，如下圖所示：
這個索引名就是你的PDF的名字了。然後需要把這段bib文本複製粘貼到一個擴展名為bib的文本文件中。所有相關的PDF文件的bib信息都要貼在這個文件中，以方便今後查找。
首先@孫尉翔一下，zotero不是zotera。我無意對別人所用的工具說三道四，也不想鼓吹自己的workflow多麼牛逼，但是如果你有如下需求中的一個或多個，那麼我的答案可能對你有幫助。當然我推薦的工具是zotero，mendeley也不錯。
需求：
1、跨平台（windows，linux，mac）
2、多地同步（資料庫、pdf附件、網頁快照等）
3、集中自動管理（各類信息用資料庫，pdf、網頁作為附件）
4、多瀏覽器支持（chrome，safari，firefox，bookmarklet）
5、MS Word、Libreoffice支持、bibtex導出等
6、小巧簡潔，不需要雞肋功能如pdf查看編輯等
7、作為知識管理工具
8、最好免費
我不打算長篇大論，所以基本的教程就推薦以下這三個，不贅述：
肉特柔微型使用指南
[原創Zotero系列教程之一]基本功能和安裝 ? 豬在笑
文獻管理軟體zotero的一點使用感受
再說說我自己使用zotero的工作流：Google Scholar（或其它任意文獻搜索下載站點）——找到需要的文獻頁面——瀏覽器插件導入文獻信息、pdf附件（如果有下載許可權）、快照（對於網頁）——整理搜集的文獻（刪除沒用的、記閱讀筆記、標註pdf）——導出bibtex或者MS Word插件插入引用文獻——搜索文獻（metadata、文件名、文字pdf內容、筆記）。
zotero使用中的小技巧：
1、zotero支持profile，你可以把zotero的數據文件夾任意遷移
2、中文文獻style見這裡Zotero Style Repository，搜索chinese std
3、安裝pdf2text和pdfinfo對pdf文件支持更好
zotero並不完美，起碼現階段我使用中有以下問題會困擾我（不過這不妨礙我給它打5星好評）：
1、筆記不能包含本地或附件圖片。此點刪除，是我土了，見 Zotero Forums。這個問題一解決，更堅定了我對zotero的信心和好感，發個「全景圖」慶祝下：
看上去已經非常完美了，metadata、pdf附件、富文本筆記、原始鏈接信息完全用一個條目搞定。
看上去已經非常完美了，metadata、pdf附件、富文本筆記、原始鏈接信息完全用一個條目搞定。
2、對國內某幾個學術站點支持不完美，比如不能自動下載pdf（主觀上我認為是這些網站的問題），見為何知網的數據無法導入zotero？。
3、文獻條目的管理不夠直觀，尤其是重複條目。（待研究）
最後回答題主的問題：
很多回答包括我的都在闡述如何用軟體來管理文獻，和題主的思路顯然是不一致的。如果題主堅持用簡單、相對原始的方法來管理文獻，即下載pdf——關鍵詞命名——doc文檔做筆記——文件夾目錄做分類——windows內容搜索+文件名搜索，我相信也可以達到做好科研的目的，這個問題我感覺@張俊博的回答最切題。不過我相信多掌握一個漂亮的工具，對真正有志於科研的人而言肯定是如虎添翼的。如果你用熟了zotero，它可以快速根據metadata重命名pdf附件，這樣方便發給別人共享，如@zhangxunnj所回答的，命名格式形如：
Takens - 1981 - Detecting strange attractors in turbulence.pdf
Kim et al. - 1999 - Nonlinear dynamics, delay times, and embedding win.pdf
張五常 - 2000 - 佃農理論.pdf
其中第二個因為論文名過長自動丟棄了。我沒有找到怎麼更改命名格式的選項，但是我想這個自定義並沒有那麼重要，因為有更強大的搜索（metadata+pdf內容）
沒怎麼進行命名，直接導入文獻管理軟體中看的。
作者名-做什麼用-雜誌略名+出版年
居然沒有人提到Zotfile！zotero裡面的插件，自己設置各種命名規則，不能再好用了，唯一遺憾的是命名通配符里沒有DOI的通配符。在zotero的網站上有將PDF以DOI命名的方法，但是好像也改代碼比較麻煩。唯二遺憾的地方是不能使用通訊作者來命名，我是希望以第一+最後作者來命名，這樣識別度很高，一看就知道是那個實驗室做的。
貼一下我的命名規則：年 第一作者 Title，控制到60個字元辨識度還可以很少會有重名的，除了那些一個系列的文章。
年份-期刊名（熟悉的就用縮寫，不熟悉的期刊就用全稱）-文章名
mendeley管理
everything搜索
mendeley對中文文獻支持不好。不過我基本不看中文文獻，所以問題不大
把前面的回答全部看了一遍，發現好幾個人回答問題時的重點走偏了，成了介紹文獻管理軟體的。其實，提問者的意圖很簡單，就是命名PDF文件。
對於這點，我曾經摸索過好幾種規則，推薦以下命名方式：
期刊名（英文期刊用縮寫）_年份_（可根據喜好是否加作者名）_標題（可按主題詞縮寫，建議大部分保留原標題）
這樣的好處在於：
1. 很容易根據不同期刊分組，因為不同期刊本身就有檔次、學科、論文偏好上的區分，這樣更利於組織和後續的查看
2. 當需要找某篇文章時，只需大概記得出版年份或者期刊就能通過快速瀏覽找到
P.S. 我也用文獻管理軟體，比較了endnote、mendeley、notefirst和Noteexpress之後，我選擇了Noteexpress，界面是差了點，但功能都有，用起來順手。我一般不會用NE提供的自動重命名文件功能，貌似它只能按照論文的標題信息進行重命名。
手頭有幾百篇PDF文獻，是寫博士論文留下來的。命名格式也是一個老師傳授給我的。就是LS某位知友所寫：
年份_期刊縮寫_文獻題目.pdf 壞處就是太長了，有些甚至超過windows文件名長度限制。
需要管理成百上千篇文獻的醫學狗不請自來怒答一記！
個人習慣下載文獻以文獻標題命名，然後導入到Endnote里，然後文獻的pdf就可以直接刪掉了，其實導入這類文獻管理軟體的話命名什麼的都無所謂，以標題命名也只是怕萬一萬一導入出了問題方便找到出問題的那篇。
去網上搜下Endnote視頻教程，大概一小時左右就能完全上手，特別便利。而且Win Mac iPad版都有，可在線同步。
媽媽再也不用擔心我的文獻啦啦啦。。。
author-year-title
前面答主的方法都挺好，但題主是詢問下載的pdf文獻如何命名，鄙人覺得，雖然各類文獻管理軟體固然優秀，但回答重點應該放在「命名上面」；而且，在進行文獻轉移的時候，直接拷走pdf也方便快捷。
對於英文文獻，我一般是[中/英/碩/博+年份][標題][重申年份+期刊]，例如：
[1999]High resolution radar clutter statistics[1999 IEEE Trans. AES].pdf
因為本專業一般主要重點放在英文文獻閱讀上，所以英文文獻我通常不會特殊標明，但會特彆強調期刊名稱，如上例中[1999]不標明是英文，IEEE Trans. AES是期刊名則會重點強調。
如果是中文、碩博學位論文，我一般是[中/碩/博+年份][標題][作者（可省略）]，則如下
中文期刊：[C2009]基於雷達回波相關特徵的海雜波抑制方法.pdf
碩士論文：[S2014]廣義Gamma分布的參數估計.caj
博士論文：[B2006]地_海雜波建模及目標檢測技術研究_姜斌
其中，C代表中文(China的首字母)，S代表碩士（拼音shuoshi的首字母），B代表博士（拼音boshi的首字母）。
以上。感謝閱讀。
特別浪的表示並沒有用任何文獻管理軟體。
分別按需建立文件夾後，把下載的文獻按標準引用格式命名期刊名縮寫+年卷頁碼，
然後再加上小軟體everything用來快速查找，完全夠用了。
#基本上只有記得大概文獻內容和文獻時間，可以很快速定位
#PS：要是綜述，就加上一個全文標題到pdf的命名里，簡直方便。
1 Rename
-Set rule for rename
Project.Date.Name.Tag.pdf
-For Journal papers
Index by Zotero
Zotero get metadata
Rename file with metadata
2 Search
3 Review Clearance
$$
Now I don"t think there are so many pdf files I need to save, we can find 99.99% of files we want by internet.
The 0.01% of metadata and my own ideas are far more valuable.
用bibtex管理吧，或者用關鍵詞加下劃線命名~
出版年-雜誌略名-標題（這個不是最一目了然咩）-作者名（如果這個名字反覆在你的timeline出現）
文獻用 閱讀後標註高亮，然後扔進印象筆記 ，然後加上 TAG，然後要用的時候搜索關鍵詞。。會出來一大串有你筆記的文獻。簡直是量身定製。PS：vip 的印象筆記用戶支持離線支持 PDF 全文搜索。。顫抖吧你們這幫全英文的軟體！我恨你們的不友好
Mendeley導入加DOI識別自動命名一鍵完成，感覺比zotero方便了。還有雲端多平台共享和ios客戶端，畢竟被邪惡的elsevier收購後財力雄厚啊。
壞處是在學術圈不用開源軟體逼格太低。
Import citations into your library using the Mendeley Web Importer
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